长江口崇明东滩湿地微生物群落结构研究

长江口崇明东滩湿地微生物群落结构研究

论文摘要

以长江口发育最完善的河口型滩涂湿地-崇明东滩湿地为对象,采用高通量测序平台和定量PCR技术对光滩区和植被区沉积物的微生物群落结构进行研究,考察滩涂湿地自然演替过程中微生物群落变化规律及其环境驱动机制。结果表明,植被区沉积物表层的细菌16S rRNA基因拷贝数为光滩区表层的6.4倍,其Chao1指数与土壤有机碳、总氮和铵态氮呈显著负相关。植被区和光滩区沉积物中相对丰度大于1%的微生物门类有12个,占到总微生物群落的87%~90%。在属水平上,与光滩湿地相比,植被区湿地中相对丰度发生显著变化的优势属(> 0.1%)为25个,占到所有属的8.3%和所有优势属的64.1%;显著增加的优势属(> 0.2%)为10个,其增幅范围为0.22%~1.39%;其中,植被区沉积物中以脱硫球菌属和硫杆菌属微生物增加占主导,Cylindrospermopsis属为特有属。冗余分析表明,绿弯菌门微生物对土壤TOC、TN和NO3-等较为敏感,而酸杆菌门和拟杆菌门微生物对SO2-4、EC值和pH值等敏感。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品采集
  •   1.2 土壤理化性质分析
  •   1.3 土壤微生物总DNA提取
  •   1.4 PCR扩增和高通量测序
  •   1.5 荧光定量PCR分析
  •   1.6 数据处理
  • 2 结果与分析
  •   2.1 湿地沉积物土壤理化性质
  •   2.2 沉积物土壤的微生物数量特征
  •   2.3 湿地沉积物土壤的微生物ɑ多样性特征
  •   2.4 湿地沉积物土壤微生物的群落结构特征
  •   2.5 湿地土壤微生物群落结构的环境驱动机制
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张鑫磊,金锐,杨镇,田茂辉,张耀鸿,贾仲君

    关键词: 崇明东滩,微生物群落,定量,高通量测序,基因

    来源: 土壤通报 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学

    单位: 南京信息工程大学气象灾害预报预警与评估协同创新中心/江苏省农业气象重点实验室,中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(41671247,41103039),江苏省自然科学基金项目(BK20171455),江苏省大学生创新创业训练计划项目(201710300018Z,201810300094X),大气科学类校外(野外)实习实践考察项目(YWKC2017A12)资助

    分类号: S154.3

    DOI: 10.19336/j.cnki.trtb.2019.05.24

    页码: 1178-1184

    总页数: 7

    文件大小: 1913K

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