猪流行性腹泻病毒野生株CH/JX226/2018的分离培养及抗病毒单链抗体研究

猪流行性腹泻病毒野生株CH/JX226/2018的分离培养及抗病毒单链抗体研究

论文摘要

猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)可引起急性、高度接触性的猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED,此病的主要临床症状为呕吐、腹泻、脱水性下痢等,尤其是新生仔猪的高致死率给养猪业带来严重的经济损失。近年来,PED在世界各地频繁暴发,众多研究表明,PEDV变异使现有疫苗不能提供足够的保护,是导致疫情加剧的主要原因之一,因此,加强对新变异毒株的研究对PEDV的防控具有重要意义。本论文从PEDV野毒株的分离鉴定、抗PEDV单链抗体的改造以及含单链抗体基因的猪胎儿成纤维细胞系的建立与鉴定进行了研究。1.PEDV毒株CH/JX226/2018的分离鉴定。从江西的某猪场采集了 9个疑似PEDV感染致死的仔猪的小肠等组织样品,用RT-PCR法鉴定其中5个样品为PEDV阳性。样品处理后,接种vero细胞,培养分离病毒,然后进行形态学和分子生物学鉴定。结果表明,盲传至第6代时,细胞上清中仍含有PEDV,将其命名为CH/JX226/2018。对分离株的S、ORF3、E及M基因进行扩增并测序,利用DNASTAR、MEGA7.0软件将其与GenBank上已公布的参考序列进行相似性对比分析,遗传进化树分析。结果表明,分离株CH/JX226/2018的S蛋白与参考毒株氨基酸的相似性在91.3%-98.9%之间,其中与CV777、LZC、SM98等传统型毒株的相似性分别为92.7%、91.8%、91.3%,与2014年流行的YC2014毒株的S蛋白相似性最高,为98.9%。S基因遗传进化树分析结果同样表明,该分离株与传统型毒株如CV777等亲缘关系较远,与近年来流行性毒株YC2014等的亲缘关系较近。2.抗病毒单链抗体的改造。利用定点突变等方法,对实验室抗PEDV的单链抗体(scFv)的重链和轻链之间的linker(Gly4Se)3进行定点突变,分别得到linker为Gly4Ser的突变体v1,linker为GlySer的突变体v2,以及缺失linker的突变体v3。分别将其测序鉴定,并利用原核表达系统大肠杆菌BL21(DE3)进行表达,优化后的表达条件为37℃,终浓度为0.6 mM的IPTG诱导表达7 h。目标蛋白表达效率与未改造的scfv相当。经SDS-PAGE及Western Blot鉴定正确表达后,用非竞争性Elisa法检测各突变体与CH/JX226/2018毒株的结合能力,结果表明,scFv结合活性明显大于v1、v2、v3,而v1、v2、v3之间没有明显差异。3.含单链抗体基因的猪胎儿成纤维细胞系的建立与鉴定。用与CH/JX226/2018毒株结合活性高的抗PEDV的scFv为目的基因,设计含有猪ROSE26位点的同源臂、HLF启动子、带有Cre基因和同向的两个Loxp、Neo正向筛选标记、DTA负向筛选标记等的基因打靶载体,利用核转仪,当原代胎儿成纤维细胞的培养到F3代时,选择程序A-003进行转染,经过G418筛选,共得到86个克隆点细胞。设计跨同源臂引物,进行PCR扩增,结果表明成功筛选到1株长白雌性的原代胎儿成纤维单克隆细胞系,基因打靶的中靶率为1.2%,为抗PEDV的scFv转基因猪的制备提供了基础材料。

论文目录

  • 致谢
  • 摘要
  • 第一部分
  •   1 文献综述
  •     1.1 猪流行性腹泻研究进展
  •       1.1.1 猪流行性腹泻概述
  •       1.1.2 猪流行性腹泻病毒的概述
  •       1.1.3 PEDV体外分离培养
  •     1.2 单链抗体的研究进展
  •       1.2.1 抗体的发展历程
  •       1.2.2 单链抗体的简介
  •       1.2.3 单链抗体连接肽的研究进展
  •     1.3 基因打靶技术
  •       1.3.1 基因打靶技术简介
  •       1.3.2 基因打靶技术应用的发展历史
  •       1.3.3 基因打靶技术的打靶效率
  •     1.4 研究目的及意义
  • 第一章 猪流行性腹泻的野毒株的分离、鉴定及序列分析
  •   1 实验材料与设备
  •     1.1 菌株及细胞
  •     1.2 主要试剂及试剂盒
  •     1.3 实验设备
  •     1.4 主要溶液配方
  •     1.5 分析软件与网站
  •     1.6 病料的采集
  •   2 实验方法
  •     2.1 病料的处理
  •     2.2 病毒分离培养
  •     2.3 病毒的鉴定
  •       2.3.1 病毒RNA的提取
  •       2.3.2 RNA反转录
  •       2.3.3 病毒PCR鉴定
  •     2.4 S、ORF3、E、M基因的序列的扩增
  •     2.5 序列比对与分析
  •   3 结果与分析
  •     3.1 病猪小肠组织及内含物内PEDV的检测
  •     3.2 病毒的分离培养
  •     3.3 S、ORF3、E、M基因的扩增
  •     3.4 序列分析
  •       3.4.1 S基因的遗传进化分析
  •       3.4.2 S蛋白的相似性分析
  •       3.4.3 ORF3基因的遗传进化分析
  •       3.4.4 ORF3氨基酸相似性分析
  •       3.4.5 M基因的遗传进化分析
  •       3.4.6 M蛋白的相似性分析
  •   4 讨论
  • 第二章 不同长度连接肽的scFv与PEDV结合活性研究
  •   1 实验材料与设备
  •     1.1 菌株及质粒
  •     1.2 主要试剂及试剂盒
  •     1.3 主要实验设备
  •     1.4 主要溶液配方
  •   2 实验方法
  •     2.1 scFv载体突变体v1、v2、v3的构建
  •       2.1.1 引物设计
  •       2.1.2 PCR扩增
  •       2.1.3 转化
  •     2.2 原核表达与鉴定
  •       2.2.1 转化
  •       2.2.2 诱导条件的验证与优化
  •       2.2.3 蛋白的提取及复性
  •       2.2.4 复性后的蛋白的鉴定
  •     2.3 scFv的结合活性的检测
  •   3 结果与分析
  •     3.1 不同长度linker的突变体v1,v2,v3构建
  •     3.2 scFv、v1、v2、v3的原核表达与鉴定
  •       3.2.1 表达载体诱导条件的优化
  •       3.2.3 复性蛋白的SDS PAGE及Western Blot鉴定
  •     3.3 scFv的结合活性的检测
  •   4 讨论
  • 第三章 scFv基因猪原代细胞单克隆筛选与鉴定
  •   1 实验材料与设备
  •     1.1 主要试剂及试剂盒
  •     1.2 实验设备
  •       1.1.2 实验细胞
  •       1.1.3 常用培养基及溶液配制
  •   2 实验方法
  •     2.1 设计并构建载体
  •     2.2 大量提取质粒
  •     2.3 猪胎儿成纤维细胞的传代、培养与冻存
  •     2.4 转染猪胎儿成纤维细胞
  •     2.5 猪胎儿成纤维细胞转染后的筛选
  •     2.6 微量细胞基因组DNA的提取
  •     2.7 抗性细胞克隆点的鉴定
  •   3 结果与分析
  •     3.1 构建载体
  •     3.2 G418筛选得到单克隆
  •     3.3 猪胎儿成纤维细胞克隆点的鉴定
  •   4 讨论
  • 全文总结
  • 参考文献
  • Abstract
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 尹志安

    导师: 杨国庆

    关键词: 猪流行性腹泻病毒,单链抗体,连接肽,基因打靶载体,猪原代胎儿成纤维细胞系

    来源: 河南农业大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 河南农业大学

    分类号: S852.651

    DOI: 10.27117/d.cnki.ghenu.2019.000233

    总页数: 55

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