猛禽及其近缘类群味觉基因的适应性进化研究

猛禽及其近缘类群味觉基因的适应性进化研究

论文摘要

味觉在鸟类食物的选取中具有重要作用。食性不同,味觉亦可能随之发生适应性进化。本研究以猛禽及其近缘类群为研究对象,比较分析了味觉传导通路基因在不同类群中的适应性进化。我们首先通过舌组织转录组测序获得味觉基因编码区序列,然后用PAML软件中支模型,支位点模型和Clade模型分析了这些味觉基因在不同类群中的正选择信号。研究结果显示,研究类群的味觉基因发生了广泛的适应性进化,不同类群味觉基因表现出不同的进化模式。这可能与不同类群食性的多样性密切相关。味觉基因的谱系发育分析结果显示,不同猛禽类群如鹰形目,隼形目以及鸮形目的鲜味受体基因TAS1R1和TRPM5基因分别聚在一起,暗示不同猛禽的相关味觉基因可能发生了趋同进化。我们的研究结果显示味觉基因在猛禽及其近缘类群中普遍遭受强的正选择,这可能说明味觉在不同鸟类类群的适应性进化中起到较重要的作用。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第一章 引言
  •   1.1 猛禽及其近缘类群食性概述
  •   1.2 味觉传导通路
  •   1.3 味觉基因的适应性进化研究
  •   1.4 研究目的及意义
  • 第二章 材料和方法
  •   2.1 实验材料
  •     2.1.1 研究对象及样本采集
  •     2.1.2 实验仪器与设备
  •     2.1.3 实验试剂
  •     2.1.4 实验耗材
  •   2.2 实验方法
  •     2.2.1 组织样获取
  •     2.2.2 转录组测序的实验操作流程
  •     2.2.3 序列组装
  •   2.3 数据的处理与分析
  •     2.3.1 味觉基因的获取
  •     2.3.2 序列的处理
  •     2.3.3 基因正选择压力分析
  •     2.3.4 系统发育分析
  • 第三章 结果
  •   3.1 适应性进化分析
  •     3.1.1 鸮形目正选择结果
  •     3.1.2 隼形目正选择结果
  •     3.1.3 鹰形目正选择结果
  •     3.1.4 Passerimorphae正选择结果
  •     3.1.5 叫鹤目正选择结果
  •     3.1.6 Coraciimorphae正选择结果
  •     3.1.7 正选择基因功能
  •   3.2 系统发育分析
  •     3.2.1 TAS1R1 基因系统发育分析
  •     3.2.2 TAS1R3 基因系统发育分析
  •     3.2.3 TRPM5 基因系统发育分析
  • 第四章 讨论与结论
  •   4.1 讨论
  •   4.2 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 赵远勤

    导师: 武永华

    关键词: 猛禽,转录组测序,食性分化,味觉,正选择,谱系发育

    来源: 东北师范大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 东北师范大学

    分类号: Q951

    总页数: 47

    文件大小: 1460K

    下载量: 104

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