视紫红质论文_冯维维

导读:本文包含了视紫红质论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:视紫红质,质子,细菌,单点,突变,氢键,异构。

视紫红质论文文献综述

冯维维[1](2019)在《视紫红质让海洋细菌成为捕光“能手”》一文中研究指出多年来,科学家一直认为微生物是利用叶绿素捕获了海洋中大部分的太阳能。但在8月7日发表于《科学—进展》杂志的一项研究中,研究人员发现,拥有变形视紫红质(一种利用视黄醛捕捉光线的结合蛋白)的细菌在把光线转化为能量方面发挥着重要作用,尤其是在营养物质匮乏的海域(本文来源于《中国科学报》期刊2019-08-13)

程玥,王晞[2](2019)在《光遗传学工具蛋白视紫红质通道蛋白-2的结构与特性介绍》一文中研究指出视紫红质通道蛋白-2(ChR2)来自莱茵衣藻,由通道蛋白-2(Chop2)与视黄醛结合形成,属于视蛋白的一种,在470nm左右蓝光照射下,ChR2分子构象发生变化形成非选择性阳离子通道,对一价阳离子Na~+、K~+、H~+等和二价阳离子Ca~(2+)等具有通透性,使细胞膜电位变为内正外负,引起细胞去极化兴奋,进而改变细胞的膜电势产生感应电流。ChR2是光遗传学中应用最为广泛的兴奋性光敏蛋白之一,发现和诱导了多种突变体,可根据需要选择其中某种进行相关研究。(本文来源于《中国心脏起搏与心电生理杂志》期刊2019年01期)

杨雅楠,孙超,崔浩琳,赵欣[3](2019)在《M145F/F146M突变对光受体蛋白细菌视紫红质和古紫质4光循环的影响》一文中研究指出古紫质4(archaerhodopsin 4,aR4)与细菌视紫质(bacteriorhodopsin,bR)同属于盐杆菌科,同源性59%,均为光驱质子泵。其功能是在光照条件下将质子由胞内泵到胞外形成跨膜质子梯度,该梯度差被膜上另外一种蛋白ATP合成酶用于ATP的合成,从而完成光能向生物能的转化。aR4和bR具有相似的光循环过程,但质子传递时序不同,aR4是先从胞内吸收质子再将质子释放到胞外,而bR恰好相反。甲硫氨酸-145是位于bR视黄醛发色团键合区的一个重要残基,对其光循环有着重要的影响,而在aR4中处在相应位置上的苯丙氨酸-146是其视黄醛键合区与bR唯一不相同的残基。因此通过定点突变,采用紫外可见吸收光谱、动力学光谱、质子泵功能检测、低温透射红外光谱等手段对比分析研究M145F和F146M单点突变对bR和aR4光循环造成的影响,有助于深入理解aR4结构与功能的关系。研究结果表明,M145F突变造成了bR光循环L的丢失和质子泵功能的减弱,而F146M突变并未对aR4的光循环造成显着影响,且突变后aR4质子释放时序没有反转,表明该位置上的残基在两个体系中的作用不尽相同。(本文来源于《中国生物工程杂志》期刊2019年01期)

李文金[4](2018)在《新能量分解分析方法及其在视紫红质研究上的应用》一文中研究指出理论计算是目前研究生物大分子结构与功能的重要研究手段。特别地,分子动力学模拟为在原子水平从动态学和能量分析的角度来阐明生物大分子行使功能的机理提供可能,为蛋白/药物设计提供新的手段。然而,传统的能量分解往往只能进行定性分析,这极大地阻碍了它们在生物大分子机理解析和蛋白质/药物设计等研究上的广泛应用。最近,我们提出了沿反应路径进行能量分解的方法,以统计力学理论论证了该方法的正确性,并在模式系统上进行了验证。目前,该方法被应用到研究视紫红质从bathorhodopsin向lumirhodopsin的转变过程,并首次量化该过程中各氨基酸残基的能量贡献,所得结果与实验研究吻合。因此,该方法被进一步证明可用来研究生物大分子系统,将成为研究生物大分子作用机理和蛋白/药物设计的有力手段。(本文来源于《中国生物化学与分子生物学会第十二届全国会员代表大会暨2018年全国学术会议摘要集》期刊2018-10-25)

孟馨茹,赵欣[5](2018)在《单点突变对细菌视紫红质光循环及蛋白动态构象的影响》一文中研究指出细菌视紫红质(Bacteriorhodopsin, bR)是一种存在于嗜盐杆菌(Halobacterium salinarum)细胞膜上的整合膜蛋白,是一个光驱质子泵,具有与GPCR相同的七次跨膜结构。光照后,视黄醛分子发生all-trans→13-cis→all-trans的光异构化,在经历一系列具有特定紫外波长的K、L、M、N、O中间态后回到基态,完成质子的定向释放。本文采用固体核磁共振技(本文来源于《2018第二十届全国波谱学学术年会会议论文摘要集》期刊2018-10-12)

崔浩琳,丁小燕,赵欣[6](2018)在《细菌视紫红质席夫碱扭曲程度与其质子泵功能的相关性研究》一文中研究指出细菌古紫质-4(archaerhodopsin-4, aR4)是嗜盐杆菌XZ-515上以视黄醛(retinal, Ret)为发色团的七-跨膜光敏受体蛋白。它与细菌视紫红质(bacteriorhodopsin, bR)具有相类似的质子泵功能,但是在自然条件下的传输过程中表现出不同的质子传输顺序,且为弱质子泵。然而,这二种质子泵功能的强弱与席夫碱(Schiff base, SB)的扭曲程度之间的关系尚不得而知。本工作(本文来源于《2018第二十届全国波谱学学术年会会议论文摘要集》期刊2018-10-12)

王铭,赵欣[7](2018)在《色氨酸182在细菌视紫红质光循环中的功能研究》一文中研究指出细菌视紫红质(bacteriorhodopsin,bR)是嗜盐杆菌R1M1细胞膜上以视黄醛为发色团的七次跨膜光受体质子泵。当b R受光激发后即进入光循环,在历经K、L、M、N、O等一系列中间态后完成质子从胞内到胞外的释放。色氨酸182 (Tryptophan 182, W182)是位于视黄醛发色团结合口袋的一个关键芳香性残基,它与W86一起将视黄醛夹在中间组成了发色团键合区中一个非常重要的作用位点。聚焦W182在bR光循环中的功能角色,本工作采用原位(本文来源于《2018第二十届全国波谱学学术年会会议论文摘要集》期刊2018-10-12)

董欣怡,赵欣[8](2018)在《色氨酸86与细菌视紫红质光循环的耦合作用研究》一文中研究指出细菌视紫红质(bacteriorhodopsin,bR)是一种以视黄醛为发色团(retinal,Ret)的七-跨膜光受体蛋白,其功能是利用质子由胞内向胞外定向传输所产生的pH梯度将光能转化为化学能。在光照条件下视黄醛由all-trans变为了13-cis,在经历一系列具有特定紫外波长的中间态后重新回到基态,完成质子的定向传输。色氨酸86(W86)是位于视黄醛键合区的一个关键芳香性残基,在所有的细菌类视紫红质家族蛋白中极具保守性。为深入探究W86在bR光循环(本文来源于《2018第二十届全国波谱学学术年会会议论文摘要集》期刊2018-10-12)

陈思瑾,丁小燕,何晓,赵欣[9](2018)在《细菌视紫红质光循环过程中络氨酸185的旋转构象变化:基于化学位移的AF-QM/MM计算》一文中研究指出众所周知,芳香性残基在G-蛋白偶联受体(G-protein-coupled receptors, GPCRs)具有高度的保守性,并且通过局部的旋转变构微开关在GPCRs的激活机制中扮演着非常重要的角色。然而,同样具有高度保守性的芳香性残基在细菌类视紫红质光循环级联反应中的作用仍不是十分清楚。本工作以细菌视紫红质(bacteriorhodopsin, bR)视黄醛(retinal, Ret)键合区具有高度保(本文来源于《2018第二十届全国波谱学学术年会会议论文摘要集》期刊2018-10-12)

马明蕾[10](2018)在《甲藻视紫红质基因在哺乳动物细胞中表达系统的构建以及亚细胞定位研究》一文中研究指出浮游植物的生命活动所消耗的能量源自太阳光能,光合作用是浮游植物固定光能的最主要形式。近年来,在包括浮游植物和细菌在内的海洋微型生物中发现的视紫红质被认为是光能捕获蛋白,该蛋白通过捕获光能并能在细胞膜内外形成离子梯度进而合成ATP,即无需通过光合系统I和光合系统II也可将光能转化为化学能,被认为是能够独立于光合系统之外的能量转化蛋白。视紫红质分布于许多微生物门类中,包括古菌、细菌、真菌和藻类,是一种光驱动型跨膜蛋白。根据其功能的不同,视紫红质可以划分为质子泵型视紫红质和离子泵型视紫红质,阳离子通道以及光感受器。根据基因序列比对甲藻中亦发现存在视紫红质基因,且根据氨基酸序列比对很可能属于光驱动质子泵型视紫红质。现已有研究发现东海原甲藻Prorocentrum dongaiense的视紫红质的表达有很强的昼夜周期节律性,光周期表达水平较高,暗周期表达水平较低。异养型甲藻海洋尖尾藻Oxyrrhis marina饥饿处理时质子泵型视紫红质在有光照条件下的表达量高于黑暗条件,与其种群生长率相对应,初步证实这个蛋白可作为能量补充机制。但对甲藻视紫红质更为深入的研究尚待开展,至今还没有直接证据表明甲藻中的视紫红质蛋白的具体功能与作用机制,和其在细胞中的具体表达位置。本研究以课题组已知序列的东海原甲藻以及链状亚历山大藻Alexandrium catenella(原种名:Alexandrium fundyense)的视紫红质基因为目标基因,构建了能够表达这两种甲藻视紫红质基因的哺乳动物细胞表达系统,并在此系统中对东海原甲藻和链状亚历山大藻视紫红质进行了亚细胞定位。主要研究结果如下:(1)论文将东海原甲藻和链状亚历山大藻视紫红质基因重组至表达载体PB513B-1,构建了东海原甲藻视紫红质表达载体PB513B-PdRhod和链状亚历山大藻视紫红质表达载体PB513B-AcRhod。利用质粒共转染技术将PB513B-PdRhod与PB513B-AcRhod分别和转座酶表达载体PB200-PA共转染转入人的胚胎肾上皮细胞HEK293T细胞,借助Piggy Bac转座系统,构建了可以表达甲藻基因的哺乳动物细胞表达系统。(2)论文在成功构建表达甲藻基因的哺乳动物细胞表达系统的基础上,利用细胞免疫荧光技术对在哺乳动物细胞表达系统中表达的两种甲藻视紫红质基因进行了亚细胞定位,细胞免疫荧光结果显示东海原甲藻视紫红质蛋白以及链状亚历山大藻视紫红质蛋白在哺乳动物细胞表达系统当中均在细胞膜上表达。(本文来源于《厦门大学》期刊2018-05-01)

视紫红质论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

视紫红质通道蛋白-2(ChR2)来自莱茵衣藻,由通道蛋白-2(Chop2)与视黄醛结合形成,属于视蛋白的一种,在470nm左右蓝光照射下,ChR2分子构象发生变化形成非选择性阳离子通道,对一价阳离子Na~+、K~+、H~+等和二价阳离子Ca~(2+)等具有通透性,使细胞膜电位变为内正外负,引起细胞去极化兴奋,进而改变细胞的膜电势产生感应电流。ChR2是光遗传学中应用最为广泛的兴奋性光敏蛋白之一,发现和诱导了多种突变体,可根据需要选择其中某种进行相关研究。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

视紫红质论文参考文献

[1].冯维维.视紫红质让海洋细菌成为捕光“能手”[N].中国科学报.2019

[2].程玥,王晞.光遗传学工具蛋白视紫红质通道蛋白-2的结构与特性介绍[J].中国心脏起搏与心电生理杂志.2019

[3].杨雅楠,孙超,崔浩琳,赵欣.M145F/F146M突变对光受体蛋白细菌视紫红质和古紫质4光循环的影响[J].中国生物工程杂志.2019

[4].李文金.新能量分解分析方法及其在视紫红质研究上的应用[C].中国生物化学与分子生物学会第十二届全国会员代表大会暨2018年全国学术会议摘要集.2018

[5].孟馨茹,赵欣.单点突变对细菌视紫红质光循环及蛋白动态构象的影响[C].2018第二十届全国波谱学学术年会会议论文摘要集.2018

[6].崔浩琳,丁小燕,赵欣.细菌视紫红质席夫碱扭曲程度与其质子泵功能的相关性研究[C].2018第二十届全国波谱学学术年会会议论文摘要集.2018

[7].王铭,赵欣.色氨酸182在细菌视紫红质光循环中的功能研究[C].2018第二十届全国波谱学学术年会会议论文摘要集.2018

[8].董欣怡,赵欣.色氨酸86与细菌视紫红质光循环的耦合作用研究[C].2018第二十届全国波谱学学术年会会议论文摘要集.2018

[9].陈思瑾,丁小燕,何晓,赵欣.细菌视紫红质光循环过程中络氨酸185的旋转构象变化:基于化学位移的AF-QM/MM计算[C].2018第二十届全国波谱学学术年会会议论文摘要集.2018

[10].马明蕾.甲藻视紫红质基因在哺乳动物细胞中表达系统的构建以及亚细胞定位研究[D].厦门大学.2018

论文知识图

人类的GPCR[1]光遗传技术发展历程氨基酸侧链结构和构象的视紫红质...一!视紫红质视紫红质蛋白的叁级结构图牛视紫红质二维蛇形图,关键的氨...

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