辽西五市鸡星状病毒的检测及序列分析

辽西五市鸡星状病毒的检测及序列分析

论文摘要

目的为了研究辽西地区鸡群感染星状病毒的情况。方法采用TaqMan实时荧光定量PCR方法检测辽西五市114份亚临床症状鸡粪便样本中的鸡星状病毒(chicken astrovirus,CAstV),并进行多重序列相似性分析,以代表的6株病毒ORF1b基因序列进行遗传进化分析。结果 TaqMan实时荧光定量PCR结果显示,样本中CAstV的阳性检出率为61. 40%(70/114)。多重序列相似性和系统进化树分析结果显示本研究得到的CAstV序列与我国上海分离到的PeAstV (Sequence ID:HQ662578. 1)相似度为98%,且毒株序列全部聚成一支,位于CAstV亚群中,毒株内高度保守,但与其他禽类星状病毒差异较大。结论鸡星状病毒的感染在亚临床症状鸡群中具有较高的检出率,对鸡群造成潜在的威胁。本研究对辽西五市鸡星状病毒进行了检测及序列分析,为预防和控制鸡星状病毒的地方性流行以及鸡星状病毒的致病机制研究奠定基础。!

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样本采集及处理
  •   1.2 主要试剂及仪器
  •   1.3 粪便样本RNA的提取
  •   1.4 引物设计与合成
  •   1.5 实时荧光定量PCR检测粪便样本中的CAstV
  •   1.6 DNA扩增与克隆测序
  •   1.7 序列分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 粪便样本中CAstV的检测
  •   2.2 ORF1b基因扩增与测序分析
  •   2.3 遗传进化分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘念,姜秀芳,王宇彤,于漫,赵微

    关键词: 辽西地区,鸡星状病毒,实时荧光定量检测,序列分析

    来源: 锦州医科大学学报 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学,农业科技

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 锦州医科大学实验动物学教研室

    基金: 国家自然基金项目,项目编号:81201285,辽宁省自然科学基金项目,项目编号:20170540398

    分类号: S852.65

    DOI: 10.13847/j.cnki.lnmu.2019.03.001

    页码: 1-3+113-114

    总页数: 5

    文件大小: 2248K

    下载量: 103

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