万顺铅锌矿区蜈蚣草内生细菌砷氧化基因(aox B)的多样性分析

万顺铅锌矿区蜈蚣草内生细菌砷氧化基因(aox B)的多样性分析

论文摘要

【背景】近年来,由于金属矿的开采和冶炼、砷产品的加工与使用、煤的燃烧等各种因素,导致土壤环境中的砷污染越来越严重,导致许多人暴露于极度危险的砷毒毒害之下。【目的】研究四川的万顺铅锌矿区蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因的多样性,为提高土壤重金属污染生态修复效率提供理论依据。【方法】利用实时荧光定量PCR (Real-time quantitative PCR,qPCR)和限制性片段长度多态性(Restriction fragment length polymorphism,RFLP)技术,对四川省汉源县万顺铅锌矿区蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因表达量及多样性进行研究。【结果】qPCR结果表明,不同采样点间的蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因表达量存在明显差异,表现为选矿区>进山口>弃渣场>尾矿区>矿口。酶切图谱结果表明,不同采样点蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因多样性存在明显差异,多样性指数表现为尾矿>矿口>弃渣场>进山口>选矿区。Pearson相关分析显示,aoxB基因的表达量与重金属As之间呈显著负相关(P<0.05),多样性指数则与重金属Pb和As之间呈极显著正相关(P<0.01)。系统发育分析显示,aoxB基因的优势菌群为α-变形菌门(Alphaproteobacteria)。【结论】蜈蚣草根组织中存在丰富的含aoxB基因内生细菌种群,这些内生细菌表现出潜在的应用价值。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 采样点简介及采样方法
  •   1.2 主要试剂和仪器
  •   1.3 实验方法
  •     1.3.1 蜈蚣草根组织重金属浓度分析
  •     1.3.2 蜈蚣草根组织总DNA的提取
  •     1.3.3 蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因的检测和分析
  •     1.3.4 aoxB基因定量分析
  •     1.3.5 蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因克隆
  •     1.3.6 蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因RFLP酶切
  •     1.3.7 数据处理与分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 蜈蚣草根内生细菌aoxB基因检测
  •   2.2 aoxB基因酶切图谱分析
  •   2.3 aoxB基因系统发育学分析
  •   2.4 aoxB基因酶切图谱多样性指数、丰富度指数、均匀度指数和酶切类型分析
  •   2.5 重金属与蜈蚣草根组织内生细菌aoxB基因多样性、丰富度、均匀度及拷贝数相关性分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 孙一好,陆巧灵,高雪,尼玛扎西,周敬明,王蓥燕,张小平,辜运富

    关键词: 铅锌矿区,蜈蚣草,内生细菌,多样性

    来源: 微生物学通报 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 生物学,环境科学与资源利用

    单位: 四川农业大学资源学院微生物系,四川农业大学水稻研究所,西藏自治区农牧科学院农业资源与环境研究所

    基金: 中国西藏自治区科技厅科技计划课题(2017B-1)~~

    分类号: X172;X53

    DOI: 10.13344/j.microbiol.china.180700

    页码: 2175-2185

    总页数: 11

    文件大小: 728K

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