基于全基因组SNP标记的抗旱冬小麦品种的遗传多样性分析

基于全基因组SNP标记的抗旱冬小麦品种的遗传多样性分析

论文摘要

【目的】研究分析124份优异抗旱冬小麦的亲缘关系和遗传多样性,为小麦抗旱亲本选择提供理论依据.【方法】利用35K基因芯片对小麦全基因组进行扫描,并在PowermarkerV3.2.5中计算等位变异频率、遗传多样性指数和多态性信息量;采用非加权平均法(UPGMA)对124份小麦材料进行分类.【结果】通过全基因组扫描,共筛选出15 947个多态性SNP标记,每个多态性SNP位点平均等位变异频率为0.75,遗传多样性指数为0.35,多态性信息量为0.31,根据遗传相似系数,采用UPGMA在遗传相似系数0.38处将124份冬小麦材料分为7个亚群.【结论】在长期的育种过程中促进了不同区域的小麦种质材料之间的基因交流,但是在部份相同地理来源的材料之间的遗传多样性仍较差,因此在育种过程中应该引进新的品种,丰富小麦的遗传背景.

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 供试材料
  •   1.2 试验方法
  •     1.2.1 小麦基因组DNA提取
  •     1.2.2 SNP标记分析
  •     1.2.3 SNP遗传多样性统计
  • 2 结果与分析
  •   2.1 小麦SNP位点遗传多样性分析
  •   2.2 小麦不同基因组水平上遗传多样性分析
  •   2.3 小麦不同同源群水平上的遗传多样性分析
  •   2.4 小麦不同染色体水平上的遗传多样性
  •   2.5 小麦群体SNP标记的UPGMA聚类分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 左煜昕,马靖福,刘媛,张沛沛,栗孟飞,程宏波,陈思瑾,杨德龙

    关键词: 小麦,抗旱品种,标记,遗传多样性,聚类分析

    来源: 甘肃农业大学学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 农作物

    单位: 甘肃省干旱生境作物学重点实验室,甘肃农业大学生命科学技术学院

    基金: 国家自然科学基金项目(31760385,31460348),甘肃省现代农业产业技术体系项目(GARS-01-04)

    分类号: S512.11

    DOI: 10.13432/j.cnki.jgsau.2019.06.007

    页码: 47-54

    总页数: 8

    文件大小: 1418K

    下载量: 105

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