肽质指纹图谱论文_陈芳,徐世晓,李晓辉,刘超,周建飞

导读:本文包含了肽质指纹图谱论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:图谱,指纹,甘薯,标记,多样性,猕猴桃,复方。

肽质指纹图谱论文文献综述

陈芳,徐世晓,李晓辉,刘超,周建飞[1](2019)在《基于SSR标记的80份烟草种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析》一文中研究指出利用均匀分布于烟草24个连锁群上的48个SSR标记对80份烟草材料进行分析。结果显示,48个SSR标记共扩增出211个等位基因,平均每个标记4.396个,Shannon′s信息指数I为1.034,多态信息含量值为0.229~0.905,观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和Nei′s多样性指数(H)平均值分别为0.320、0.572、0.431。聚类结果表明,在遗传距离为0.68时可以将80份烟草种质分为2个类群。5个烟草居群间的遗传一致度在0.643~0.765范围内,遗传距离分布在0.268~0.442。筛选4对核心引物构建了不同烟草种质资源的数字指纹图谱,可将这80份烟草种质资源全部区分开。本研究在分子水平上为筛选优质烟草种质资源、挖掘重要基因以及拓宽烟草育种遗传基础等工作提供科学依据。(本文来源于《作物杂志》期刊2019年01期)

邹梁峰,廖光联,黄春辉,钟敏,陶俊杰[2](2018)在《基于SSR标记的猕猴桃种质指纹图谱构建与聚类分析》一文中研究指出猕猴桃为雌雄异株多年生藤本植物,全世界有75个种,中国有73个种,遗传资源非常丰富。中国多数种集中分布于秦岭以南、横断山脉以东的地域。猕猴桃属现行的分类系统主要是依据果实和叶表皮上被茸毛的类型和程度以及果实表面的斑点等少数几个形态学性状。由于该属的地理分布特点,其生境复杂,植株形态差异很大,且该属植物种间自然杂交频繁,染色体组基数大且倍性复杂,可能存在同物异名或同名异物的现象。仅从形态学特征对猕猴桃属植物进行系统学研究已经不能得到一个完全可接受的分类系统。并且随着猕猴桃产业的发展,异地间品种交换频繁,若不及时对品种进行有效登记管理,品种资源会日益混乱。依托有效可靠的分子标记技术建立猕猴桃品种指纹体系,进行种质资源的遗传多样性研究是对种质资源进行评估的重要环节,可为物种起源与进化的研究和遗传多样性的分析提供了方便,并为解决猕猴桃属植物的分类学上某些疑难问题提供分子证据,同时为其种质资源的保护和优良猕猴桃品种培育提供科学依据。本研究以江西省宜春市、赣州市采集的72份猕猴桃种质为供试材料,利用SSR分子标记技术构建DNA指纹图谱并进行聚类分析和遗传多样性分析。研究结果表明,从100条引物中筛选出的6对多态性较好的引物可以完全鉴别供试材料,其多态性达100%,6对多态性引物共检测到70个等位基因,每对引物可检测到的等位基因数为9~17,平均为11.7;用PIC-Calc软件计算多态性信息含量(PIC)变化范围在0.792~0.904之间,平均为0.828;据Nei’s的计算方法对供试材料进行遗传距离的统计分析,可以看出品种间的遗传距离范围在0.029~0.329之间,平均遗传距离为0.176,其中遗传距离最近的是‘赣雄6号’和‘毛雄5号’、‘奉黄3号’和‘赣金3号’、‘中雄15号’和‘中雄23号’、‘过雄1号’和‘野雄1号’、‘南源1号’和‘赣金5号’、‘庐山香’和‘早金’、均为0.029;遗传距离最远的是‘金魁’和‘华特’、‘华特’和‘红华’、‘红华’和‘麻毛4号’、‘南源2号’和‘麻毛4号’,均为0.329;经PowerMarkerV3.25软件对扩增结果进行聚类,系谱图显示,72份猕猴桃种质在相似系数0.087的水平上,可将供试材料分为6类,其结果与传统的形态学分类大体一致。(本文来源于《中国园艺学会2018年学术年会论文摘要集》期刊2018-10-17)

聂立圆,李爱贤,秦桢,王庆美,侯夫云[3](2018)在《基于SSR标记的132份甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析》一文中研究指出利用SSR分子标记技术,构建132份甘薯种质的DNA指纹图谱,并进行遗传多样性分析,旨在为甘薯种质资源亲缘关系鉴定、分类提供理论依据。利用筛选的核心引物进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测显示,19对引物共扩增出232个条带,其中多态性条带165条,多态性比率为71.1%,平均每对引物扩增出8.68个条带,多态性信息含量变化范围在0.6706~0.9331之间,平均为0.8158;其中引物SSR9和引物C33可将132份种质完全区分开,并构建供试材料的DNA指纹图谱,供试材料遗传距离在0.0363~0.5939之间,平均为0.4087,表明种质资源间遗传多样性丰富。基于SSR标记对供试材料进行聚类分析,将供试材料分为2个类群,第Ⅰ类群分为两个亚类,第Ⅰ-1亚类包括济薯25和3份日本引进品种日本金千贯、安纳芋、日本薯;第Ⅰ-2亚类包括济徐薯23、苏丹、济薯09281。第Ⅱ类群分为两个亚类,第Ⅱ-1亚类由S07甘薯品系和与其亲缘关系较近的20份甘薯种质组成;第Ⅱ-2亚类由剩余的70份甘薯种质组成,为甘薯分子辅助育种中亲本的选择提供理论依据。(本文来源于《植物遗传资源学报》期刊2018年05期)

褚延斌,苏小琴,周学谦,李德坤,余伯阳[4](2018)在《基于液质指纹图谱和化学模式识别的注射用益气复脉(冻干)质量综合评价研究》一文中研究指出目的采用UPLC-Q-TOF-MSE技术建立注射用益气复脉(冻干)(YQFM)的指纹图谱,为直观、简便、全面地评价其质量提供依据。方法采用Waters Acquity UPLC HSS T3(100 mm×2.1 mm,1.8μm)色谱柱,以乙腈-0.1%甲酸水体系梯度洗脱,体积流量0.3 m L/min,柱温30℃,进样量5μL;质谱检测采用负离子ESI模式,电压2.5 k V,离子源温度100℃,雾化气温度400℃,雾化气流量800 L/h。选择基峰离子流色谱图(BPC)进行指纹图谱研究,并计算相似度。同时将指纹图谱共有峰的数据以预处理后的离子响应强度为变量,导入SPSS 19.0软件,进行聚类分析(HCA)和主成分分析(PCA),并由分析软件Simca-P 12.0作图。结果首次建立了YQFM的UPLC-Q-TOF-MSE指纹图谱,并确定了18个共有峰,其中15个来自红参,3个来自麦冬;根据对照品和参考文献定性指认了其中16个色谱峰;28批YQFM的相似度均在0.970以上。聚类分析结果为当欧氏距离平方和为5~10时,28批YQFM样品可以聚为4类;主成分降维提取了7个主成分,反映了原变量84.989%的信息,通过拟合归纳第1主成分的载荷因子模型,筛选出对样品质量影响较大的10种标记物。结合主成分得分构建了不同批次YQFM综合评价函数:Y=0.420 3 PC1+0.133 8 PC2+0.084 2 PC3+0.064 4 PC4+0.061 1PC5+0.046 1 PC6+0.040 0 PC7,并对各批次综合得分进行了排序,28批供试样品中,S28综合得分最高,其次为S22、S11和S9,S14和S13的综合得分最低。结论 UPLC-Q-TOF-MSE指纹图谱结合化学模式识别可以对YQFM的质量进行客观、有效地评价,为其质量控制提供科学依据。(本文来源于《中草药》期刊2018年10期)

聂立圆[5](2018)在《基于SSR标记甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析》一文中研究指出甘薯为同源六倍体(2n=6x=90),存在部分异源,染色体数量多且不稳定,甘薯基因型高度杂合,遗传背景极其复杂,存在自交不亲和以及同一不孕群内杂交不亲和等现象,是图谱构建、QTL定位等研究方面较困难的作物之一。本研究以国内75个甘薯品种为研究材料,利用SSR分子标记技术构建75个甘薯品种的指纹图谱,同时利用农艺性状分析和SSR分子标记分析获得75个甘薯品种的遗传距离,并进行聚类分析,探讨其遗传多样性,旨在为甘薯种质资源鉴定和亲缘关系分析提供理论基础,为甘薯杂交育种中亲本的选择提供参考。主要研究结果如下:1、本研究对75个甘薯品种的叶片形状、顶叶色、薯肉色、最长蔓长、基部分支数、茎粗、干率、块根产量等14个综合农艺性状进行测定,经赋值将数据标准化,计算得到供试甘薯品种各个性状的平均变异系数为27.64%~69.33%,该结果表明,供试甘薯品种间形态多样性较丰富。2、本研究利用75个甘薯品种的农艺性状对其进行遗传多样性分析,利用DPS3.01数据统计软件计算各品种间的欧式遗传距离。结果显示,75个甘薯品种间遗传距离是2.2361~12.6491,平均为6.7878,表明供试甘薯品种的遗传多样性丰富。在遗传距离GD=7.13时,通过非加权组平均法(UPGMA)将75个甘薯品种分为四大类:Ⅰ类、Ⅱ类、Ⅲ类、Ⅳ类,GD=5.06时,第Ⅰ类被分为4亚类Ⅱ-1、Ⅱ-2、1-3、1-4,第Ⅳ类被分为2亚类:Ⅳ-1、Ⅳ-2。3、选择已公布的90对甘薯SSR引物,以甘薯品种阜Y6-7和万薯8号基因组DNA为模板进行PCR扩增,筛选出19对核心引物,引物多态性信息含量(PIC)的平均值为0.8149,变幅为0.6757~0.9317。19对引物在75个甘薯品种中共扩增出232个等位位点,平均每对引物扩增出12.21个;共扩增出多态性位点165个,每对引物扩增出多态性位点数4-18个,平均8.68个,多态性比率为71.1%。75个甘薯品种在19对引物中表现出丰富多样性,表明本研究所选引物能够很好区分各研究材料,可用于甘薯种质鉴定。4.本研究采用人工读带的方法,SSR引物扩增出多态性位点的有无以“1”、“0”表示,统计19对引物的扩增情况,然后利用NTSYS-pc 2.10计算75个甘薯品种之间的遗传距离(GD),甘薯品种间遗传距离范围是0.0455~0.7333,平均为0.4646。由遗传距离可知,供试甘薯品种间的遗传多样性较丰富。非加权组平均法聚类图将75个甘薯品种分为六类:Ⅰ类、Ⅱ类、Ⅲ类、Ⅳ类、Ⅴ类、Ⅵ类,第Ⅰ类包含63个甘薯品种,分为17亚类。5.综合考虑引物PIC值大小、基因型数和等位基因数等因素,在19对SSR引物中进一步筛选出多态性好的2对引物——引物SSR9和引物C33,在75个甘薯品种中扩增,其多态性信息含量(PIC)均大于0.9,引物SSR9多态性等位基因数为18个,基因型数74个,引物C33多态性位点为14个,基因型数52个。按照引物SSR9、C33的顺序,将等位基因按照0、1方式转化的代码串联,构建75个甘薯品种的数字指纹图谱,形成代表每个甘薯品种的字符串,用于鉴定甘薯种质。6.农艺性状分析与SSR标记遗传距离矩阵相关性分析中,相关系数r=0.0326,表明两矩阵之间相关性不显着。二者聚类分析结果显示,农艺性状相同或相似的品种在SSR标记聚类时分布在不同分支中。(本文来源于《山东大学》期刊2018-05-20)

郑纪伟,教忠意,窦全琴,黄利斌,何旭东[6](2018)在《利用荧光SSR标记构建含笑种质指纹图谱》一文中研究指出本研究基于高通量荧光SSR标记基因分型技术构建了16份含笑种质的指纹图谱。13对来自近缘种的SSR标记共检测到102条等位片段,每个位点等位基因数5~11不等,平均为7.8个。观测杂合度(Ho)变化范围为0.125 0~0.562 5,平均为0.365 0;期望杂合度(He)变化范围为0.670 3~0.911 3,平均为0.809 9;多态信息量(PIC)变化范围为0.574 8~0.871 4,平均为0.751 5。优选的4对核心引物中,LT106与SGA5组合、LT106与LT58组合以及SGA5与MMA51组合可完全区分16份含笑种质。聚类结果显示16份含笑种质遗传相似系数在0.70~0.90之间,同一种内的不同个体均能很好的聚在一起。本研究建立的荧光SSR基因分型体系高效、快速、准确,不但能为含笑属种质鉴定及新品种保护提供科学理论依据,同时也能为含笑进一步育种工作奠定坚实的基础。(本文来源于《分子植物育种》期刊2018年14期)

应东山[7](2012)在《78份杧果种质指纹图谱构建》一文中研究指出杧果(Mangifera indica L.)又称芒果,为漆树科(Anacardiaceae)杧果属(Mangifera L.)常绿果树,是着名的热带亚热带水果,享有“热带果王”之美誉,世界五大名果之一。本论文采用AFLP、ISSR分子标记技术检测我国不同省份部分杧果种质间的DNA多态性,分析亲缘关系远近,通过对供试材料DNA电泳图谱进行比较分析,筛选出能够鉴别各种质的特征条带,旨在构建78份供试杧果指纹图谱,以期在种质鉴定、新品种登记、注册和产权保护等方面提供参考,为进一步构建杧果指纹库奠定基础。主要研究结果如下:1.利用AFLP标记技术对78份杧果种质进行遗传多样性分析,9对AFLP引物(M1E1、M1E3、M2E3、M3E1、M3E4、M4E3、M6E1、M6E4、M7E4)共产生908个等位位点,平均每对引物产生100.89个等位位点,多态性带为794条,共产生42个特异性位点,能区分21份种质,单态带25条,缺失带17条,特异性条带比例为4.63%,多态性比例为87.44%,其中多态性比例最高的引物组合是M1E3(97.59%),多态性比例最低的组合是M3E1(82.18%)。扩增出特异性条带最多的组合是M3E4、M6E4。不同种质间的相似系数范围是0.603-0.913,平均相似系数为0.735。聚类分析结果显示,以遗传相似性系数0.726为阀值,供试的78份种质可分成5个类群。2.利用ISSR标记技术从100条引物中筛选的12条多态性高且重复性好的ISSR引物对所有种质进行PCR扩增,共扩增出148条谱带,平均每个引物扩增出12.3条,多态性百分率为95.95%,杧果各种质间的遗传相似性系数变幅范围为0.4272-0.8644,平均相似性系数为0.761,引物855扩增的条带数量最多,为19条,作为优选引物。以遗传相似性系数0.612为阀值,聚类分析可将78份种质分为5个类群。3.对78份杧果种质进行AFLP、ISSR综合聚类分析,以遗传相似性系数0.706为阀值,供试的78份杧果种质可分为5个类群,不同地理来源的种质在不同的类群,同一地区的种质又进一步形成不同亚类群。AFLP和ISSR标记所揭示的杧果种质间的遗传关系有一致之处,亦有不同的地方它们不能互相代替,相互结合,相互印证,才能更全面的阐明杧果分类结果。4.本实验构建了78份杧果种质材料的AFLP指纹图谱,选取6对多态性高、重复性好、分辨率高的AFLP引物作为基准引物,将6对引物分别用字母A、B、C、D、E、 F表示,它们分别是M1E1、M1E3、M3E1、M3E4、M6E1、M7E4,选择多态性高的扩增区域的指纹进行按片段从大到小编码,由此每个品种都能形成由6个英文字母和数字组成的条形码,这一条形码即是该品种的指纹。5. ISSR结果显示,筛选的12对ISSR引物共扩增出有单态带的种质有6份,它们分别是桂热杧284号、冬杧、红花本地杧、红萍杧、关刀杧、桂香杧,其中前面4份种质在AFLP中也含有特异性条带,后面2份种质在AFLP扩增中没有表现出特异性条带。构建ISSR指纹图谱,从另一个角度对AFLP指纹进行了进一步的验证和补充。6.初步筛选出龙州泰国杧、元江象牙杧、龙井大杧、文昌白玉、龙杧、矮杧、红苹杧、杨杧、冬杧、扁桃杧等21份具有特异条带的种质。(本文来源于《海南大学》期刊2012-06-01)

张西辉[8](2007)在《复方山楂制剂液质指纹图谱研究》一文中研究指出本文以复方山楂制剂为研究对象,采用HPLC-DAD-MS/MS法进行多维指纹图谱研究,建立指纹图谱检测方法并对色谱峰进行成分归属解析,为制剂质量的全面控制奠定基础。主要内容如下:建立了复方山楂制剂HPLC-DAD-MS/MS多维指纹图谱检测方法。采用RP-HPLC(DAD)法,选用色谱柱为Eclipse XDB-C18,5μm,4.6×250mm (Agilent),柱温为20℃,流速1ml·min-1,检测波长260nm,流动相为0.1%甲酸的乙腈溶液(A)- 0.1%甲酸的水溶液(B),梯度洗脱(v/v):0min时5%:95%,10min时10%:90%,90min时17%:83% ,100min时19%:81%,110min时19%:81%,130min时23%:77%,140min时23%:77%,160min时30%:70%,190min时60%:40%,200min时100%:0%, 200min时100%:0%。质谱条件:雾化电压:4.5kV,毛细管温度:300℃,毛细管电压:35V,氮气流速:30arb,氦气流速:5arb,扫描方式:正负离子全扫描,扫描范围:m/z 150-1200;二级质谱采用Depending Scan模式,对复方山楂制剂进行测定。通过紫外指纹图谱方法学考察,精密度、稳定性、重现性试验RSD均小于3%。对复方山楂制剂指纹图谱中的36个色谱峰进行了化学成分归属解析,及其对应的药材归属进行了分析,为制剂及其药材质量控制奠定了基础。(本文来源于《天津大学》期刊2007-06-01)

肽质指纹图谱论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

猕猴桃为雌雄异株多年生藤本植物,全世界有75个种,中国有73个种,遗传资源非常丰富。中国多数种集中分布于秦岭以南、横断山脉以东的地域。猕猴桃属现行的分类系统主要是依据果实和叶表皮上被茸毛的类型和程度以及果实表面的斑点等少数几个形态学性状。由于该属的地理分布特点,其生境复杂,植株形态差异很大,且该属植物种间自然杂交频繁,染色体组基数大且倍性复杂,可能存在同物异名或同名异物的现象。仅从形态学特征对猕猴桃属植物进行系统学研究已经不能得到一个完全可接受的分类系统。并且随着猕猴桃产业的发展,异地间品种交换频繁,若不及时对品种进行有效登记管理,品种资源会日益混乱。依托有效可靠的分子标记技术建立猕猴桃品种指纹体系,进行种质资源的遗传多样性研究是对种质资源进行评估的重要环节,可为物种起源与进化的研究和遗传多样性的分析提供了方便,并为解决猕猴桃属植物的分类学上某些疑难问题提供分子证据,同时为其种质资源的保护和优良猕猴桃品种培育提供科学依据。本研究以江西省宜春市、赣州市采集的72份猕猴桃种质为供试材料,利用SSR分子标记技术构建DNA指纹图谱并进行聚类分析和遗传多样性分析。研究结果表明,从100条引物中筛选出的6对多态性较好的引物可以完全鉴别供试材料,其多态性达100%,6对多态性引物共检测到70个等位基因,每对引物可检测到的等位基因数为9~17,平均为11.7;用PIC-Calc软件计算多态性信息含量(PIC)变化范围在0.792~0.904之间,平均为0.828;据Nei’s的计算方法对供试材料进行遗传距离的统计分析,可以看出品种间的遗传距离范围在0.029~0.329之间,平均遗传距离为0.176,其中遗传距离最近的是‘赣雄6号’和‘毛雄5号’、‘奉黄3号’和‘赣金3号’、‘中雄15号’和‘中雄23号’、‘过雄1号’和‘野雄1号’、‘南源1号’和‘赣金5号’、‘庐山香’和‘早金’、均为0.029;遗传距离最远的是‘金魁’和‘华特’、‘华特’和‘红华’、‘红华’和‘麻毛4号’、‘南源2号’和‘麻毛4号’,均为0.329;经PowerMarkerV3.25软件对扩增结果进行聚类,系谱图显示,72份猕猴桃种质在相似系数0.087的水平上,可将供试材料分为6类,其结果与传统的形态学分类大体一致。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

肽质指纹图谱论文参考文献

[1].陈芳,徐世晓,李晓辉,刘超,周建飞.基于SSR标记的80份烟草种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析[J].作物杂志.2019

[2].邹梁峰,廖光联,黄春辉,钟敏,陶俊杰.基于SSR标记的猕猴桃种质指纹图谱构建与聚类分析[C].中国园艺学会2018年学术年会论文摘要集.2018

[3].聂立圆,李爱贤,秦桢,王庆美,侯夫云.基于SSR标记的132份甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析[J].植物遗传资源学报.2018

[4].褚延斌,苏小琴,周学谦,李德坤,余伯阳.基于液质指纹图谱和化学模式识别的注射用益气复脉(冻干)质量综合评价研究[J].中草药.2018

[5].聂立圆.基于SSR标记甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析[D].山东大学.2018

[6].郑纪伟,教忠意,窦全琴,黄利斌,何旭东.利用荧光SSR标记构建含笑种质指纹图谱[J].分子植物育种.2018

[7].应东山.78份杧果种质指纹图谱构建[D].海南大学.2012

[8].张西辉.复方山楂制剂液质指纹图谱研究[D].天津大学.2007

论文知识图

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