东北地区水稻纹枯病菌致病性及遗传多样性分析

东北地区水稻纹枯病菌致病性及遗传多样性分析

论文摘要

为明确东北地区水稻纹枯病菌致病性及其群体遗传多样性,将2018年采自东北三省13个水稻主产区的病样分离纯化,共获得176个立枯丝核菌菌株。采用离体叶片接种法测定菌株致病力,利用SRAP分子标记技术分析其遗传多样性。致病力测定结果表明,东北三省各地区菌株致病力存在分化现象,供试的176个菌株中,强致病力菌株占全部菌株23.3%;中等致病力菌株占61.9%;弱致病力菌株占14.8%。地理来源与致病力无明显相关性。根据UPGMA聚类分析,当相似系数为0.63时,176个菌株被划分为6个类群。聚类结果与地理来源具有相关性,但与致病力无明显相关性。利用16对SRAP引物分析176个立枯丝核菌菌株遗传多样性,共得到2 237个扩增条带,多态性频率为82.16%;基因多样度(h)、Shannon信息指数(I)分别为0.2827、0.4150。东北各地区立枯丝核菌群体间遗传距离与地理距离呈一定正相关。群体遗传分化系数Gst=0.3319,基因流Nm=1.0063,说明东北地区立枯丝核菌群体遗传分化度较高且群体间存在基因交流。AMOVA分析结果表明,群体内遗传分化为67.84%,遗传变异主要发生在群体内部。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 致病性测定
  •     1.2.2 立枯丝核菌基因组DNA提取
  •     1.2.3 SRAP-PCR
  •     1.2.4 扩增产物检测及数据统计分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 致病力测定
  •   2.2 基于SRAP标记群体遗传多样性分析
  •     2.2.1 多态性频率统计
  •     2.2.2 聚类分析
  •     2.2.3 分子遗传多样性分析
  •     2.2.4 遗传距离与遗传相似度分析
  •     2.2.5 遗传分化系数和基因流
  •     2.2.6 分子方差分析
  •     2.2.7 不同致病力菌株群体遗传关系
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张俊华,沃三超,杨明秀,张瑶,陈婉莹,高云萍

    关键词: 水稻纹枯病,致病性,遗传多样性,遗传分化,基因流

    来源: 东北农业大学学报 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 植物保护

    单位: 东北农业大学农学院

    基金: 黑龙江省自然科学基金项目(c2017032),中央引导地方科技发展专项(ZY18C08),国家重点研发计划项目(2018YFD0300105),黑龙江省应用技术研究与开发计划项目(GA19B104)

    分类号: S435.111.42

    DOI: 10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2019.11.0001

    页码: 1-10

    总页数: 10

    文件大小: 1625K

    下载量: 281

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