猪非典型瘟病毒GX01-2018株全基因组分子特征的分析

论文摘要

猪非典型瘟病毒（APPV）被证实是新生仔猪先天性震颤的致病因子。为了解广西APPV流行毒株的分子遗传特征,采用RT-PCR分段扩增APPV阳性病料,经克隆、测序、拼接,获得1株APPV的全基因序列,遂被命名为GX01-2018株。结果显示,GX01-2018株基因组全长11 565 bp,包括一个编码3 635个氨基酸的阅读框（ORF）。同源性分析显示,GX01-2018株与国内代表毒株广西GX-CH2016株、江西JX-JM01-2018A01株、广东China/GD-SD/2016株、广东GD株核苷酸序列的同源性分别为98.2%、92.9%、83.4%、90.8%。GX01-2018株与国外代表毒株美国000515株、德国BavariaS5/9株、奥地利AUT-2016C株、荷兰NL1株核苷酸序列的同源性分别为87.8%、90.7%、90.5%、90.7%。上述国内外代表毒株间Npro、Erns、E2基因核苷酸序列的同源性分别为79.1%～97.2%、83.0%～98.4%、83.1%～96.8%。基于APPV全基因组以及E2、Npro、Erns基因核苷酸序列绘制遗传进化树,获得相似的进化树图。来自广西的GX01-2018株与欧洲型毒株位于一个分支,而同样来自广西的GX04/2017株与美洲型毒株位于另一个分支。表明APPV流行毒株具有遗传多样性,来自同一地区的流行毒株出现较大的遗传变异。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 尹彦文,施开创,孙文超,莫胜兰,陆文俊,屈素洁

关键词: 猪非典型瘟病毒,基因组序列,遗传变异,遗传多样性,分子特征

来源: 中国兽医科学 2019年04期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 广西动物疫病预防控制中心,温州大学病毒学研究所

基金: 广西科技重大专项(桂科AA17204057),广西水产畜牧科技项目(桂渔牧科201528017)

分类号: S852.651

DOI: 10.16656/j.issn.1673-4696.2019.0059

页码: 484-492

总页数: 9

文件大小: 2463K

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