论文摘要
目的:构建瞬时受体电位M8型(TRPM8)离子通道选择性滤器结构域的三维结构模型。方法:在Rosetta计算结构生物学工具包中,使用基于运动回路闭合算法的从头计算,对TRPM8离子通道选择性滤器结构域进行多轮计算建模。结果:经过9轮计算得到了能量最低且结构收敛的TRPM8通道选择性滤器结构域的三维结构模型,发现D918位点的侧链并不指向离子流过的孔区中心,而Q914、D920和T923位点的侧链指向孔区中心;糖基化位点N934位于孔区外侧,其侧链指向胞外水环境。结论:构建了TRPM8通道选择性滤器结构域的三维结构模型,为理解该通道的离子选择性及相关机制提供了较为可靠的结构信息。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 徐丽臻,杨帆
关键词: 瞬时受体电位通道,阳离子通道,氨基酸序列,计算机模拟
来源: 浙江大学学报(医学版) 2019年01期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技,基础科学
专业: 生物学
单位: 浙江大学医学院生物物理系
基金: 国家青年千人计划,国家自然科学基金(31741067,31800990)
分类号: Q617
页码: 19-24
总页数: 6
文件大小: 6734K
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标签：瞬时受体电位通道论文; 阳离子通道论文; 氨基酸序列论文; 计算机模拟论文;