基于基因数据库分析CBΧ2在非小细胞肺癌中的表达及临床意义

基于基因数据库分析CBΧ2在非小细胞肺癌中的表达及临床意义

(大理大学基础医学院云南大理671000)

【摘要】目的:探讨CBΧ2基因在NSCLC中的表达及临床意义。方法:检索Oncomine数据库中关于CBΧ2在不同NSCLC队列中的信息,并对其进行荟萃分析,结合Kaplan-MeierPlotter数据库进行NSCLC患者生存周期分析。结果:在Oncomine数据库中共有13项研究包含1896个样本涉及比较CBΧ2在NSCLC组织与正常组织中的表达。与正常组织相比,CBΧ2在NSCLC中高表达(P<0.05),并且高表达CBΧ2的患者总体生存时间较低表达者短,预后较差(P=0.0027)。结论:CBΧ2在NSLCL组织中高表达,且与NSCLC预后呈负相关,这为进一步深入研究奠定基础,也可能为抗肿瘤药物的研发提供潜在靶点。

【关键词】非小细胞肺癌;CBΧ2;Oncomine数据库

【中图分类号】R730.4【文献标识码】A【文章编号】2095-1752(2019)10-0022-02

ExpressionandclinicalsignificanceofCBΧ2innon-smallcelllungcancer:ananalysisbasedondata-miningofgenedatabases

QinLili.CollegeofBasicMedicine,DaliUniversity,Dali,Yunnan,671000,China

【Abstract】ObjectiveThisstudyaimedtoexploretheexpressionandclinicalsignificanceofCBΧ2geneinNSCLC.MethodThedataofCBΧ2expressionindifferentNSCLCcohortswereretrievedfromOncominedatabase,andtherelationshipbetweentheexpressionofCBΧ2andthesurvivalstatusofNSCLCwasretrievedfromanonlinesurvivalanalysistool“Kaplan-MeierPlotter”database.ResultInOncominedatabase,atotalof13studieswereinvolvedCBΧ2inNSCLCtissuesandnormaltissues,includingatotalof1896samples.Overall,CBΧ2expressioninNSCLCishigherthaninnormaltissue(P<0.05).Moreover,Kaplan-MeierplotsofoverallsurvivalindicatedthatpatientswithhighexpressionofCBΧ2closelyassociatedwithpoorsurvivalinNSCLC(P=0.0027).ConclusionTheexpressionofCBΧ2isup-regulatedinNSCLCtissue,whichiscorrelatedwithpoorprognosis.AndhighlyexpressedofCBΧ2providesthebasisforexploringtheroleofCBΧ2inNSCLC,whichalsomaybeconsideredasamarkerforprognosticstudiesofNSCLC.

【Keywords】Non-smallcelllungcancer;CBΧ2;Oncominedatabase

肺癌在全世界发病率极高,在美国肺癌致死率排在癌症病死率的首位,其中非小细胞肺癌(non-Smallcelllungcancer,NSCLC)占大多数[1]。尽管近年来肺癌相关诊疗方法日益进步,但确诊时患者大多已处于中晚期,预后仍未得到显著改善。色素框同源物(Chromoboxproteinhomolog,CBX)是多梳蛋白家族(PolycombgrouPproteins,PcG)的重要成员,PcG家族是一种表观遗传调控复合物,以聚合转录抑制复合体的形式存在,在调控细胞周期、细胞信号转导及肿瘤发生等方面发挥着重要作用[2]。其中CBΧ2基因活性与细胞周期依赖性调节相关,并在肿瘤的发生、发展中发挥着重要作用[3]。Oncomine数据库是目前全球最大的癌基因芯片数据平台,可以方便地进行靶基因差异表达挖掘分析。本研究利用该数据库及Kaplan-MeierPlotters数据库,通过二次荟萃分析CBΧ2在NSCLC中的表达及对预后的影响,为进一步研究其促进NSCLC恶性进展的作用机制提供线索并奠定理论基础。

1.材料和方法

1.1Oncomine数据库提取数据

登录Oncomine数据库(https://www.oncomine.Org/),在该数据库中设定检索条件后提取数据。设定的筛选条件具体如:①“CancerType:Lungcancer”;②“Gene:CBΧ2”;③“DataType:mRNA和DNAcopynumber”;④“AnalysisType:CancervsNormalAnalysis”;⑤临界值设定条件Pvalue<1E-4,foldchange>2,generank=toP10%。

1.2Kaplan-MeierPlotter进行患者生存周期分析

登录Kaplan-MeierPlotter数据库(http://kmplot.com/analysis/)对NSCLC数据集进行在线生存分析。设定筛选条件如下:①“Cancer:LungCancer”;②“Gene:CBΧ2”;③“Survival:OS”。

1.3统计学方法

正常组织与NSCLC组之间CBΧ2表达差异采用t检验。CBΧ2表达与NSCLC预后的关系采用Kaplan-Meier模型分析。所用数据采用Oncomine数据库和Kaplan-MeierPlotter数据库在线统计学分析,P<0.05认为差异具有统计学意义。

2.结果

2.1CBΧ2在NSCLC中的表达结果

自2001年开始在Oncomine数据库中共有13项研究涉及比较CBΧ2在NSCLC组织和正常组织中的表达,共有1896个样本,包括肺腺癌、鳞癌及大细胞肺癌与正常组织比较。文章分别发表于PNAS、Cancerresearch、sciencetranslationalmedicine、PLoSOne等杂志。荟萃分析13项研究结果发现:与正常组织相比,CBΧ2基因在NSCLC中高表达(P=2.93e-7)(图1)。

图3Kaplan-MeierPlotter数据库分析CBΧ2对非小细胞肺癌患者预后的影响

3.讨论

肺癌是全世界最常见的恶性肿瘤之一,每年全球约有159万患者死于此疾病,其中非小细胞肺癌是最主要的组织类型约占85%[7]。晚期NSCLC标准一线治疗含铂两药联合方案化疗虽可延长生存期,但疗效不尽人意。随着精准医疗时代的到来,NSCLC的治疗方案由传统化疗发展为个体化精准治疗。虽近几十年基于EGFR、ALK、ROS1等肺腺癌驱动基因的靶向药物极大地改善了肺腺癌患者的生存预后,但这些基因的突变仅存在于部分患者中[8]。因此,寻找NSCLC的新靶点,对于研发治疗肺癌的新靶向药物具有重要的临床意义。多项研究表明多梳蛋白家族成员CBΧ2在肿瘤的恶性进展中发挥着重要作用。Chen等[9]通过对455例乳腺癌组织标本进行免疫组化分析发现CBΧ2在乳腺癌中的表达水平明显高于癌旁组织,并且其异常高表达与乳腺癌的分期晚及预后不良相关。Clermont等[10]研究发现在转移性前列腺癌和去势抵抗性前列腺癌中CBΧ2异常高表达,揭示了CBΧ2能控制细胞增殖和转移的许多关键调控因子的表达,从而促进其恶性增殖和侵袭转移能力。目前CBΧ2与肿瘤的研究仍处于初步阶段,其作用及机制仍需进一步探索。本文只是基于数据库大样本量对基因表达水平进行分析,缺乏对蛋白水平的进一步验证.可以明确的是CBΧ2的表达与NSCLC患者预后相关,但其作用机制需要进一步的实验证明。

综上所述,我们通过对基因数据库中肿瘤CBΧ2基因与NSCLC的相关信息深入挖掘分析,提示CBΧ2在NSCLC组织中高表达,且与NSCLC预后相关。本文结果为探索CBΧ2影响NSCLC进展机制奠定了理论基础,同时CBΧ2的表达在一定程度上可作为反映NSCLC预后的重要生物标志物,可能为NSCLC早期诊断、判断预后和治疗提供临床依据。

【参考文献】

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[8]宋勇,高健伟.精准医学时代的晚期非小细胞肺癌内科治疗进展[J].医学研究生学报,2017,30(11):1121-1127.

[9]ChenWY,ZhangXY,LiuT,etal.Chromoboxhomolog2protein:AnovelbiomarkerforpredictingprognosisandTaxolsensitivityinpatientswithbreastcancer[J].OncolLett,2017,13(3):1149-1156.

[10]ClermontPL,CreaF,ChiangYT,etal.IdentificationoftheepigeneticreaderCBΧ2asapotentialdrugtargetinadvancedprostatecancer[J].ClinEpigenetics,2016,8(1):16-30.

通信作者:秦丽丽,E-mail:veritasdoct168@163.com

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