离子束重组异常汉逊酵母菌Ar_Han0458的转录组学分析及谷胱甘肽代谢途径富集

离子束重组异常汉逊酵母菌Ar_Han0458的转录组学分析及谷胱甘肽代谢途径富集

论文摘要

研究可稳定遗传的重组异常汉逊酵母ArHan0458在发酵过程中的差异基因表达信息及与谷胱甘肽代谢相关基因的表达变化。利用生物信息学方法分析重组异常汉逊酵母ArHan0458的5个发酵时间点的RNA-seq数据。重组异常汉逊酵母ArHan0458各发酵时间与0 h相比,下调表达基因数量多于上调表达;除发酵96和72 h外,相邻时间点的差异表达基因数目均以下调为主;发酵48和72 h时的基因表达谱相近。各发酵时间点间差异表达基因显著富集的GO功能均以细胞过程、细胞和催化活性为主。KEGG富集分析显示,10个差异表达基因参与了谷胱甘肽的代谢,谷胱甘肽的合成速率分别在24和96 h达到峰值,与实验测得胞外GSH产量变化趋势一致。重组异常汉逊酵母ArHan0458在发酵96 h时差异表达基因数目以上调为主,且谷胱甘肽合成速率最快。该研究为重组异常汉逊酵母的代谢调控研究及其分子育种提供了理论依据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 菌株
  •   1.2 培养基
  •   1.3 方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 RNA-seq数据质量控制及序列比对
  •   2.2 差异表达基因
  •   2.3 GO功能富集
  •   2.4 KEGG代谢通路富集
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张寒玉,唐朝,冯光文,毛培宏,蔡长龙

    关键词: 重组异常汉逊酵母菌,转录组,差异表达基因,谷胱甘肽,代谢

    来源: 食品与发酵工业 2019年10期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑

    专业: 一般化学工业

    单位: 新疆大学物理科学与技术学院放射生态与离子束生物技术中心,西安工业大学离子束生物工程与生物多样性研究中心

    基金: 国家自然科学基金项目(11575149,31760016)

    分类号: TQ920.1

    DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.019909

    页码: 10-15

    总页数: 6

    文件大小: 1566K

    下载量: 168

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