导读:本文包含了克隆测序论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,巴马,单倍体,信息学,序论,浮游生物,病毒。
克隆测序论文文献综述
龙熙,张廷焕,赵久刚,蓝静,柴捷[1]（2018）在《猪EIF2S3基因克隆测序及其组织表达谱分析》一文中研究指出【目的】克隆猪EIF2S3基因mRNA全长,并进行生物信息学分析及检测其在猪各组织中的表达特征,为研究真核翻译起始因子2(eIF2)蛋白γ亚基的生物学功能打下基础。【方法】以荣昌猪胸腺mRNA为模板,采用RCAE-PCR克隆EIF2S3基因的m RNA全长序列,在线完成各种生物信息学分析后,利用实时荧光定量PCR分析猪EIF2S3基因的组织表达特征。【结果】猪EIF2S3基因mRNA全长1813 bp,其中蛋白质编码区(CDS)长1419 bp,5'UTR区、3'UTR区分别长14和380 bp,编码472个氨基酸。EIF2S3蛋白分子量51.1 kD,理论等电点(pI)8.62,包含58个带正电的氨基酸和52个带负电的氨基酸,其前体蛋白靠近N端区域有一个强疏水区;EIF2S3蛋白的空间结构由α-螺旋、β-折迭、延伸及无规则卷曲构成。EIF2S3蛋白氨基酸序列与狗和大白鼠的相似性最高(99.6%),其次是马、猫、牛、羊和人类(99.4%),与斑马鱼的相似性最低(96.6%)。EIF2S3基因在猪的心脏、胸腺和淋巴组织中表达量较高,在脾脏和肌肉中呈中度表达,在肾脏中的表达量较低,而在肝脏中基本不表达。【结论】猪EIF2S3基因全长1813 bp,在核酸和氨基酸水平上与其他物种的EIF2S3基因高度同源,尤其与狗和大白鼠的遗传距离最近;其在猪心脏、胸腺和淋巴组织中的表达量较高,在肝脏中基本不表达,据此推测EIF2S3参与合成的蛋白更多地参与心脏泵血和免疫相关功能,基本不发挥能量代谢功能。(本文来源于《南方农业学报》期刊2018年10期）
韩昊莹,郑慧华,陈红英[2]（2018）在《FAV-4 Hexon全基因的扩增、克隆、测序及遗传进化分析》一文中研究指出引言FAV-4是引起禽心包积水-包涵体肝炎综合征的主要病毒,多呈急性暴发,引发鸡群的其他鸡只感染,本病主要发生于3～5周龄的肉鸡、麻鸡,也偶见于蛋鸡。根据群特异性抗原,禽腺病毒可分为3个群,FAV-4属于禽腺病毒Ⅰ群,非折迭的二十面体结构,病毒粒子大小在70～90nm之间。该病毒粒子有252个衣壳粒,包含240个六邻体(Hexon)和12个五邻体(顶点衣壳粒)~([1])。已证实Hexon蛋白(本文来源于《中国畜牧兽医学会2018年学术年会禽病学分会第十九次学术研讨会论文集》期刊2018-11-21）
郭奎,徐朋丽,赵宇,郑慧华,杨明凡[3]（2018）在《PCV3河南株Cap基因的克隆、测序及其在大肠杆菌中的表达》一文中研究指出为研究猪圆环病毒3型(PCV3)Cap基因在大肠杆菌中的表达产物是否具有免疫原性,根据GenBank中发表的PCV3基因组序列,设计1对特异性引物,PCR扩增PCV3 Cap基因,克隆到pMD18-T载体。测序结果表明获得了Cap基因,其大小为543bp。并将Cap亚克隆到原核表达载体pET-28a中,再转化入大肠杆菌Rosetta(DE3)中,获得重组菌株。获得的重组菌37℃、0.6mmol/L IPTG诱导6h,进行SDS-PAGE及Western blot分析。重组菌破碎后从沉淀中获取1条约24 600的新蛋白带,可与小鼠抗His单克隆抗体发生特异性反应。有研究表明PCV3与PCV2不具有免疫交叉保护作用,因此本试验表达的具有良好的抗原性PCV3 Cap蛋白,为PCV3新型亚单位疫苗和ELISA诊断试剂盒的研制奠定了基础。(本文来源于《中国兽医学报》期刊2018年11期）
邢漫萍,黄丽丽,王峰,郑心力,林哲敏[4]（2018）在《海南文昌鸡生长激素基因克隆测序及生物信息学分析》一文中研究指出为了克隆文昌鸡的生长激素(growth hormone,GH)基因,获得该基因序列并分析基因结构和相关遗传变异,采用PCR方法扩增GH基因组序列,通过克隆测序寻找基因中的突变位点,利用PCR产物直接测序检测GH基因的多态性。结果显示:在鸡GH基因组中共发现7处碱基突变位点,分别位于GH基因的5'端、第1内含子、第4外显子和第4内含子中;多态性分析发现,在GH基因-391 bp处的A/G突变位点、-360bp处的A/G突变位点、-121 bp处的C/T突变位点上,文昌鸡的优势基因型分别是AA、GG和CC;鸡GH基因启动子区域发现多种潜在的转录因子结合位点,如GATA序列结合因子1(GATA-binding factor 1,GATA-1)、环磷酸腺苷应答元件结合蛋白(c AMP response element-binding protein,CREB)、核因子1(nuclear factor 1,NF-1)、上游刺激因子(upstream stimulatory factor,USF)、增强子结合蛋白α(CCAAT/enhancer binding protein alpha,C/EBPalp)等。本试验为进一步研究文昌鸡GH基因的功能提供了参考。(本文来源于《畜牧与兽医》期刊2018年10期）
焦文强,徐引弟,王治方,张青娴,朱文豪[5]（2018）在《我国部分省份猪流行性腹泻病毒M基因的克隆测序及遗传进化分析》一文中研究指出为了解我国部分省份猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传进化情况,试验采用RT-PCR方法对2014—2017年采集的源自河南、河北、山西、山东、甘肃、湖北、江西等地区不同猪场的98份腹泻样品进行了PEDV检测,并对25份PEDV阳性样品进行M基因的克隆与测序和遗传进化分析。结果表明:25株M基因序列长度均为618 bp;25株M基因序列间核苷酸同源性为98.2%~100%,其编码的氨基酸序列同源性为97.8%~99.6%,与经典毒株CV777及国内外流行毒株核苷酸同源性为97.7%~98.6%,氨基酸序列的同源性分别为97.8%~98.7%;25株M基因序列与国内外早期分离株(如CV777、CH/S等代表毒株)不在一个进化分支上,与近年来分离株处在一个进化分支上。说明PEDV M基因一直处于变异进化过程中。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2018年17期）
徐亚欧,梅寒,徐珑洋,王志敏,王英明[6]（2018）在《藏鸡POU1F1基因的克隆测序及生物信息学分析》一文中研究指出为研究青藏高原特有鸡种,藏鸡的生物学特性,从藏鸡垂体组织的RNA中克隆POU1F1基因,并利用生物信息学对其进行分析.结果显示,藏鸡POU1F1基因开放阅读框(ORF)长为984bp,编码327个氨基酸.编码序列中有13个丝氨酸(Ser)、2个酪氨酸(Tyr)、6个苏氨酸(Thr)磷酸化位点;1个N糖基化位点;二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成;藏鸡POU1F1氨基酸序列与红色原鸡POU1F1氨基酸序列的亲缘关系最近.藏鸡POU1F1基因氨基酸序列可能与藏鸡生长速度慢的特性相关.这一研究结果为今后的藏鸡育种工作提供重要的靶点和参考.(本文来源于《西南民族大学学报(自然科学版)》期刊2018年04期）
陈园园,郝莹,张瑾,张鑫,谢坤铭[7]（2018）在《基于毛细管电泳的片段分析和克隆测序在脊髓小脑共济失调动态突变检测中的应用研究》一文中研究指出目的探讨基于毛细管电泳的片段分析和克隆测序在脊髓小脑共济失调(SCA)动态突变检测中的准确性和稳定性。方法采用基于毛细管电泳的片段分析和克隆测序对14例脊髓小脑共济失调患者(包括3例SCA2型、2例SCA7型、7例SCA8型和2例SCA17型)致病基因叁核苷酸重复序列进行检测。结果 3例SCA2基因样本基于毛细管电泳的片段分析显示,扩展片段胞嘧啶-腺嘌呤-鸟嘌呤(CAG)重复序列分别为31、30和32次,每例样本取3个菌落进行克隆测序,CAG重复序列分别为37/40/40、37/38/39和38/39/40次;2例SCA7基因样本基于毛细管电泳的片段分析显示,扩展片段CAG重复序列分别为57和34次,1例取3个菌落进行克隆测序,CAG重复序列为69、74和75次,1例为45次;7例SCA8基因样本基于毛细管电泳的片段分析显示,扩展片段胞嘧啶-胸腺嘧啶-腺嘌呤(CTA)/胞嘧啶-胸腺嘧啶-鸟嘌呤(CTG)重复序列分别为99、111、104、92、89、104和75次,克隆测序分别为97、116、104、90、90、102和76次;2例SCA17基因样本基于毛细管电泳的片段分析显示,短片段/扩展片段CAG重复序列为37/50和36/45次,扩展片段分别取3和2个菌落进行克隆测序,CAG重复序列为51/50/52和45/44次。结论基于毛细管电泳的片段分析在判读重复序列时存在一定偏倚,但可以预估,可重复性佳,不影响基因检测结果的判定;而克隆测序具有明显不稳定性,尤其是SCA2和SCA7基因,可能与其重复序列组成较为单纯有关。克隆测序不适宜作为检测基因动态突变的方法,更不适宜作为判定动态突变序列组成的标准。(本文来源于《中国现代神经疾病杂志》期刊2018年03期）
张广杰,崔悦悦,邱庆庆,夏琴,李龙[8]（2018）在《广西巴马小型猪SP1基因克隆测序及其真核表达载体的构建》一文中研究指出【目的】克隆广西巴马小型猪特异性蛋白1(SP1)基因,并构建其真核表达载体,为揭示其对猪生长发育的调控机理打下基础。【方法】利用RT-PCR从广西巴马小型猪背最长肌组织中扩增SP1基因,采用DNASTAR、TMHMM等分别进行基因生物信息学分析;以p EGFP-N1质粒构建真核表达载体pEGFP-N1-SP1并转染293T细胞,于转染48 h后在倒置荧光显微镜下观察并拍照。【结果】克隆获得的广西巴马小型猪SP1基因与Gen Bank中野猪(Sus scrofa)的参考序列(XM_005652569.3)一致,未发现碱基突变位点;其编码序列(CDS)全长2340 bp,编码779个氨基酸。广西巴马小型猪SP1蛋白不存在跨膜结构,也不存在信号肽,不属于分泌型蛋白;其二级结构中α-螺旋占17.84%,延伸链占21.31%,β-转角占9.76%,无规则卷曲占51.09%。构建的真核表达载体pEGFP-N1-SP1能成功转染至293T细胞中并表达出绿色荧光蛋白。【结论】广西巴马小型猪SP1基因CDS序列编码蛋白主要参与细胞内活动,而非外分泌型蛋白,以SP1基因构建的真核表达载体pEGFP-N1-SP1能转染293T细胞并成功表达,可直接用于后期SP1基因功能探索及干扰表达等研究。(本文来源于《南方农业学报》期刊2018年02期）
于淑贤,李文军,李楠,李富超,王寅初[9]（2018）在《ITS克隆测序揭示中国沿海表层水中真核浮游生物多样性》一文中研究指出表层水体中的浮游生物群落在生物地球化学过程中起重要作用,其生物地理分布通常与水文等环境条件相关。近年来DNA测序等方法已成为研究海洋生态系统中真核生物群落的重要工具,在本研究中采用ITS1作为DNA标记评估我国沿海表层水中的真核浮游生物多样性。BLAST结果表明,大部分ITS1序列隶属于6个真核类群,包括浮游动物、真菌和囊泡虫类等。这些主要的真核生物类群可以将采样点分为显着不同的5个聚类,而每个聚类中的特征真核生物门类表现出显着的地理分布差异。总体上,真核浮游生物群落的多样性水平与经纬度、水深、温盐等参数显着相关,自北向南有显着升高的趋势。真核生物群落差异(β-多样性)随地理距离的增加而加大。这提示真核浮游生物在我国沿海表层水中显示出地理限制。本文为中国沿海浮游生物的生物地理研究提供了分子生物学数据基础。(本文来源于《海洋科学进展》期刊2018年01期）
邓志辉,夏华动,张国彬,陈瑞,蔡思齐[10]（2017）在《KIR 3DL3基因cDNA分子克隆测序法鉴定1个常见型新等位基因》一文中研究指出目的建立KIR3DL3基因c DNA分子克隆测序方法,鉴定在南方汉族人群中新发现的1个KIR3DL3等位基因。方法对1例KIR3DL3基因测序分型结果异常的标本,采集EDTA抗凝新鲜外周血样,提取mRNA,反转录成c DNA后,采用1对KIR3DL3基因特异性PCR引物对全部编码区序列做PCR扩增,扩增产物经切胶回收纯化后,做分子克隆和单体型测序。结果经分子克隆和测序,检出1个正常的KIR3DL3*01002等位基因和1个新变异的KIR3DL3等位基因,该新等位基因的序列与KIR3DL3*048最相近,但存在编码区(CDS)nt 1074 A>G同义突变,位于第8外显子的第337密码子由CAA变成CAG,其序列提交国际Gen Bank(序列号:KU529269)和IPD-KIR Database(IWS40002178),已被世界卫生组织(WHO)HLA因子命名委员会KIR分委会正式命名为KIR3DL3*04802,该新等位基因在306名南方汉族无关个体中共检出12次,检出频率为3.92%。结论成功建立KIR3DL3基因c DNA分子克隆测序方法,在等位基因水平的KIR研究中具有良好的应用前景。(本文来源于《中国输血杂志》期刊2017年10期）
克隆测序论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
引言FAV-4是引起禽心包积水-包涵体肝炎综合征的主要病毒,多呈急性暴发,引发鸡群的其他鸡只感染,本病主要发生于3～5周龄的肉鸡、麻鸡,也偶见于蛋鸡。根据群特异性抗原,禽腺病毒可分为3个群,FAV-4属于禽腺病毒Ⅰ群,非折迭的二十面体结构,病毒粒子大小在70～90nm之间。该病毒粒子有252个衣壳粒,包含240个六邻体(Hexon)和12个五邻体(顶点衣壳粒)~([1])。已证实Hexon蛋白
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
克隆测序论文参考文献
[1].龙熙,张廷焕,赵久刚,蓝静,柴捷.猪EIF2S3基因克隆测序及其组织表达谱分析[J].南方农业学报.2018
[2].韩昊莹,郑慧华,陈红英.FAV-4Hexon全基因的扩增、克隆、测序及遗传进化分析[C].中国畜牧兽医学会2018年学术年会禽病学分会第十九次学术研讨会论文集.2018
[3].郭奎,徐朋丽,赵宇,郑慧华,杨明凡.PCV3河南株Cap基因的克隆、测序及其在大肠杆菌中的表达[J].中国兽医学报.2018
[4].邢漫萍,黄丽丽,王峰,郑心力,林哲敏.海南文昌鸡生长激素基因克隆测序及生物信息学分析[J].畜牧与兽医.2018
[5].焦文强,徐引弟,王治方,张青娴,朱文豪.我国部分省份猪流行性腹泻病毒M基因的克隆测序及遗传进化分析[J].黑龙江畜牧兽医.2018
[6].徐亚欧,梅寒,徐珑洋,王志敏,王英明.藏鸡POU1F1基因的克隆测序及生物信息学分析[J].西南民族大学学报(自然科学版).2018
[7].陈园园,郝莹,张瑾,张鑫,谢坤铭.基于毛细管电泳的片段分析和克隆测序在脊髓小脑共济失调动态突变检测中的应用研究[J].中国现代神经疾病杂志.2018
[8].张广杰,崔悦悦,邱庆庆,夏琴,李龙.广西巴马小型猪SP1基因克隆测序及其真核表达载体的构建[J].南方农业学报.2018
[9].于淑贤,李文军,李楠,李富超,王寅初.ITS克隆测序揭示中国沿海表层水中真核浮游生物多样性[J].海洋科学进展.2018
[10].邓志辉,夏华动,张国彬,陈瑞,蔡思齐.KIR3DL3基因cDNA分子克隆测序法鉴定1个常见型新等位基因[J].中国输血杂志.2017
论文知识图
