基因互作论文_林志坚,廖卫平

导读:本文包含了基因互作论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:基因,细毛羊,合子,表现型,转染,遗传病,多态性。

基因互作论文文献综述

林志坚,廖卫平[1](2019)在《基因互作网络分析CNTN2、EFHC1/CCDC150基因为特发性全面性癫痫候选基因》一文中研究指出目的通过基因互作网络模式寻找特发性全面性癫痫候选致病基因。方法收集特发性全面性癫痫患者142例,提取患者及其父母(叁人组)外周静脉血的DNA,采用全外显子组第二代测序方法(IlluminaHiSeq 2500测序平台),测定基因组的全外显子区及±10位内含子区的基因变异。296例排除癫痫史的视网膜病变患者为对照组。以癫痫基因表型、非良性变异(最小等位基因频率<0.05,且≥1个软件预测有(本文来源于《第八届CAAE国际癫痫论坛论文汇编》期刊2019-10-18)

张蕴显,王雅梅,周萍[2](2019)在《蚁群优化算法构建乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络》一文中研究指出目的筛选ER阳性乳腺癌中受miRNA调控的关键基因,以此构建乳腺癌中miRNAmRNA互作网络,进而了解ER阳性乳腺癌的调控机制,为筛选ER阳性乳腺癌诊断预后的生物标志物和治疗靶点打下基础。方法利用MCF-7细胞系的AGO-IP(HITS-CLIP Protocol for Argonaute)高通测序实验数据,发现miRNA对mRNA的真实调控关系,并以此构建基于RNAs诱导的沉默复合体(RNAinduced silencing complex,RISCs) miRNA-mRNA调控模组。根据调控模组利用蚁群优化算法在基因互作网络中筛选关键基因,构建ER阳性乳腺癌中miRNA调控下的关键基因互作网络,并对关键基因进行功能分析。结果本研究筛选出106个关键基因,244个调控关键基因的miRNA。根据乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络识别出了YWHAG、EP300、CHEK1、SMAD2、SMAD1、SYK、FGFR1、PIK3R2、IRS1、TGFBR2、CHUK和CSDE1等12个hub基因;并发现了hsa-miR-940、hsa-miR-545-3p、hsa-miR-3065-5p、hsa-miR-15a-5p、hsa-miR-181b-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-765、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-454-3p、hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-30e-5p、hsa-miR-19a-3p、hsa-miR-15b-5p、hsa-miR-149-5p和hsa-miR-128-3p等16个hub miRNA。这些基因主要对肿瘤细胞的增殖、侵袭、化疗抗性、放疗抗性和耐药性起重要作用。结论本研究筛选出的关键基因及调控关键基因的miRNA对ER阳性乳腺癌的耐药性、化疗抗性、放疗抗性及肿瘤细胞的增殖、侵袭有重要调控作用,对ER阳性乳腺癌临床治疗及预后起到重要参考作用。(本文来源于《北京生物医学工程》期刊2019年04期)

戚文华,竭航,赵贵军,严超超,岳碧松[3](2019)在《林麝脓肿病相关miRNA的鉴定及其与靶基因互作分析》一文中研究指出MicroRNA(miRNA)是一类长度大约18-25 nt的非编码单链RNA序列,可以调控靶基因的翻译,随后利用基因转录机制控制蛋白编码。目前已证实miRNA在生物体生长、发育和疾病发生等过程中发挥着重要的作用。动物miRNA基因在进化上具有高度的保守性,许多序列都可以在亲缘关系相近的物种中找到,甚至在亲缘关系较远的物种中都有发现。本药研究通过高通量测序对30只幼体、亚成体和成体雌雄林麝(健康组和脓肿病组)的血液进行small RNA测序,利用成熟miRNA序列的保守性以及前体结构具有发夹二级结构的特性在不同年龄段健康和脓肿病林麝中共鉴定出874个miRNA分子,其中已知miRNA有469个,新的未知miRNA有405个。所有miRNA前体序列长度为60-120bp,平均长度为80bp。序列分析发现林麝血液miRNA表达谱中874个序列形成198个基因家族,而最少的家族miR-3957有4个成员,而大多数miRNA家族有30个成员以上。目前预测获得120个与林麝免疫疾病相关的miRNA,并进行了miRNA与其靶基因互作分析;初步预测了获得12个与林麝泌香相关miRNA,并且进行了靶基因分析。通过二级结构分析表明,绝大多数序列能够形成典型的发夹结构。目前通过RT PCR实验验证10个候选miRNA前体在血组织中的表达情况。(本文来源于《第八届中国西部动物学学术研讨会会议摘要汇编》期刊2019-07-18)

姜洋,马彩艳,郑菊萍,许琳,盛洋[4](2019)在《基于KEGG通路和基因互作网络对充血性心力衰竭相关基因的筛选》一文中研究指出目的筛选与充血性心力衰竭(congestive heart failure,CHF)相关的药物靶点基因,利用DAVID通路数据库和基因互作网络分析目标基因的分布和功能,促进CHF的研究和新药的开发。方法以"congestive heart failure"检索NCBI基因数据库,提取CHF相关基因数据,采用DAVID分析工具提取基因富集的通路数据。对40个非冗余基因所显着富集的11条KEGG通路进行了分析,同时对富集通路中的基因同HPRD人类蛋白互作网络进行匹配,建立通路中关键基因的互作网络。并对所建立的相关子网进行比较,筛选和CHF相关的药物靶点基因。结果 MMP9、LMNA、DMD、EMD、AGTR1、EDNRB、NOS3和TNF等21个CHF相关基因需要完善研究,LMNA、MMP9和AR3个基因可能是CHF治疗药物间接作用的重要靶点。结论 CHF发病与cGMP-PKG信号通路、钙离子信号通路、扩张型心肌病、肥厚型心肌病等多个通路相关。MMP9、LMNA、DMD、EMD、AGTR1、EDNRB、NOS3和TNF等21个CHF相关基因在病理和治疗中都占有重要的地位。通过分析疾病相关基因的代谢通路和互作网络,有助于了解疾病的分子基础,并为新药研发提供可借鉴的思路。(本文来源于《中国现代应用药学》期刊2019年09期)

张梦瑶,杨峰,刘积凤,刘开东,贺建宁[5](2019)在《敖汉细毛羊Hoxa5、BMPR1B基因互作研究》一文中研究指出旨在构建敖汉细毛羊Hoxa5、BMPR1B基因的质粒及共转染成纤维细胞后,通过基因表达量变化研究两基因的互作。以敖汉细毛羊为研究对象,采集40日龄的胎羊。首先,通过RNA的提取反转录成cDNA,参照GenBank中Hoxa5、BMPR1B基因序列信息分别设计1对引物,通过PCR反应扩增获得Hoxa5、BMPR1B基因片段,将得到的Hoxa5、BMPR1B基因分别连接到pEASYTM-T1载体,构建pEASYTM-T1-Hoxa5、pEASYTM-T1-BMPR1B重组质粒并转化大肠杆菌(E.coli)DH5α感受态细胞,提取质粒进行酶切鉴定。鉴定正确后构建pcDNA3.1-Hoxa5、pcDNA3.1-BMPR1B重组质粒,转化大肠杆菌(E.coli)DH5α感受态细胞。其次,对敖汉细毛羊的成纤维细胞进行分离培养,并将构建的质粒pcDNA3.1-Hoxa5、pcDNA3.1-BMPR1B共转染成纤维细胞,利用荧光定量PCR技术和Western Blot技术检测Hoxa5、BMPR1B基因单转染和共转染在成纤维细胞中表达量的变化。结果显示,经酶切、测序鉴定质粒pcDNA3.1-Hoxa5、pcDNA3.1-BMPR1B构建成功,并且共转染成纤维细胞BMPR1B基因的表达量明显下降,Hoxa5基因的表达量明显升高且共转染组的表达量极显着地高于单转染组(P<0.01)。成功构建了敖汉细毛羊Hoxa5、BMPR1B基因的质粒,并且成功共转染成纤维细胞,Hoxa5基因的表达量明显升高,BMPR1B基因的表达量明显下降,因而Hoxa5基因抑制了BMPR1B基因的表达,BMPR1B基因促进了Hoxa5基因的表达,结果可为进一步研究其功能奠定基础。(本文来源于《华北农学报》期刊2019年02期)

于彦军[6](2019)在《例谈构建模型优化基因互作类遗传题的分析过程》一文中研究指出模型是人们为了某种特定目的而对认识对象所做的一种简化的概括性描述,这种描述可以是定性的,也可以是定量的,通常借助于实物或抽象的其他形象化的手段来表达,从而为解决问题提供直观的、简化的信息,使分析过程变得简单明了。笔者通过构建模型,使基因互作类遗传题的分析过程简单直观,以供其他教师参考。1.例题【改编】某哺乳动物毛色由3对位于常染色体上的、独立分配的等位基因决定,其中,A基因编码的酶可使黄(本文来源于《教学考试》期刊2019年15期)

王小敏,周叶,张翠真,彭扣,吴娣[7](2018)在《池蝶蚌IκB基因表达分析以及和NF-κB基因互作关系》一文中研究指出目前,相关研究已证明在休眠细胞中,抑制剂蛋白(IκB)和NF-κB蛋白与其结合保持在不活跃的状态,而且其对NF-κB的转录有着一定的影响。但至今关于池蝶蚌IκB基因在NF-kB/Rel的信号通路传导尚未清楚。为了探究其信号通路传导及该通路相关基因Inhibitor of NF-κB (IκB)的初步功能。本研究通过RACE-PCR技术获得池蝶蚌IκB基因cDNA全长,(简称Hs-IκB),其全长为1734bp。通过生物信息学分析,其蛋白分子量为40.08kDa,为亲水性可溶蛋白。其结构域主要是六个ANK。系统进化树分析显示,Hs-IκB与贝类有很高的同源性,都达到80%以上,但是与脊椎动物有着很大的差异性。最后,在荧光定量组织表达中发现存在组织差异性,表达量较高的组织为肾脏和心脏,最低的是肝胰腺,除此,对Hs-IκB和Hs-NF-κ之间的关系作了进一步的探究。通过GST-pulldown实验证明,Hs-IκB和Hs-NF-κB的REL结构域存在直接的相互作用,从而说明Hs-IκB在NF-kB/Rel的信号通路中占据着重要的作用。(本文来源于《2018年中国水产学会学术年会论文摘要集》期刊2018-11-15)

马林[8](2018)在《例谈基因互作的系谱图问题的求解》一文中研究指出例1调查某种遗传病得到如图1所示的系谱图,经分析得知,两对独立遗传且表现完全显性的基因(分别用字母Aa、Bb表示)与该病有关,且都可以单独致病。在调查对象中没有发现基因突变和染色体变异的个体。请回答下列问题:(本文来源于《中学生数理化(学习研究)》期刊2018年09期)

张梦瑶,杨峰,刘开东,刘积凤,柳楠[9](2018)在《敖汉细毛羊Hoxa5基因与BMPR1B基因互作的研究》一文中研究指出引言/目的 Hoxa5控制着皮肤细胞增殖、分化与凋亡,在毛囊退行期发挥着重要作用,同时也将能诱导细胞周期阻滞和终端分化。BMPs是一种具有分泌功能的蛋白,不仅能在成骨过程中发挥作用,在毛囊发育过程中起到了重要作用,主要表现出对毛囊的抑制作用,而它的受体BMPRs类主要表现出对毛囊存在着促进的作用,BMPR1B属于BMPs家族的Ⅰ型受体成员。(本文来源于《2018年全国养羊生产与学术研讨会论文集》期刊2018-08-16)

郭颖婕,刘晓燕,吴辰熙,郭茂祖,李傲[10](2018)在《基于U统计量和集成学习的基因互作检测方法》一文中研究指出在全基因组关联研究GWAS中,多数方法对疾病与单核苷酸多态性位点之间的互作关系形式给出了强假设,这降低了相关方法的挖掘能力.近几年,以基因作为研究单位的基因-基因相互作用检测方法,因其在统计效力与生物可解释性方面的优势受到重视.针对已有方法检测相互作用类型时存在的局限性,提出一种基于U统计值与集成学习器的假设检验方法 GBUtrees,通过构造统计量用于表征疾病性状与2个基因之间关系偏离加性模型的程度,检测以基因为单位的基因-基因相互作用.该统计量在不同子样例集下结果的平均值满足U统计量理论,从而可以利用U统计量的渐进正态分布性质获得所构造统计量的分布信息.GBUtrees对相互作用的形式不作假设,增强该方法对不同形式相互作用的挖掘能力.仿真与真实实验结果表明:该方法能够有效地进行不同类型相互作用的挖掘,可以应用于全基因组关联研究.(本文来源于《计算机研究与发展》期刊2018年08期)

基因互作论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的筛选ER阳性乳腺癌中受miRNA调控的关键基因,以此构建乳腺癌中miRNAmRNA互作网络,进而了解ER阳性乳腺癌的调控机制,为筛选ER阳性乳腺癌诊断预后的生物标志物和治疗靶点打下基础。方法利用MCF-7细胞系的AGO-IP(HITS-CLIP Protocol for Argonaute)高通测序实验数据,发现miRNA对mRNA的真实调控关系,并以此构建基于RNAs诱导的沉默复合体(RNAinduced silencing complex,RISCs) miRNA-mRNA调控模组。根据调控模组利用蚁群优化算法在基因互作网络中筛选关键基因,构建ER阳性乳腺癌中miRNA调控下的关键基因互作网络,并对关键基因进行功能分析。结果本研究筛选出106个关键基因,244个调控关键基因的miRNA。根据乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络识别出了YWHAG、EP300、CHEK1、SMAD2、SMAD1、SYK、FGFR1、PIK3R2、IRS1、TGFBR2、CHUK和CSDE1等12个hub基因;并发现了hsa-miR-940、hsa-miR-545-3p、hsa-miR-3065-5p、hsa-miR-15a-5p、hsa-miR-181b-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-765、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-454-3p、hsa-miR-374a-5p、hsa-miR-34a-5p、hsa-miR-30e-5p、hsa-miR-19a-3p、hsa-miR-15b-5p、hsa-miR-149-5p和hsa-miR-128-3p等16个hub miRNA。这些基因主要对肿瘤细胞的增殖、侵袭、化疗抗性、放疗抗性和耐药性起重要作用。结论本研究筛选出的关键基因及调控关键基因的miRNA对ER阳性乳腺癌的耐药性、化疗抗性、放疗抗性及肿瘤细胞的增殖、侵袭有重要调控作用,对ER阳性乳腺癌临床治疗及预后起到重要参考作用。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

基因互作论文参考文献

[1].林志坚,廖卫平.基因互作网络分析CNTN2、EFHC1/CCDC150基因为特发性全面性癫痫候选基因[C].第八届CAAE国际癫痫论坛论文汇编.2019

[2].张蕴显,王雅梅,周萍.蚁群优化算法构建乳腺癌中miRNA调控的关键基因互作网络[J].北京生物医学工程.2019

[3].戚文华,竭航,赵贵军,严超超,岳碧松.林麝脓肿病相关miRNA的鉴定及其与靶基因互作分析[C].第八届中国西部动物学学术研讨会会议摘要汇编.2019

[4].姜洋,马彩艳,郑菊萍,许琳,盛洋.基于KEGG通路和基因互作网络对充血性心力衰竭相关基因的筛选[J].中国现代应用药学.2019

[5].张梦瑶,杨峰,刘积凤,刘开东,贺建宁.敖汉细毛羊Hoxa5、BMPR1B基因互作研究[J].华北农学报.2019

[6].于彦军.例谈构建模型优化基因互作类遗传题的分析过程[J].教学考试.2019

[7].王小敏,周叶,张翠真,彭扣,吴娣.池蝶蚌IκB基因表达分析以及和NF-κB基因互作关系[C].2018年中国水产学会学术年会论文摘要集.2018

[8].马林.例谈基因互作的系谱图问题的求解[J].中学生数理化(学习研究).2018

[9].张梦瑶,杨峰,刘开东,刘积凤,柳楠.敖汉细毛羊Hoxa5基因与BMPR1B基因互作的研究[C].2018年全国养羊生产与学术研讨会论文集.2018

[10].郭颖婕,刘晓燕,吴辰熙,郭茂祖,李傲.基于U统计量和集成学习的基因互作检测方法[J].计算机研究与发展.2018

论文知识图

软件显示图氨基酸转运和寡肽/小肽转运相关基因在...一16一1signalp分析sPSPtllplo蛋白信号...一1细菌双杂交文库原理示意图(来自stra...各结构域和ATG8在酵母细胞中的...泛素介导的蛋白质降解途径相关基因在...

标签:;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  

基因互作论文_林志坚,廖卫平
下载Doc文档

猜你喜欢