西南地区PRRSV分子流行病学调查及其类NADC30株基因组特征分析

论文摘要

为了解我国西南地区猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）流行株的遗传变异和分子流行病学情况。本研究采集2018年我国四川、重庆、贵州和云南4省共计41个猪场292份疑似PRRS患病保育猪病料样本（肺脏样本48份和血清样本244份）,对其进行PRRSV ORF7基因的检测和流行株全基因组特征分析。结果显示PRRSV的检出率为44.18%（95%confidence interval （CI）=38.4%～50.1%,129/292）。通过RT-PCR检测129份阳性样本的NSP2基因,结果有64份样品检出该基因。经测序分析表明类NADC30病毒株、高致病性病毒株（HP-PRRSV）和经典株的检出率分别为70.3%（95%CI=57.6%～81.1%,45/64）、12.5%（95%CI=5.6%～23.2%,8/64）和17.2%（95%CI=8.9%～28.7%,11/64）。通过对7株病毒基因组同源性分析结果表明其均与类NADC30病毒株SD53-1603同源性最高,为95.6%～96.4%,与欧洲型病毒株LV同源性最低,为58.7%～59.5%;通过对7株PRRSV基因组进行遗传演化分析结果显示其均与类NADC30病毒株聚为一大支;重组分析结果显示其均未与任何病毒株发生基因重组。序列分析显示7株病毒株均在GP5蛋白发生了一个氨基酸（S/N33）的缺失,并且存在该缺失模式的病毒已经在我国其它地区存在和流行。本研究表明近年来我国西南地区类NADC30病毒株的感染率呈逐年上升趋势,并且已经成为西南地区PRRSV的优势流行株。提示规模化养殖场应更加注重生物安全,完善引种程序,避免引入新的类NADC30病毒株。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 周群,周可磊,胡承哲,李玉,任玉鹏,岳华,张斌

关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒,分子流行病学,遗传变异,基因缺失

来源: 中国预防兽医学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 西南民族大学生命科学与技术学院,国家民族事务委员会青藏高原动物疫病防控创新团队

基金: “十三五”国家重点研发计划(2016YFD0500907),西南民族大学中央高校青年项目(2017NZYQN01)

分类号: S852.651

页码: 1275-1279

总页数: 5

文件大小: 1289K

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