2014—2018年猪流行性腹泻病毒N基因遗传变化分析

论文摘要

为了解猪流行性腹泻病毒（PEDV）N基因的分子流行病学情况,采用RT-PCR方法对2014—2018年采集到的河南、河北、山东、山西、甘肃、湖北、江西以及上海8省市共205份疑似PEDV阳性病料进行PEDV检测,使用RT-PCR方法扩增得到PEDV的N基因片段,回收PCR产物并与pMD20-T载体进行连接,挑选阳性克隆进行测序,分析研究PEDV遗传变异情况。结果显示,205份样品中,有191份样品为PEDV阳性,共得到19株PEDV的N基因序列,N基因全长均为1 326 bp,没有碱基的缺失和插入;将检测到的PEDV的N基因序列与国内外分离株进行比对发现,核苷酸的同源性为94.8%～99.5%,氨基酸的同源性为95.0%～99.3%。进化树分析发现,得到的19株N基因序列与CV777、CH-S等国内外毒株亲缘关系较远;其中,16株与MN、USA-Indiana-2013、USA-Iowa107-2013等近年分离株在一个分支上,为G2a亚群;CH-HENWZ-2015、CH-HENPY-2014、CH-HENZMDPY-2017这3株序列形成另一个分支,为G2b亚群。综上可知,我国PEDV流行广泛,病毒变异频繁。研究结果可为新型疫苗研发以及检测方法的建立奠定基础。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 邢广旭,焦文强,刘运超,王治方,王克领,徐引弟,李海利,张改平

关键词: 猪流行性腹泻病毒,基因,分子流行病学,序列分析

来源: 山西农业科学 2019年10期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 河南省农业科学院动物免疫学重点实验室,河南省农业科学院畜牧兽医研究所,河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室

基金: 河南省农业科学院自主创新基金项目(2019ZC40),病毒学国家重点实验室开放课题(2018KF002)

分类号: S852.651

页码: 1830-1833+1837

总页数: 5

文件大小: 3461K

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标签：猪流行性腹泻病毒论文;  基因论文;  分子流行病学论文;  序列分析论文;