紫花苜蓿β-1,3-葡聚糖酶基因同源克隆与序列变异分析

紫花苜蓿β-1,3-葡聚糖酶基因同源克隆与序列变异分析

论文摘要

β-1,3-葡聚糖酶是植物重要的防卫蛋白之一。采用同源克隆法,从16个紫花苜蓿品种的集群DNA中分离到3个苜蓿β-1,3-葡聚糖酶基因的部分基因组编码序列,分别对应于蒺藜苜蓿3个不同的β-1,3-葡聚糖酶基因,并命名为β-1,3-葡聚糖酶基因1、β-1,3-葡聚糖酶基因2和β-1,3-葡聚糖酶基因3。其中,β-1,3-葡聚糖酶基因2和苜蓿β-1,3-葡聚糖酶基因3及其蒺藜苜蓿对应基因与包括β-1,3-葡聚糖酶基因1在内的其他豆科同类基因遗传距离较大。序列变异分析显示,β-1,3-葡聚糖酶基因2的SNP位点间平均距离为255bp,DNA和氨基酸序列均非常保守,表明其在进化中受到了强烈的选择压力。β-1,3-葡聚糖酶基因1的SNP位点间平均距离虽然较小(31bp),但其全部21个SNP位点均为同义SNP,同时,测序片段仅发现了10个单倍型,远远小于其理论单倍型数目(221)。这表明β-1,3-葡聚糖酶基因1的氨基酸序列高度保守,在功能上非常重要,少量单倍型的存在是为了调节其表达,以使苜蓿适应多种内、外部环境条件。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 植物材料与DNA提取
  •   1.2 简并引物、PCR与克隆测序
  •   1.3 数据处理与序列变异分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 β-1,3-葡聚糖酶基因序列分离
  •   2.2 β-1,3-葡聚糖酶基因序列变异分析
  • 3 结论与讨论
  •   3.1 候选基因法及β-1,3-葡聚糖酶基因的分离
  •   3.2 β-1,3-葡聚糖酶基因的保守性
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 高建明,桂枝,卢树昌

    关键词: 紫花苜蓿,葡聚糖酶,同源克隆,基因组序列分离,单核苷酸多态性

    来源: 西部林业科学 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 天津农学院农学与资源环境学院

    基金: 天津市高校“学科领军人才培养计划”项目(J01009030705)

    分类号: S541.9;Q943.2

    DOI: 10.16473/j.cnki.xblykx1972.2019.05.009

    页码: 56-62

    总页数: 7

    文件大小: 750K

    下载量: 95

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