伴生细菌论文_秦嘉玲

导读:本文包含了伴生细菌论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:细菌,线虫,多样性,文库,松材线虫,宏基,基因。

伴生细菌论文文献综述

秦嘉玲[1](2017)在《蛋白结构完整性和松材线虫伴生细菌对Bt杀线虫活性影响研究》一文中研究指出松材线虫病(Bursaphelenchus xylophilus)是一世界性的检疫性病害,已经对我国造成了巨大的经济、生态损失,严重影响森林健康和生态安全。cry5Ba3Φ是本实验室从苏云金芽孢杆菌zjfc85上克隆得到的毒蛋白基因经密码子改造而来,其编码的毒蛋白对松材线虫毒杀活性已被证实。为进一步明确该杀虫蛋白结构与毒力功能的关系,本研究设计Cry5Ba3Φ蛋白结构突变缺陷型转灰葡萄孢菌株,并测试其毒杀活性变化。为探索长期接触Cry5Ba3Φ蛋白是否会使松材线虫产生毒力适应性表型及与线虫伴生细菌菌群间潜在的关联,本研究观察随毒蛋白接触时间和接触频次松材线虫的种群密度变化情况,并分析适应Cry5Ba3Φ蛋白前后松材线虫体内和体外的伴生细菌菌群结构。主要结果如下:1.利用生物信息学软件进行Cry5Ba3Φ毒蛋白结构域预测分析,在保留其毒性中心区的基础上破坏其完整性结构,选择了五处氨基酸位点进行截短,得到六条不同长度的cry5Ba3Φ基因片段。利用Gibson技术将这些基因片段装载到pTFCM载体上,再通过农杆菌介导的遗传转化,将cry5Ba3Φ缺失片段整合至灰葡萄孢菌的基因组中。生测实验表明,破坏Cry5Ba3Φ蛋白的不同区域结构会对其作用松材线虫的毒力造成不同程度影响。2.相比于野生型灰葡萄孢菌,用转cryBa3Φ基因灰葡萄孢菌饲喂的松材线虫其种群繁殖受到明显抑制,但是随着接触时间延长或者接触频次增加,松材线虫种群密度开始回升且与相应野生型灰葡萄孢菌上线虫的种群密度无明显差异。运用变性梯度凝胶电泳方法(DGGE)检测野生型和转cry5Ba3Φ基因灰葡萄孢菌上连续转板培养线虫的伴生细菌菌群群落结构,发现松材线虫体内和体外的伴生细菌菌群结构变化与线虫对Cry5Ba3Φ的适应能力间呈现出一定的关联性。本研究初步探索了Cry5Ba3Φ结构完整性对毒力的影响以及松材线虫伴生细菌菌群变化与线虫适应Cry5Ba3Φ毒杀活性之间的潜在关联,为下一步明确线虫伴生细菌在毒蛋白适应能力形成过程中的调控功能以及伴生细菌作用于毒蛋白的潜在方式奠定了基础。(本文来源于《浙江农林大学》期刊2017-06-08)

曹毅[2](2015)在《受根结线虫侵染的烟草根际细菌群落特征及南方根结线虫伴生细菌多样性研究》一文中研究指出根结线虫(Root-knot nematode)是世界范围内最具危害的植物病原,可侵染如粮食、烟草、蔬菜、水果等几乎所有栽培作物,是当前农作物可持续生产的主要限制因子之一。根结线虫在根际环境中完成其主要生活史和侵染循环,处于同一生态位的根结线虫、根际微生物和植物存在紧密的互作关系。本论文揭示了自然条件下感染根结线虫和健康烟草根际细菌的多样性、构成特征及其主要环境影响因子。此外,还对南方根结线虫不同生活史阶段伴生细菌的组成和多样性进行研究,主要结果如下:1.大尺度地理生境下烟草根际细菌群落结构、多样性和优势菌群从我国10个省市28个植烟区采集65份根际土壤样品(其中感染根结线虫的烟草根际土壤28份,健康根际土壤27份,其他植物根际土壤10份),采用罗氏454GS FLX测序平台对根际土壤细菌16S rDNA的V1—V3区扩增子进行高通量测序,对获得的464879条序列进行数据处理和分析,比较了不同地区烟草根际细菌菌群结构、组成和多样性,分析了烟草根际土壤优势菌群。结果表明:(1)烟草根际菌群主要由细菌域的变形菌门、厚壁菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门,候选门WS3、TM7等23个门和分类地位未知的细菌组成,其中以酸杆菌门、变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门和候选门WS3为主。不同地理来源的烟草根际土壤样品细菌组成种类及数量类似,但相对丰度差异较大。(2)不同地区烟草根际细菌多样性(alpha多样性)差异明显,同一地区样本间菌群组成较相似(Beta多样性)。(3)Rhizobium、Streptomyces、Sphingomonas、Singulisphaera等16个属的细菌类群构成了烟草根际微生物的优势种群(相对丰度>1%)。2.环境和土壤理化性质的相互作用决定了烟草根际细菌群落对不同地理来源,土壤pH、有机质、主要矿物元素等12个理化因子与根际土壤细菌菌群的相关性分析发现:(1)不同地理来源样品的根际土壤细菌菌群组成差异明显,且根际土壤菌群的聚类与地理来源有较好的相关性。(2)土壤pH与地理来源、细菌组成具有相关性;其他理化因子与地理来源、细菌组成无明显相关性。结果表明,环境因子,如地理格局和土壤pH值等可能通过相互作用决定了烟草根际细菌在空间尺度上的构成,而相互作用取决于环境的不同。3.根结线虫侵染对烟草根际细菌菌群的影响通过比较感染根结线虫和健康烟草根际细菌的组成和多样性,发现患病和健康烟草根际细菌菌群间的α多样性、β多样性和根际优势菌群的分布存在一定差异,表明线虫侵染在一定程度上影响了寄主植物根际细菌菌群。进一步对患病和健康根际菌群共存模式(co-occurrence pattern)进行分析,发现感染根结线虫和健康烟草根际细菌中显着关联共存菌群的种类和数量明显不同。在健康烟草根际土壤细菌中有分属于7个门的32个细菌类群共存,共存的菌群主要分布于Proteobacteria(13个类群)、Actinobacteria(7个类群)、Planctomycetes(4个类群)和Firmicutes(3个类群);在感染根结线虫的烟草根际土壤中有分属于10个门的42个细菌类群共存,共存类群在Proteobacteria增加为22个,Firmicutes和Actinobacteria分别减少2个和1个,同时Bacteroidetes(3个类群)、Nitrospirae(1个类群)和Gemmatimonadetes(1个类群)只在患病烟草根际土壤共存。利用不同统计检验方法对患病和健康根际细菌菌群的比较分析发现,Rhizobium、Novosphingobium与根结线虫患病显着相关。对根结线虫侵染和土壤理化因子的相关性分析显示,单一土壤理化因子与是否感染根结线虫没有相关性。进一步以样品是否感染根结线虫为响应变量,地域为随机效应,各项理化指标为固定效应,构建广义线性混合模型评估土壤理化因子和是否感染根结线虫的关系,结果显示当用大量营养元素(N、P、K和有机质)和pH作固定效应时,钾的含量与是否感染根结线虫具有显着负相关;当用微量营养元素(Cu, Zn, Mn, Fe, Mg)做固定效应时,铜和锰含量与是否感染根结线虫具有显着负相关。当用有机营养元素和无机营养元素做固定效应时,钾的含量与是否感染根结线虫具有显着负相关。上述结果表明,以土壤钾含量为主的土壤理化因子和生物因素的交互作用影响了烟草根结线虫病的发生。4.不同生活史阶段南方根结线虫伴生细菌多样性利用454高通量测序技术对不同生活史阶段(卵块、雌虫和二龄幼虫)南方根结线虫的伴生菌多样性进行研究,结果表明变形菌门、放线菌门、拟杆菌门和拟杆菌门细菌为南方根结线虫伴生菌的优势菌群,其中以变形菌门细菌丰度最高。线虫叁个生活史阶段存在核心伴生菌群,但各生活史阶段线虫伴生菌群组成和多样性略有不同,可能与线虫不同生活史阶段的栖居环境和线虫生长发育相关。一些被认为是根结线虫潜在生防因子的细菌,如放线菌和假单胞菌在线虫卵块的丰度和多样性较高,但在二龄幼虫和雌虫中数量急剧减少;同时,一些在其他植物寄生线虫和自由生活线虫中已鉴定的伴生菌,如Pedobacter也同时存在于南方根结线虫中。结果表明,根结线虫伴生着多样的细菌,这些伴生细菌可能对线虫具有重要的作用,某些细菌可能是线虫潜在的生物防治因子或靶标。本论文的结果有助于解析根结线虫—植物—根际细菌间的相互关系,为阐明根结线虫的发病机理提供参考数据,同时也可为根结线虫的生物防治提供新思路。(本文来源于《云南大学》期刊2015-05-01)

覃德文,文印,聂珍臻,廖长琨,卫伶俐[3](2014)在《松材线虫伴生细菌与松材线虫的关系及致病性机理研究》一文中研究指出松材线虫病又称松树萎蔫病,近年来成为了国内严重毁坏型病害。如何治理该病害成为了当今植物保护界研究热点,降低该病害对生产造成的损失尤为迫切,现通过对松材线虫病的危害进行分析,总结前人对松材线虫病的研究成果:分析松材线虫伴生细菌的多样性,发掘松材线虫伴生细菌与松材线虫的关系,结合国内外研究松材线虫伴生细菌的致病性机理研究,总结得出松材线虫伴生菌种较多,没有明显的专一性,结合微生物细菌研究的发展,分离和鉴定出越来越多的细菌种类;指出了松材线虫与携带细菌之间存在密切相关,毒素在松材线虫伴生细菌的致病机制中起着重要作用。(本文来源于《黑龙江农业科学》期刊2014年11期)

李辉,刘洋,白飞荣,姚粟,扎西·才吉[4](2014)在《野生冬虫夏草伴生细菌群落结构及多样性分析》一文中研究指出采用基于PCR扩增的变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,研究8种不同地理来源野生冬夏草中伴生细菌的群落结构,通过优势条带切胶测序分析,确定了不同来源冬虫夏草伴生优势细菌的种属信息,分析结果表明冬虫夏草中细菌群落多样性丰富,不同来源冬虫夏草的细菌多样性指数(H’)、丰度(D)和均匀度(J)均有所不同,且伴生细菌群落相似性与样品产地间的距离远近呈一定的正相关。本研究还发现了冬虫夏草样品中的4种共有细菌Flavihumibacter petaseus、Sphingomonas aestuarii、Geobacillus pallidus和Methylovirgula ligni,为进一步研究伴生细菌在冬虫夏草生长发育中所起的作用奠定了基础。(本文来源于《生物技术通报》期刊2014年10期)

乔洪金,刘相全,马晶晶,王际英,张利民[5](2012)在《5株海洋微藻伴生细菌的分离鉴定与功能分析》一文中研究指出[目的]研究水产养殖中常用的4种海洋微藻在粗放培养过程中所伴生的主要细菌。[方法]采用平板涂布的方法成功分离到5株可培养的海洋细菌,利用16S rRNA基因序列的通用引物对单克隆菌落进行PCR扩增,所得PCR产物经测序和Genbank比对后,采用邻位相接法构建了系统进化树,并对其种属关系进行了分析。[结果]研究表明,5株海洋细菌分属于α-proteobacteria和γ-proteobacteria两大类别。根据16S rRNA基因序列的种属关系分析,5株海洋细菌分属于Porphyrobacter、Devosia、Ponticoccus、Marinobacter和Roseobacter5个属。根据其相近种的生理生化特征推断,这些伴生细菌在分解微藻胞外产物为微藻提供无机营养盐和分泌促生长因子促进微藻的生长等方面可能发挥着重要作用。[结论]在实际的微藻饵料培养过程中,应注意保留这些有益的伴生细菌。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2012年29期)

郑芬,符美英,赵志祥,陈绵才[6](2012)在《相似穿孔线虫伴生细菌群落多样性研究》一文中研究指出[目的]揭示相似穿孔线虫伴生细菌群落物种丰度及其细菌多样性。[方法]通过构建细菌16S rDNA克隆文库,对阳性克隆进行ARDRA分析和构建系统发育树。[结果]依据97%序列相似性划分OTU,构建的细菌16S rDNA文库包含13个OTU,分别属于Alpha-proteobacteria、Betaproteobacteria和Gammaproteobacteria,其中优势菌群为Betaproteobacteria,特别是Burkholderia为优势细菌。[结论]相似穿孔线虫的伴生细菌多样性较高,这些细菌可能对相似穿孔线虫具有一定的生态意义。(本文来源于《安徽农业科学》期刊2012年22期)

郑芬[7](2012)在《不同生境相似穿孔线虫伴生细菌系统发育多样性分析》一文中研究指出相似穿孔线虫Radopholus similis是一种重要的植物病原线虫,其诱发的病害通常称为香蕉穿孔根腐病、黑头病或衰退病,是我国重要的进境植物检疫性有害生物,对我国香蕉等热带果树和火鹤等观赏植物有着极大的潜在危险。相似穿孔线虫的寄主范围非常广且地理分布广泛,几乎遍布于世界上大多数香蕉产区,在热带和亚热带地区广泛存在。相似穿孔线虫是一种迁移性内寄生线虫,整个生活都在根组织内完成,在不良条件下有时可以转移到根外。相似穿孔线虫存在两个形态上相似的生理型,即香蕉致病型Radopholus similis和柑桔致病型Radopholus citorphiht。前者只侵染香蕉而不侵染相柑桔,后者既侵染香蕉也侵染柑桔。香蕉小种广泛分布世界各香蕉产区,柑桔小种只有美国有过报道。通过寄主鉴定,本文的将来自叁亚、海口和广州3个不同生境的相似穿孔线虫种群均鉴定为香蕉小种。相似穿孔线虫与细菌之间存在着多种互作关系,这些生活在线虫体表或组织内部的细菌称为伴生细菌。伴生细菌的多样性研究可以了解细菌对相似穿孔线虫的影响,进而解释微生物-相似穿孔线虫-寄主之间的互作机理。本文采用系统发育多样性分析来研究相似穿孔线虫伴生细菌,通过建立16S rDNA基因克隆文库,并进行ARDRA分析,采用DOTUR等软件构建稀缺性曲线,并对文库序列进行blast比对,用MEGA等软件构建系统发育树,计算多样性系数对比3个地区相似穿孔线虫伴生细菌差异。经过ARDRA分析,来自叁亚的文库1号样品得到16个OTU,来自海口的文库2号样品得到15个OTU,来自广州的文库3号样品得到15个OTU;经过测序并用DOTUR等软件分析,1号样品共14个OTU,2号样品共12个OTU,3号样品共得到13个OTU。两种方法计算得到的OTU数无明显差异,通过两组数据得到的稀缺性曲线丰度和多样性参数也无明显差异,表明了经ARDRA筛选出的克隆序列同样能代表文库中大多数细菌的多样性;构建3个文库的16S rDNA均属于变形菌的Alphaproteobacteria、Betaproteobacteria和Gammaproteo bacteria。来自叁亚的1号样品共含10个属,Betaproteobacteria含5个属,序列数占克隆文库的45%,Alphaproteobacteria含4个属,序列数占克隆文库的50%,Gammaproteo bacteria含1个属,序列数占克隆文库的5%,优势菌群为Alphaproteobacteria, Rhizobium为优势细菌;来自海口的2号样品共含8个属,其中Betaproteobacteria5个属,序列数占克隆文库的69%,Alphaproteobacteria2个属,序列数占克隆文库的20%,Gaimmaproteobacteria包含1个属,序列数占克隆文库的11%;来自广州的3号样品共5个属,其中Betaproteobacteria1个属,序列数占克隆文库的90%,Alphaproteobacteria3个属,序列数占克隆文库的5%,Gammaproteobacteria包含1个属,序列数占克隆文库的5%。来自海口的2号样品和广州的3号优势菌群为Betaproteobacteria和Burkholderia。来自叁亚的1号样品序列均与数据库中的序列相似性均高于97%,来自海口的2号样品序列2-4b与Martelella属菌16S rDNA基因序列相似性为95%,来自广州的3号样品序列3-4-1d与被埃希氏杆菌属Escherichia coli16S rDNA基因序列相似性为95%,序列3-4-4f与志贺氏杆菌Shigella flexneri16S rDNA基因序列相似性为95%,3-12b与中华根瘤菌属Sinorhizobium16S rDNA基因序列相似性为96%。来自3个区域的相似穿孔线虫伴生细菌多样性程度都不高,彼此间差异不明显。相比之下,来自不同生境的样品的伴生细菌多样性程度和均匀度都最高,表明湿热的栖息环境可能更利于线虫和细菌的生存。不同生境相似穿孔线虫伴生细菌多样性差异分析表明,相似穿孔线虫与伴生细菌是一个开放体系,相似穿孔线虫能够从环境中获取对自身有利的细菌,例如携带青枯假单孢杆菌等植物致病菌,提高生存适应能力和更好地入侵寄主。(本文来源于《海南大学》期刊2012-04-01)

李颜方,殷幼平,王玉玺,李佳,陈世伟[8](2011)在《柑橘黄龙病兼性厌氧型伴生细菌的分离及优势菌群分析》一文中研究指出柑橘黄龙病是世界柑橘生产上最具毁灭性的病害,主要由难人工培养的韧皮杆菌所引起(Candidatus Liberibacter asiaticus)[1]。近年的研究结果表明黄龙病发病组织内除了韧皮杆菌外,还(本文来源于《植物病理学报》期刊2011年05期)

李颜方,殷幼平,王玉玺,李佳,陈世伟[9](2011)在《亚洲韧皮杆菌兼性厌氧型伴生细菌鉴定及优势菌群分析》一文中研究指出以定向分离培养和基于16S rDNA的PCR-DGGE(Denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)方法,分析感黄龙病柑橘与健康柑橘植株不同部位的内生细菌多样性,分离柑橘组织共获得19株可培养的兼性厌氧型内生细菌,经形态、生理生化结合16S rDNA分子方法鉴定其隶属于12个属,其中短小杆菌属Curtobacterium sp.(IF:29.07%)、芽孢杆菌属Bacillus sp.(IF:23.12%)和微杆菌属Microbacterium sp.(IF:21.09%)为罹病植株的优势菌群,芽孢杆菌属Bacillus sp.(IF:21.03%)、动性球菌属Planococcus sp.(IF:20.69%)和假单胞菌属Pseudomonas sp.(IF:17.44%)为无症健株的优势菌群。对DGGE方法得到的50条16S rDNA目标条带进行序列比对,共鉴定出9个属的细菌,结果表明沙雷氏菌属Serrations sp.(IF:28%)是优势菌属,泛菌属Pantoea sp.(IF:14%)是次优势菌属;病果桔络中黄龙病菌含量最高(>1%),而罹病植株其他部位的黄龙病菌丰度较低。PCR-DGGE图谱也显示感病和健康柑橘组织的内生细菌存在差异。(本文来源于《微生物学通报》期刊2011年09期)

张祺玲,田雪亮,谭周进,陈国华,谢丙炎[10](2010)在《松材线虫伴生细菌宏基因组fosmid文库构建及特征分析》一文中研究指出松材线虫是松材线虫病的病原,且与其伴生细菌之间存在互作。为研究松材线虫和伴生细菌的互作关系,本研究用Nycodenz介质离心和SDS裂解法富集松材线虫的伴生细菌,以酚/氯仿抽提法提取DNA,构建了松材线虫伴生细菌fosmid宏基因组文库。文库克隆的插入片段大小分布在30~45kb,平均长度为40kb。该文库包含19200个克隆,共计包含7680000kb DNA。文库稳定性检测表明插入的DNA片段能够在fosmid质粒中稳定遗传,没有发现插入片段丢失或重排。随机挑选96个克隆进行末端测序,BLAST分析表明:该文库中松材线虫序列占5.2%,细菌序列占64.6%,无同源序列14.6%。对伴生细菌多样性分析表明:Stenotrophomonas为优势种群,Sphingomonas、Cupriavidus和Pseudomonas为次优势种群。该文库的建立为揭示松材线虫与其伴生细菌的互作关系及伴生细菌的生态功能奠定了基础。(本文来源于《植物病理学报》期刊2010年04期)

伴生细菌论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

根结线虫(Root-knot nematode)是世界范围内最具危害的植物病原,可侵染如粮食、烟草、蔬菜、水果等几乎所有栽培作物,是当前农作物可持续生产的主要限制因子之一。根结线虫在根际环境中完成其主要生活史和侵染循环,处于同一生态位的根结线虫、根际微生物和植物存在紧密的互作关系。本论文揭示了自然条件下感染根结线虫和健康烟草根际细菌的多样性、构成特征及其主要环境影响因子。此外,还对南方根结线虫不同生活史阶段伴生细菌的组成和多样性进行研究,主要结果如下:1.大尺度地理生境下烟草根际细菌群落结构、多样性和优势菌群从我国10个省市28个植烟区采集65份根际土壤样品(其中感染根结线虫的烟草根际土壤28份,健康根际土壤27份,其他植物根际土壤10份),采用罗氏454GS FLX测序平台对根际土壤细菌16S rDNA的V1—V3区扩增子进行高通量测序,对获得的464879条序列进行数据处理和分析,比较了不同地区烟草根际细菌菌群结构、组成和多样性,分析了烟草根际土壤优势菌群。结果表明:(1)烟草根际菌群主要由细菌域的变形菌门、厚壁菌门、酸杆菌门、放线菌门、拟杆菌门,候选门WS3、TM7等23个门和分类地位未知的细菌组成,其中以酸杆菌门、变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门和候选门WS3为主。不同地理来源的烟草根际土壤样品细菌组成种类及数量类似,但相对丰度差异较大。(2)不同地区烟草根际细菌多样性(alpha多样性)差异明显,同一地区样本间菌群组成较相似(Beta多样性)。(3)Rhizobium、Streptomyces、Sphingomonas、Singulisphaera等16个属的细菌类群构成了烟草根际微生物的优势种群(相对丰度>1%)。2.环境和土壤理化性质的相互作用决定了烟草根际细菌群落对不同地理来源,土壤pH、有机质、主要矿物元素等12个理化因子与根际土壤细菌菌群的相关性分析发现:(1)不同地理来源样品的根际土壤细菌菌群组成差异明显,且根际土壤菌群的聚类与地理来源有较好的相关性。(2)土壤pH与地理来源、细菌组成具有相关性;其他理化因子与地理来源、细菌组成无明显相关性。结果表明,环境因子,如地理格局和土壤pH值等可能通过相互作用决定了烟草根际细菌在空间尺度上的构成,而相互作用取决于环境的不同。3.根结线虫侵染对烟草根际细菌菌群的影响通过比较感染根结线虫和健康烟草根际细菌的组成和多样性,发现患病和健康烟草根际细菌菌群间的α多样性、β多样性和根际优势菌群的分布存在一定差异,表明线虫侵染在一定程度上影响了寄主植物根际细菌菌群。进一步对患病和健康根际菌群共存模式(co-occurrence pattern)进行分析,发现感染根结线虫和健康烟草根际细菌中显着关联共存菌群的种类和数量明显不同。在健康烟草根际土壤细菌中有分属于7个门的32个细菌类群共存,共存的菌群主要分布于Proteobacteria(13个类群)、Actinobacteria(7个类群)、Planctomycetes(4个类群)和Firmicutes(3个类群);在感染根结线虫的烟草根际土壤中有分属于10个门的42个细菌类群共存,共存类群在Proteobacteria增加为22个,Firmicutes和Actinobacteria分别减少2个和1个,同时Bacteroidetes(3个类群)、Nitrospirae(1个类群)和Gemmatimonadetes(1个类群)只在患病烟草根际土壤共存。利用不同统计检验方法对患病和健康根际细菌菌群的比较分析发现,Rhizobium、Novosphingobium与根结线虫患病显着相关。对根结线虫侵染和土壤理化因子的相关性分析显示,单一土壤理化因子与是否感染根结线虫没有相关性。进一步以样品是否感染根结线虫为响应变量,地域为随机效应,各项理化指标为固定效应,构建广义线性混合模型评估土壤理化因子和是否感染根结线虫的关系,结果显示当用大量营养元素(N、P、K和有机质)和pH作固定效应时,钾的含量与是否感染根结线虫具有显着负相关;当用微量营养元素(Cu, Zn, Mn, Fe, Mg)做固定效应时,铜和锰含量与是否感染根结线虫具有显着负相关。当用有机营养元素和无机营养元素做固定效应时,钾的含量与是否感染根结线虫具有显着负相关。上述结果表明,以土壤钾含量为主的土壤理化因子和生物因素的交互作用影响了烟草根结线虫病的发生。4.不同生活史阶段南方根结线虫伴生细菌多样性利用454高通量测序技术对不同生活史阶段(卵块、雌虫和二龄幼虫)南方根结线虫的伴生菌多样性进行研究,结果表明变形菌门、放线菌门、拟杆菌门和拟杆菌门细菌为南方根结线虫伴生菌的优势菌群,其中以变形菌门细菌丰度最高。线虫叁个生活史阶段存在核心伴生菌群,但各生活史阶段线虫伴生菌群组成和多样性略有不同,可能与线虫不同生活史阶段的栖居环境和线虫生长发育相关。一些被认为是根结线虫潜在生防因子的细菌,如放线菌和假单胞菌在线虫卵块的丰度和多样性较高,但在二龄幼虫和雌虫中数量急剧减少;同时,一些在其他植物寄生线虫和自由生活线虫中已鉴定的伴生菌,如Pedobacter也同时存在于南方根结线虫中。结果表明,根结线虫伴生着多样的细菌,这些伴生细菌可能对线虫具有重要的作用,某些细菌可能是线虫潜在的生物防治因子或靶标。本论文的结果有助于解析根结线虫—植物—根际细菌间的相互关系,为阐明根结线虫的发病机理提供参考数据,同时也可为根结线虫的生物防治提供新思路。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

伴生细菌论文参考文献

[1].秦嘉玲.蛋白结构完整性和松材线虫伴生细菌对Bt杀线虫活性影响研究[D].浙江农林大学.2017

[2].曹毅.受根结线虫侵染的烟草根际细菌群落特征及南方根结线虫伴生细菌多样性研究[D].云南大学.2015

[3].覃德文,文印,聂珍臻,廖长琨,卫伶俐.松材线虫伴生细菌与松材线虫的关系及致病性机理研究[J].黑龙江农业科学.2014

[4].李辉,刘洋,白飞荣,姚粟,扎西·才吉.野生冬虫夏草伴生细菌群落结构及多样性分析[J].生物技术通报.2014

[5].乔洪金,刘相全,马晶晶,王际英,张利民.5株海洋微藻伴生细菌的分离鉴定与功能分析[J].安徽农业科学.2012

[6].郑芬,符美英,赵志祥,陈绵才.相似穿孔线虫伴生细菌群落多样性研究[J].安徽农业科学.2012

[7].郑芬.不同生境相似穿孔线虫伴生细菌系统发育多样性分析[D].海南大学.2012

[8].李颜方,殷幼平,王玉玺,李佳,陈世伟.柑橘黄龙病兼性厌氧型伴生细菌的分离及优势菌群分析[J].植物病理学报.2011

[9].李颜方,殷幼平,王玉玺,李佳,陈世伟.亚洲韧皮杆菌兼性厌氧型伴生细菌鉴定及优势菌群分析[J].微生物学通报.2011

[10].张祺玲,田雪亮,谭周进,陈国华,谢丙炎.松材线虫伴生细菌宏基因组fosmid文库构建及特征分析[J].植物病理学报.2010

论文知识图

合成与分解代谢途径Fig.1-2Anab...海洋微藻伴生细菌的系统进化树分...部分香蕉穿孔线虫可培养伴生细菌部分香蕉穿孔线虫可培养伴生细菌部分香蕉穿孔线虫可培养伴生细菌个香蕉穿孔线虫种群的可培养伴生

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伴生细菌论文_秦嘉玲
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