ADCY9基因介导吉西他滨肺腺癌耐药的系统生物学研究

ADCY9基因介导吉西他滨肺腺癌耐药的系统生物学研究

论文摘要

目的基于系统生物学模式筛选吉西他滨肺腺癌耐药的hub基因,探讨hub基因ADCY9介导吉西他滨肺腺癌耐药的分子机制。方法采用dChip进行吉西他滨耐药差异基因分析;通过DAVID进行基因注释、生物信号通路功能聚类分析;采用STRING构建蛋白质相互作用网络,并筛选hub基因;使用Oncomine和TCGA数据库分析候选hub基因在肺腺癌等肿瘤组织中的表达情况,并进行共表达基因分析。结果获得吉西他滨肺腺癌耐药差异基因391个,其中上调基因80个,下调基因311个;构建了蛋白质相互作用网络,获得BDKRB2、BDKRB1、POMC、ADCY9等10个hub基因;Oncomine和TCGA数据库分析显示,ADCY9基因在肺腺癌中明显表达下调,生存分析发现ADCY9基因高水平表达可降低肺腺癌总体死亡风险(log rank P=0.014);吉西他滨肺腺癌耐药组中,ADCY9基因出现下调表达, ADCY9基因与耐药相关基因SMAD6存在相似的表达,相关性显著(P=5.6×10-27,R=0.44)。ADCY9共表达基因涉及多条肿瘤耐药途径如Rho蛋白及G蛋白信号转导、MAPKK活化、钙离子负性转运等。结论 ADCY9基因可能是一种重要的肺腺癌预后标志,也可能在吉西他滨肺腺癌耐药的发生机制中起重要作用。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 基因表达谱数据集获取及差异基因表达分析
  •   1.2 差异表达基因的go和pathway聚类分析[3]
  •   1.3 蛋白质相互作用网络构建及hub基因发现[4]
  •   1.4 hub基因的在肿瘤组织中表达分析[5]
  •   1.5 ADCY9基因表达及预后分析
  •   1.6 ADCY9共表达基因分析
  • 2 结果
  •   2.1 吉西他滨诱导肺腺癌耐药的差异表达基因
  •   2.2 吉西他滨诱导肺腺癌耐药的hub基因筛选
  •   2.3 hub基因在肺腺癌及其他肿瘤组织中的表达分析
  •   2.4 ADCY9基因在肺腺癌中表达及预后分析
  •   2.5 ADCY9基因介导吉西他滨肺腺癌耐药机制
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王桂平,梁杰聪,张彦焘,李智斌

    关键词: 肺腺癌,腺苷酸环化酶,耐药,吉西他滨

    来源: 药学研究 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 肿瘤学

    单位: 广州卫生职业技术学院药学系,广州市妇女儿童医疗中心外科

    基金: 广东省省级科技计划项目(No.2016A020215213),广州市教育局市属高校科研项目(No.1201620370)

    分类号: R734.2

    DOI: 10.13506/j.cnki.jpr.2019.12.011

    页码: 729-734

    总页数: 6

    文件大小: 5276K

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