辣椒健康植株与患枯萎病植株根际土壤细菌群落多样性的比较研究

辣椒健康植株与患枯萎病植株根际土壤细菌群落多样性的比较研究

论文摘要

【目的】分析辣椒健康植株和患枯萎病植株根际土壤中细菌群落多样性,为辣椒枯萎病生态防控提供理论依据。【方法】采集漳州3个辣椒种植基地枯萎病典型患病样地的健康植株根际土壤(JK)和患病植株根际土壤(KW),对土样中的细菌群落进行基于Illumina Miseq测序平台的宏基因组高通量测序,明确健康辣椒植株与枯萎病患病植株根际土壤细菌多样性。【结果】患枯萎病植株根际土壤细菌的优质序列比健康植株少14 376条,OTUs少1 239个。在门水平上,健康植株和患病植株根际土壤微生物组成相似,但相对丰度存在差异。在属水平上,健康植株根际的鞘氨醇单孢菌属Sphingomonas相对丰度比患病植株增加了5.05百分点;而金属细菌属Metallibacterium相对丰度比患病植株减少了6.09百分点。部分物种丰度分析表明患病辣椒土壤根际中壤红杆菌属Solirubrobacter、小双孢菌属Microbispora、短链球孢囊菌属Catelliglobosispora和假双头斧形菌属Pseudolabrys等4个属的物种丰度低于健康辣椒。【结论】辣椒患病植株根际土壤中的细菌群落结构发生改变及物种丰度降低是辣椒枯萎病患病的重要特征,提示早期添加优势益生菌是防控辣椒枯萎病的新思路。

论文目录

  • 0 引言
  • 1 材料和方法
  •   1.1 供试材料
  •   1.2 DNA提取、PCR扩增和测序
  •   1.3 序列数据分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 Alpha多样性分析和OTUs(Operational Taxonomic Units)差异比较
  •   2.2 细菌群落组成比较
  •   2.3 物种丰度差异分析
  • 3 讨论与结论
  •   3.1 讨论
  •   3.2 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 赖宝春,戴瑞卿,吴振强,李丰,林德峰,王家瑞

    关键词: 辣椒枯萎病,根际土壤,高通量测序,细菌多样性

    来源: 福建农业学报 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,园艺

    单位: 福建省漳州市农业科学研究所

    基金: 福建省科技计划项目(2017N0042)

    分类号: S154.3;S641.3

    DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2019.09.012

    页码: 1073-1080

    总页数: 8

    文件大小: 1524K

    下载量: 103

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