沈阳地区1株猪流行性腹泻病毒S1基因序列测定与分析

论文摘要

利用PEDV的S1基因的特异性引物,克隆了沈阳地区1株PEDV流行毒株（LNSY-2017）的S1基因,并通过S1基因序列比对,分析了此病毒株与其他相关毒株的亲缘关系。结果显示:LNSY-2017株S1基因（2 372 bp）与我国疫苗株CV777（2 364 bp）相比,存在16个核苷酸的插入和8个核苷酸的缺失,导致推导的氨基酸序列存在6个氨基酸的插入(56G、59QGVN62和69G)和6个氨基酸的缺失(73N、157FA158、380YL381和521G),且在2个主要中和抗体表位（aa499～637和aa763～770）有11处氨基酸的突变。遗传进化分析结果显示,LNSY-2017与主要的疫苗株同源性较低（91.4%～92.5%）,而与2012年韩国毒株、美国2013年毒株以及中国近年来流行毒株同源性最高（97.0%～98.7%）,属于基因G2b型。结果表明,沈阳地区的PEDV流行株已经发生很大变异,因此很有必要加强对PEDV变异的监测。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王宏燕

关键词: 猪流行性腹泻病毒,基因,序列分析,遗传进化分析

来源: 现代畜牧兽医 2019年04期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 辽宁省农业发展服务中心

分类号: S852.651

页码: 6-11

总页数: 6

文件大小: 3118K

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