基于高通量测序分析刺梨果渣自然发酵过程中细菌群落结构及多样性

基于高通量测序分析刺梨果渣自然发酵过程中细菌群落结构及多样性

论文摘要

为分析刺梨果渣自然发酵过程中各阶段的细菌群落结构及多样性,利用MiSeq高通量测序技术检测自然发酵刺梨果渣中细菌的16S rDNA基因V3~V4高变区序列,比较发酵6~60 d(每隔6 d取一次样)时细菌群落的差异。结果显示:10个不同发酵时期样本中共检测而出26个门类、40个纲类群、74个目类群、162个科类群、373个属类群。在整个发酵过程中,主要以葡糖杆菌属和醋酸杆菌属为主。发酵结束后,在门相对水平丰度值依次是变形菌门(Proteobacteria,99.85%)、厚壁菌门(Firmicutes,0.03%)、放线菌门(Actinobacteria,0.02%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,0.02%),在整个发酵过程中变形菌门占主要地位;在属相对水平丰度值排前面的葡糖杆菌属(Gluconobacter,65.37%)和醋酸杆菌属(Acetobacter,33.66%)为刺梨果渣发酵过程中绝对的优势菌;发酵后期细菌群落趋于稳定,表明刺梨果渣自然发酵过程中微生物群落结构变化是相对稳定的。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与仪器
  •   1.2 实验方法
  •     1.2.1 刺梨发酵液制备
  •     1.2.2 样品总DNA的提取
  •     1.2.3 细菌16S rDNA基因PCR扩增
  •     1.2.4 Illumina MiSeq高通量测序
  •     1.2.5 多样性分析
  •     1.2.6 群落组成分析
  •   1.3 数据处理
  • 2 结果与分析
  •   2.1 琼脂糖凝胶电泳鉴定
  •   2.2 物种多样性分析
  •   2.3 物种组成分析
  •   2.4 物种的优势菌群可视化分析
  •   2.5 细菌群落的主成分分析
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 谢丹,刘晓燕,毕远林,宋明发,梁芳芳,许粟,何劲,马立志

    关键词: 刺梨果渣,自然发酵,高通量,细菌群落,多样性

    来源: 食品工业科技 2019年22期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学,轻工业手工业

    单位: 贵州大学酿酒与食品工程学院,贵阳学院食品与制药工程学院,贵州茅台酒厂(集团)习酒有限责任公司,贵州省果品加工工程技术研究中心

    基金: 贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2017]2802),贵州省教育厅自然科学研究项目(黔教合KY字[2015]397号),贵州省果品加工,贮藏与安全控制协同创新中心项目(20130355110),贵州省果品加工工程技术研究中心项目建设(黔科合农G字[2011]4001号),贵阳市科技局贵阳学院专项资金(GYU-KYZ[2018]01-13)

    分类号: TS209;TS201.3

    DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2019.22.020

    页码: 110-114

    总页数: 5

    文件大小: 268K

    下载量: 186

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