砂藓RcPIP2基因的克隆及生物信息学分析

论文摘要

水通道蛋白是一类较小的跨膜蛋白质,在植物抵御非生物胁迫过程中具有非常重要的作用。为了研究砂藓水通道蛋白基因的生物学功能,利用干旱处理转录组测序获得的序列信息,克隆获得1个水通道蛋白家族中质膜内在蛋白基因序列,命名为RcPIP2。生物信息学结果显示,RcPIP2基因全长序列为1 267 bp,包含807 bp的开放阅读框,编码含有268个氨基酸残基的蛋白质。该蛋白质分子质量预测为28.3 ku,理论等电点为6.64,为疏水性较强的稳定性蛋白;无信号肽,为非分泌型蛋白;含有6个跨膜结构域。保守结构域分析发现,RcPIP2具有膜内在蛋白（MIP）家族信号序列、高等植物高度保守序列HINPAVTFG和2个天门冬酰胺-脯氨酸-丙氨酸（NPA）基序。二级结构包括α螺旋（37.31%）、β折叠（20.9%）、无规则卷曲（38.43%）。三级结构预测发现,RcPIP2蛋白质的立体结构为典型的四聚体形式,由4个圆筒状亚基和中间的孔道构成。系统进化树分析表明,RcPIP2与小立碗藓中的PIP2蛋白质亲缘关系较近,聚为一类。由此推测,RcPIP2基因为水通道蛋白家族成员。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张梅娟,徐红红,马天意,钱朋智,沙伟

关键词: 砂藓,水通道蛋白,克隆,生物信息学分析

来源: 华北农学报 2019年05期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 齐齐哈尔大学生命科学与农林学院抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室,齐齐哈尔大学食品科学与工程学院

基金: 国家自然科学基金项目(31570207),黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目(135209262,USTSXK201834),黑龙江省自然科学基金重点项目(ZD201408)

分类号: Q943.2

页码: 30-36

总页数: 7

文件大小: 2238K

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