论文摘要
以抽筒竹叶绿体全基因组序列为材料进行了密码子偏好性分析,结果表明:1)抽筒竹叶绿体基因组密码子偏性较弱,有效密码子数（Effective number of codon,ENC）在38. 85～61之间,平均值为49. 66; 2)密码子第1和第3位的GC含量一定程度上有相似性,GC1和GC2、GC3呈显著相关,而第2位GC含量和其它两位差异较大; 3)密码子偏爱以A或U结尾,RSCU值大于1. 00的密码子31个,其中16个第3位碱基为U、11个以A结尾、1个以G结尾; 4) GC12与GC3相关性较弱,回归系数为0. 357 63; 5)密码子偏好性更多受到选择的影响,代表基因多数落在标准曲线的下方。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 李江平,秦政,国春策,杨光耀,张文根
关键词: 抽筒竹,密码子偏好性,叶绿体基因组,最优密码子
来源: 竹子学报 2019年02期
年度: 2019
分类: 农业科技,基础科学
专业: 生物学
单位: 江西农业大学江西省竹子种质资源与利用重点实验室,江西省林业科学院
基金: 国家自然科学基金资助项目(31260043)
分类号: Q943.2
DOI: 10.19560/j.cnki.issn1000-6567.2019.02.013
页码: 79-87
总页数: 9
文件大小: 151K
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