论文摘要
发展了应用于鸟嘌呤G和氨基酸残基体系的浮动电荷力场,该力场明确定义了孤对电子和键的电荷和位置,通过电荷随着环境的浮动来体现极化效应;通过氢键拟合函数kHB描绘了氢键键能.应用量子化学方法,对G与氨基酸残基体系从氢键、几何结构及电荷分布3个方面展开计算及分析,并以其为基准,确定参数发展了适用于G与氨基酸残基氢键体系的ABEEMσπPFF.采用3种不同力场模拟目标分子的结构和性质.模拟结果表明,发展的ABEEMσπPFF与量子化学方法具有最好的一致性,可用于模拟生物大分子体系.
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 许炎,刘翠,韩成娟,潘明玉,孙照琦,韩冰玉,杨忠志
关键词: 极化力场,氢键,碱基,氨基酸残基
来源: 高等学校化学学报 2019年02期
年度: 2019
分类: 工程科技Ⅰ辑
专业: 化学
单位: 辽宁师范大学化学化工学院
基金: 国家自然科学基金(批准号:21133005,21603091),辽宁师范大学创新实践项目(批准号:cx201801012)资助~~
分类号: O641.1
页码: 288-297
总页数: 10
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