基于DNA宏条形码的莼菜大田土壤真菌多样性研究

基于DNA宏条形码的莼菜大田土壤真菌多样性研究

论文摘要

高通量测序与DNA条形码结合产生的DNA宏条形码技术(DNA-Metabarcoding),能快速鉴定混合样本中的物种,现已成为检测群类物种多样性和丰富度的常用方法.本试验采用这一方法分析了莼菜大田不同种植年限土壤真菌多样性,结果表明:10年生土壤中含有最多的真菌种类,多样性及丰富度最高;在属水平上表现为蛙粪霉属、裂梗霉属、酵母属等占优势;群类组成分析显示,种植年限的变化对土壤真菌群落组成有一定的影响;聚类分析中10年与15年生莼菜土壤物种多样性相似度较高.

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品采集与准备
  •   1.2 样品总DNA提取
  •   1.3 PCR扩增及测序
  •   1.4 数据处理与分析
  •     1.4.1 原始数据整理、 过滤及质量评估
  •     1.4.2 OTU划分和分类地位鉴定
  •     1.4.3 Alpha多样性分析
  •     1.4.4 分类学组成分析
  • 2 结 果
  •   2.1 OTU分类学鉴定
  •   2.2 Alpha多样性分析
  •   2.3 不同年限莼菜土壤真菌群落的组成
  • 3 结论与讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 滕左,宋春红,于杰

    关键词: 种植年限,莼菜,条形码,高通量测序,鉴定

    来源: 西南大学学报(自然科学版) 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,园艺

    单位: 西南大学园艺园林学院,中国烟草总公司重庆市公司彭水分公司

    基金: 重庆市社会事业与民生保障科技创新专项项目(cstc2017shms-kjfp80009),西南大学石柱创新基金项目,校县合作项目(Sz201802)

    分类号: S154.3;S645.9

    DOI: 10.13718/j.cnki.xdzk.2019.09.007

    页码: 52-58

    总页数: 7

    文件大小: 572K

    下载量: 135

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