基于基因芯片技术的转Slnac2基因拟南芥差异表达基因分析

基于基因芯片技术的转Slnac2基因拟南芥差异表达基因分析

论文摘要

NAC转录因子,对植物的生长发育及抵御逆境胁迫起着重要的作用。实验室前期克隆了辽宁碱蓬(Suaeda liaotungensis)Slnac2基因,转Slnac2拟南芥(Arabidopsis thaliana)提高了抵御盐胁迫的能力。本研究利用基因芯片技术筛选转SlNAC2拟南芥差异表达基因,共筛选出差异表达2倍以上的基因1 258个。GO富集度分析结果显示,分子功能相关基因占34.06%,细胞组分相关基因占33.13%,生物学过程相关基因占32.81%。KEGG分析表明,差异表达基因涉及63个信号通路,主要有植物激素信号转导、核糖体、植物病原物相互作用和抗坏血酸代谢等。通过实时荧光定量PCR对部分差异基因进行验证,所得结果与基因芯片结果一致。本研究揭示,SlNAC2可调控多个下游基因的表达,提高植物在逆境胁迫下的生存能力。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验材料
  •   1.2 幼苗培植
  •   1.3 总RNA的提取和检测
  •   1.4 RNA的放大和标记
  •   1.5 芯片杂交
  •   1.6 芯片扫描
  •   1.7 数据分析
  •   1.8 实时荧光定量PCR
  • 2 结果与分析
  •   2.1 样本总RNA提取及质量检测
  •   2.2 芯片扫描
  •   2.3 差异表达基因统计分析
  •   2.4 GO富集分析
  •   2.5 差异基因KEGG分析
  •   2.6 实时荧光定量PCR结果
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘雪嫣,屈芳芳,王宏飞,李秋莉

    关键词: 辽宁碱蓬,转录因子,基因芯片,转基因拟南芥,逆境胁迫

    来源: 激光生物学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 辽宁师范大学生命科学学院辽宁省植物生物技术重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31340052),辽宁省自然科学基金项目(201602456)

    分类号: Q943.2

    页码: 535-542

    总页数: 8

    文件大小: 1861K

    下载量: 79

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