导读:本文包含了位点频率论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:频率,位点,多态性,基因,磷酸化,数据库,甘蓝。
位点频率论文文献综述
黄秀峰,宾晓芸,周庆辉,王金花,林朝文[1]（2019）在《脂联素SNPs多态性位点及其基因型频率在骨质疏松和正常人群中的分布》一文中研究指出探究骨质疏松症与脂联素之间的关联。采用超声骨密度测定仪测量623例广西壮族人群的跟骨骨密度,并采集其静脉血2 ml,试剂盒法提取DNA。筛选Adiponectin基因基因的5个SNPs位点(rs1063539,rs12495941,rs266729,rs3774261,rs710445),采用Primer 5软件设计引物,进行PCR扩增反应。数据用SPSS 18.0进行统计学分析,计量资料以x±s表示,用(本文来源于《中国解剖学会2019年年会论文文摘汇编》期刊2019-08-18）
韦雨琦,孙一丹,王艳菁,刘逸晨,周伟[2]（2019）在《中国正常人群中先天性代谢疾病相关基因的DNA变异位点分布频率的研究》一文中研究指出为从整体层面研究我国正常人群先天性代谢缺陷DNA变异位点分布及频率,在88例中国正常人基因组DNA样本中,使用Haloplex序列捕获技术结合Illumina Miseq二代测序平台对10种先天性代谢缺陷的78个候选致病基因进行统一靶向测序,利用SureCall软件分析测序数据及质控;并用SIFT和Polyphen软件以及dbSNP数据库进行突变位点分析和功能预测;用SHEsis在线软件分析SNP/SNV的等位基因频率;此外用PyMOL对两个文献中尚未报道的位点进行蛋白结构功能分析。本实验共检出514个DNA变异位点,其中99个为错义变异。在这99个错义变异中,有2个是已报道的先天性代谢缺陷致病位点,且该位点在本研究人群中的分布频率高于亚洲数据库频率。本研究为中国人群先天性代谢缺陷的基因筛查提供了一定的理论依据。(本文来源于《湖南师范大学自然科学学报》期刊2019年04期）
仝敬平[3]（2018）在《基于ExAC数据库分析运动天赋基因多态性位点在不同种群中的分布频率》一文中研究指出目的利用ExAC数据库中等位基因发生频率数据,分析世界各地不同人群运动天赋基因多态性位点发生频率分布情况,为运动选材提供依据。方法通过文献检索,收集运动天赋基因多态性位点,统计ExAC、1 000Genomes和GO-ESP数据库中天赋基因多态性位点的发生频率,比较这3大数据库中等位基因频率的差异,并进一步分析ExAC数据库中世界各地不同人群运动天赋基因多态性的分布。结果共筛选出111个运动天赋基因多态性位点,其中43个位点在ExAC中具有详细数据。ExAC、1 000Genomes和GO-ESP数据库中运动天赋基因多态性发生频率均比较接近,Pearson相关系数R值大于0.9(P<0.01)。ExAC数据库中世界各地不同人群基因多态性分布表明,非洲人群4个耐力相关基因多态性位点GNB3/rs5443(T),IL15RA/rs2228059(C),ITPR1/rs1038639(T)和PPARGC1A/rs81926789(G)的发生频率,以及3个爆发力相关基因多态性位点ACTN3/rs1815739(C),IGF1R/rs1464430(T)和MCT1/rs1049434(G)的发生频率都显着高于其他人群。结论 ExAC、1000Genomes和GO-ESP数据库运动天赋基因多态性分布基本一致,非洲人群在耐力相关基因(GNB3、IL15RA、ITPR1和PPARGC1A)和爆发力相关基因(ACTN3、IGF1R和MCT1)的相应多态性位点发生频率显着高于其它人群。该研究对于根据天赋基因进行运动员早期选材和个体化训练具有一定的参考价值。(本文来源于《西安体育学院学报》期刊2018年04期）
林玉娇,谢奕文,王友山[4]（2018）在《种植位点颌骨CT密度值与种植体植入扭矩值、共振频率法ISQ值相关性的临床研究》一文中研究指出目的:研究种植位点颌骨CT密度值与种植体植入扭矩值(insertiontorque value,ITV)、共振频率法检测的种植体稳定系数(implant stability quotient,ISQ)值的相关性。方法:将49例(共70个种植体)行口腔种植修复术患者纳入研究范围,回顾性分析种植位点颌骨CT密度值,并依据颌骨CT密度值将其分为Ⅰ类骨、Ⅱ类骨、Ⅲ类骨、Ⅳ类骨等组别,以明确颌骨CT密度值与种植体植入扭矩值、共振频率法ISQ值的相关性。结果:下颌种植区域颌骨CT密度值、种植体植入ITV、ISQ值均高于上颌(P<0.05);且Ⅰ类骨、Ⅱ类骨、Ⅲ类骨、Ⅳ类骨患者下颌种植体植入ITV、ISQ值均高于上颌(P<0.05),种植体植入ITV、ISQ值大小分布均为Ⅰ类骨﹥Ⅱ类骨﹥Ⅲ类骨﹥Ⅳ类骨;同时,经Pearson相关性分析,颌骨CT密度值与种植体ITV、ISQ值均存在正相关关系(P<0.05)。结论:种植位点颌骨CT密度值与种植体植入ITV、ISQ值存正相关关系,或可为预测种植体初期稳定性的重要指标。(本文来源于《包头医学院学报》期刊2018年05期）
刘持翔,吕飘,徐建华,石文,晁艳[5]（2015）在《肾移植等待患者HLA-A、B、DR位点抗原频率分布特点分析》一文中研究指出目的:探讨肾移植等待患者HLA-A、B、DR抗原位点频率分布特征。方法:选取2013年2月~2015年1月我院收治的待肾移植患者109例为研究对象,采用序列特异性引物聚合酶链反应扩增技术(SSP PCR)检测患者HLA-A、B、DR等位基因并分析其对应血清学特异性。结果:HLA-A抗原频率最高为A11,为56.32%,其次为A2、A24及A33。HLA-B抗原频率最高为B60(29.98%),其次为B46、B13、B75、B58。HLA-DR抗原频率最高为DR12(28.09%)。其次为DR4、DR15、DR9、DR14等。结论:肾移植等待患者HLA-A、B及DR位点频率分布不同,HLA-A11、HLA-B60、HLA-DR12为位点最高频率。(本文来源于《医疗装备》期刊2015年08期）
陶鹏,钟新民,李必元,王五宏,岳智臣[6]（2015）在《甘蓝BoKIN1基因的ploy(A)位点的预测及其频率分析》一文中研究指出多聚腺苷酸化(Polyadenylation)是真核生物中一种重要的pre-mRNA加工机制,是mRNA成熟的一个必经过程。为了解甘蓝BoKIN1基因的多聚腺苷酸化加工情况,本研究从甘蓝全基因组数据库中下载得到BoKIN1基因序列,并利用生物信息学手段分析了BoKIN1的基因结构和基因表达。研究结果显示:BoKIN1基因在花器官中表达最高;然后基于EST文库发现了3个ploy(A)位点,并计算了这些ploy(A)位点在premRNA加工过程中被选择的大致频率情况,结果显示BoKIN1基因在pre-mRNA加工过程中至少有6个ploy(A)位点可供选择加尾,其中AP4位点被选择加尾的频率最高,其次是AP5位点。因此选择AP4位点加尾后形成的mRNA是转录后加工的主要产物。通过本研究我们确定了甘蓝类BoKIN1基因6个选择性加尾位点及其3'UTR的主要产物和次要产物,可对于未来进一步利用这些3'UTR奠定基础。(本文来源于《分子植物育种》期刊2015年05期）
王海泽,刘迪,唐亮[7]（2014）在《东北地区主栽水稻品种的籼型位点频率及其与产量的关系》一文中研究指出为了分析籼粳稻杂交对东北地区水稻育种的贡献,以不同年代审定推广的东北地区主栽水稻品种为试材,从表型和基因组层面上分析了不同审定推广年代水稻的遗传多样性及籼粳杂交育种的遗传贡献,结果表明:东北地区水稻品种的籼型位点频率表现为辽宁>吉林>黑龙江,年代间籼型位点频率表现为1981~1990年间>2001~2010年间>1991~2000年间>1961~1980年间的品种。东北地区主栽大部分水稻品种含有一定含量的籼型点频率,不同年代、不同地区东北粳稻品种的籼型位点频率不同,表现为辽宁>吉林>黑龙江。东北地区主栽水稻品种的籼型位点频率与有效穗数负相关,和每穗粒数正相关性,且均达到极显着水平,但与产量的相关性未达到显着水平。(本文来源于《沈阳农业大学学报》期刊2014年06期）
聂燕钗,张晨,刘亚楠,黄江平,焦海涛[8]（2014）在《AS-PCR技术检测20个mtDNA SNP位点及单倍型频率》一文中研究指出目的基于等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)技术,建立一种叁色荧光标记复合扩增检测线粒体DNA(mtDNA)SNP的方法。方法基于AS-PCR原理,选择20个mtDNA编码区SNP位点,分为两组,分别标记FAM和HEX荧光,每个位点设计具有长度差异的两条上游(下游)等位基因特异性引物以及一条下游(上游)通用引物。结合AS-PCR技术和毛细管电泳,检测200份无关个体血样。各位点随机选取至少3个样本进行直接测序验证,并进行单倍型频率调查。结果 200份血样均得到清晰分型,各位点的检测结果与直接测序结果完全一致。10μL体系下,DNA最低检测浓度为0.2pg,当模板量为0.5~5 pg时能得到较为理想的分型图谱。在200名无关个体中,共分出15种单倍型,单倍型多样性为0.906 0。结论 AS-PCR技术是一种简单、快速且有效的mtDNA SNP分型方法,适用于法庭科学检验的需求。(本文来源于《法医学杂志》期刊2014年02期）
王伟,何华勤[9]（2014）在《基于SVM的氨基酸频率计算预测水稻蛋白质磷酸化位点》一文中研究指出本文从s wiss-prot中选取经过试验验证的水稻蛋白质磷酸化位点数据作为训练集合,应用蛋白质序列的氨基酸频率计算方法来进行特征提取,再利用SVM算法构建专门针对水稻蛋白质磷酸化位点的预测新工具.氨基酸频率算法指的是计算出相应待预测磷酸化位点附近氨基酸的出现频率,进一步反映了残基之间的相关性.本文利用LibSVM软件包对已通过氨基酸频率算法特征提取出来的数值特征对磷酸化位点进行预测,从而为之后构建水稻蛋白质磷酸化位点的预测工具做准备.结果表明,本文基于SVM和氨基酸频率方法的水稻蛋白质磷酸化位点预测在丝氨酸,苏氨酸和酪氨酸的平均预测准确性为77.665%,马修斯系数为0.571.与PlantPhos和Musite的预测性能的对比结果显示,在磷酸化苏氨酸位点的预测性能显着高于PlantPhos及Musite.(本文来源于《赤峰学院学报(自然科学版)》期刊2014年05期）
杨春,巴华杰,高志勤,赵汉清,余海鹰[10]（2013）在《男性冲动攻击行为的15个短串联重复序列基因位点等位基因频率的病例对照研究(英文)》一文中研究指出背景:遗传多态性短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)分析是用于检测基因型和表型之间关联的公认方法 ,但它以前没有在冲动攻击行为的遗传学研究中使用。目的 :在有冲动攻击行为史的男性和无冲动攻击行为史的男性对照组之间,比较15个STR基因位点(D8S1179,D21S11,D7S820,CSF1PO,D3S1358,TH01,D13S317,D16S539,D2S1338,D19S433,vWA,TPOX,D18S51,D5S818和FGA)不同多态性的发生率。方法 :应用AmpFlSTR?Identifiler?试剂盒比较407个有冲动性攻击行为的案例和415个对照的15个STR基因位点等位基因的分布。结果 :有冲动攻击行为史的男性以下等位基因的平均频率显着低于对照组:TH01的等位基因10(OR=0.29,95%CI=0.16-0.52,p<0.0001),TPOX的等位基因8(OR=0.71,95%CI=0.58-0.86,p=0.0005),TPOX的等位基因9(OR=0.65,95%CI=0.47-0.89,p=0.0072),和CSF1PO的等位基因14(OR=0.27,95%CI=0.11-0.68,p=0.0035)。而案例组有一个等位基因频率显着高于对照组:TPOX的等位基因11(OR=1.79,95%CI=1.45-2.22,p<0.0001)。结论 :据我们所知,本项行为遗传学研究首次清楚表明了特定的遗传标记与非精神病罪犯的冲动暴力行为之间的密切关系。进一步的前瞻性工作将需要确定已辨识出的等位基因是否可以被认为是冲动攻击行为的危险因素以及导致这种关系的基本机制。(本文来源于《上海精神医学》期刊2013年06期）
位点频率论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为从整体层面研究我国正常人群先天性代谢缺陷DNA变异位点分布及频率,在88例中国正常人基因组DNA样本中,使用Haloplex序列捕获技术结合Illumina Miseq二代测序平台对10种先天性代谢缺陷的78个候选致病基因进行统一靶向测序,利用SureCall软件分析测序数据及质控;并用SIFT和Polyphen软件以及dbSNP数据库进行突变位点分析和功能预测;用SHEsis在线软件分析SNP/SNV的等位基因频率;此外用PyMOL对两个文献中尚未报道的位点进行蛋白结构功能分析。本实验共检出514个DNA变异位点,其中99个为错义变异。在这99个错义变异中,有2个是已报道的先天性代谢缺陷致病位点,且该位点在本研究人群中的分布频率高于亚洲数据库频率。本研究为中国人群先天性代谢缺陷的基因筛查提供了一定的理论依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
位点频率论文参考文献
[1].黄秀峰,宾晓芸,周庆辉,王金花,林朝文.脂联素SNPs多态性位点及其基因型频率在骨质疏松和正常人群中的分布[C].中国解剖学会2019年年会论文文摘汇编.2019
[2].韦雨琦,孙一丹,王艳菁,刘逸晨,周伟.中国正常人群中先天性代谢疾病相关基因的DNA变异位点分布频率的研究[J].湖南师范大学自然科学学报.2019
[3].仝敬平.基于ExAC数据库分析运动天赋基因多态性位点在不同种群中的分布频率[J].西安体育学院学报.2018
[4].林玉娇,谢奕文,王友山.种植位点颌骨CT密度值与种植体植入扭矩值、共振频率法ISQ值相关性的临床研究[J].包头医学院学报.2018
[5].刘持翔,吕飘,徐建华,石文,晁艳.肾移植等待患者HLA-A、B、DR位点抗原频率分布特点分析[J].医疗装备.2015
[6].陶鹏,钟新民,李必元,王五宏,岳智臣.甘蓝BoKIN1基因的ploy(A)位点的预测及其频率分析[J].分子植物育种.2015
[7].王海泽,刘迪,唐亮.东北地区主栽水稻品种的籼型位点频率及其与产量的关系[J].沈阳农业大学学报.2014
[8].聂燕钗,张晨,刘亚楠,黄江平,焦海涛.AS-PCR技术检测20个mtDNASNP位点及单倍型频率[J].法医学杂志.2014
[9].王伟,何华勤.基于SVM的氨基酸频率计算预测水稻蛋白质磷酸化位点[J].赤峰学院学报(自然科学版).2014
[10].杨春,巴华杰,高志勤,赵汉清,余海鹰.男性冲动攻击行为的15个短串联重复序列基因位点等位基因频率的病例对照研究(英文)[J].上海精神医学.2013
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