吲哚胺2,3-双加氧化酶Ⅰ与抑制剂INCB024360作用的分子动力学研究

吲哚胺2,3-双加氧化酶Ⅰ与抑制剂INCB024360作用的分子动力学研究

论文摘要

INCB024360是进入临床试验的吲哚胺2,3-双加氧化酶Ⅰ(IDO1)抑制剂之一,但其结合机理尚不明晰。本文运用分子对接、分子动力学、自由能计算和丙氨酸突变扫描方法研究了IDO1和INCB024360的结合模式。结果表明,IDO1和INCB024360的复合物形成了6个氢键,结合自由能为-70. 82 k J/mol,静电作用力是主要驱动力,极性溶剂化能是主要抑制力;丙氨酸突变扫描发现,Ser263和Glu171是两者结合的关键氨基酸,ΔΔGbind值分别为15. 35和54. 39 k J/mol。本文的结果可为阐明IDO1和INCB02436结合的分子机制提供重要依据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 模型的建立
  •   1.2 分子对接
  •   1.3 分子动力学模拟
  •   1.4 结合自由能的计算和能量分解
  •   1.5 丙氨酸突变扫描
  • 2 结果和分析
  •   2.1 分子对接
  •   2.2 分子动力学模拟结果
  •   2.3 结合自由能
  •   2.4 IDOI残基能量分解
  •   2.5 丙氨酸突变扫描结果
  •   2.6 结果分析
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 邓培渊,孔庆寒,袁伟,李长看

    关键词: 吲哚胺,双加氧化酶,分子对接,分子动力学,丙氨酸突变扫描

    来源: 化学通报 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,医药卫生科技

    专业: 化学,药学

    单位: 郑州师范学院郑州市生物物种资源研究重点实验室,华北水利水电大学环境与市政工程学院

    基金: 河南省高校重点科研项目(20A180032)资助

    分类号: R96;O643.12

    DOI: 10.14159/j.cnki.0441-3776.2019.12.010

    页码: 1110-1114

    总页数: 5

    文件大小: 174K

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