基于高通量测序技术研究云南玉米根际微生物群落多样性

基于高通量测序技术研究云南玉米根际微生物群落多样性

论文摘要

研究不同海拔高度和玉米品种类型对玉米根际微生物多样性的影响,利用Illumina Miseq高通量测序对云南不同海拔和品种类型的玉米根际细菌和真菌多样性进行分析。玉米根际细菌和真菌OTU数量和Chao1指数随海拔升高而增加,且饲料玉米高于鲜食玉米,不同海拔和品种类型的玉米根际微生物多样性差异明显。玉米根际细菌的优势菌群为变形菌门、拟杆菌门和放线菌门,鞘氨醇单胞菌属(5.91%)和芽孢杆菌属(8.88%)为玉米根际的优势属,但高海拔地区的玉米根际特异检测到芽单胞菌属(4.34%);水恒杆菌属(6.10%)为鲜食玉米的优势属;玉米根际真菌的优势菌群为子囊菌门、担子菌门和接合菌门,被孢霉(7.42%)、镰孢霉属(10.88%)和青霉菌属(4.03%)是优势属。海拔高度和品种类型是影响玉米根际微生物群落多样性的重要因子。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 基因组DNA的提取
  •     1.2.2 PCR扩增
  •     1.2.3 数据分析
  • 2 结果
  •   2.1 玉米根际微生物群落结构丰度与多样性分析
  •     2.1.1 Alpha多样性
  •     2.1.2 Beta多样性
  •   2.2 细菌群落分布特征分析
  •     2.2.1 玉米根际细菌群落在门水平上的组成和相对丰度
  •     2.2.2 玉米根际真菌群落在属水平上的组成和相对丰度
  •   2.3 真菌群落分布特征分析
  •     2.3.1 玉米根际真菌群落在门水平上的组成和相对丰度
  •     2.3.2 玉米根际真菌群落在属水平上的组成和相对丰度
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 汪娅婷,付丽娜,姬广海,杨俊,王星,张晋豪,王彦芳,刘棋

    关键词: 海拔,品种类型,玉米根际微生物,多样性,高通量测序

    来源: 江西农业大学学报 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学,农作物

    单位: 云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室

    基金: 国家重点研发计划项目(2018YFD0200703)~~

    分类号: S154.3;S513

    DOI: 10.13836/j.jjau.2019058

    页码: 491-500

    总页数: 10

    文件大小: 1685K

    下载量: 914

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