辣椒脱落酸合成相关酶基因的鉴定与表达分析

辣椒脱落酸合成相关酶基因的鉴定与表达分析

论文摘要

类胡萝卜素裂解双加氧酶基因家族的9-顺-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)是脱落酸合成的关键酶类。利用生物信息学方法,鉴定辣椒脱落酸合成相关酶家族基因,并对基因结构、进化、功能和时空表达进行分析。研究发现,辣椒基因组中包含3个NCED基因和6个CCD基因,NCED基因不含内含子,CCD基因含有多个内含子;归为5个聚类组,与同为双子叶植物的拟南芥基因亲缘关系较近;CaNCED1具有与VP14类似的三维结构和催化基团;基因启动子区发现多个激素响应元件、环境胁迫响应元件;CaNCED1、CaCCD1a和CaCCD1b在辣椒各器官和果实成熟的各阶段均显示较高表达。该研究为辣椒ABA合成相关酶基因的功能分析和遗传育种应用提供了科学依据。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 基因序列的获取与鉴定
  •   1.2 基因和蛋白结构及聚类分析
  •   1.3 蛋白功能分析
  •   1.4 基因启动子区特征分析
  •   1.5 基因组织表达分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 基因序列的获取与鉴定
  •   3.2 基因的结构与进化分析
  •   3.3 蛋白三维模型结构预测
  •   3.4 基因启动子区特征分析
  •   3.5 基因的组织表达分析
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘潮,韩利红,褚洪龙,代冬琴,王海波,唐利洲

    关键词: 辣椒,顺环氧类胡萝卜素双加氧酶,脱落酸,基因表达

    来源: 分子植物育种 2019年15期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,园艺

    单位: 曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心云南省高校云贵高原动植物多样性及生态适应性进化重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31760013,31860057,31860005),云南省地方本科高校基础研究联合专项(2017FH001-034,2017FH001-037),国家级大学生创新创业训练计划项目(201610684004,201710684012)共同资助

    分类号: S641.3;Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.004908

    页码: 4908-4914

    总页数: 7

    文件大小: 1231K

    下载量: 188

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