变形假单胞菌葡萄糖酸脱氢酶操纵子的克隆与分析

变形假单胞菌葡萄糖酸脱氢酶操纵子的克隆与分析

论文摘要

该研究旨在明确变形假单胞菌JUIM01葡萄糖酸脱氢酶操纵子的结构及其基本的生物学信息。采用LA-PCR技术,从菌株JUIM01中克隆葡萄糖酸脱氢酶操纵子(gad操纵子)的全长序列;利用在线生物信息学工具,对克隆的序列进行分析;通过对变形假单胞菌膜结合葡萄糖酸脱氢酶的组成和结构分析,初步验证克隆和序列分析的结果。研究结果表明,变形假单胞菌gad操纵子具有3个结构基因gndS、gndL和gndC,分别编码膜结合葡萄糖酸脱氢酶的3个亚基。变形假单胞菌gndS基因与解淀粉欧文氏菌CFBP1430葡萄糖酸脱氢酶小亚基的编码基因的序列一致性为59.89%,其编码的蛋白属于gluconate2-dh3 superfamily,为跨膜蛋白;基因gndL与铜绿假单胞菌PAMH19葡萄糖酸脱氢酶大亚基的编码基因的序列一致性为77.68%,其编码的蛋白属于GMCoxredC superfamily,为跨膜蛋白;基因gnd C与香茅醇假单胞菌P3B5葡萄糖脱氢酶中亚基的编码基因的序列一致性达85.31%,其编码的蛋白属于CccA superfamily。该结果为变形假单胞菌葡萄糖酸脱氢酶的转录调控机制研究提供了一定的理论基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与试剂
  •     1.1.1 菌株和质粒
  •     1.1.2 变形假单胞菌膜结合GADH
  •     1.1.3 主要试剂和工具酶
  •   1.2 仪器与设备
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 变形假单胞菌基因组DNA的提取
  •     1.3.2 PCR引物的设计与合成
  •     1.3.3 变形假单胞菌gad操纵子的扩增
  •     1.3.4 PCR产物的回收、与克隆载体的连接及转化
  •     1.3.5 变形假单胞菌gad操纵子的生物信息学分析
  •     1.3.6 变形假单胞菌gad操纵子生物信息学分析结果的初步验证
  • 2 结果与分析
  •   2.1 变形假单胞菌gad操纵子的克隆和重组质粒的构建
  •   2.2 变形假单胞菌gad操纵子的结构基因组成
  •   2.3 变形假单胞菌gad操纵子上下游非编码区的序列分析
  •   2.4 变形假单胞菌gad操纵子中结构基因的生物信息学分析
  •   2.5 变形假单胞菌膜结合GADH组成和结构的初步分析
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 宋玉玲,孙雷,孙文敬,王大明,崔凤杰,齐向辉

    关键词: 变形假单胞菌,葡萄糖酸脱氢酶,操纵子,克隆,生物信息学

    来源: 食品科技 2019年07期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 江苏大学食品与生物工程学院,江南大学生物工程学院,江西省德兴市百勤异VC钠有限公司

    基金: 国家自然科学基金项目(31571885),国家高技术研究发展计划项目(2012AA022103),“十三五”国家重点研发计划重点专项(2017YFC1600806),江苏高校优势学科建设工程项目(PAPD),江西省科技计划项目(赣知发[2015]64号),江西省创新团队建设计划项目(20142BCB24024),德兴市科技计划项目(德科发[2015]44号)

    分类号: Q78

    DOI: 10.13684/j.cnki.spkj.2019.07.007

    页码: 43-49

    总页数: 7

    文件大小: 3349K

    下载量: 87

    相关论文文献

    • [1].变形假单胞菌吡咯喹啉醌合成基因簇的克隆与分析[J]. 食品与生物技术学报 2020(06)
    • [2].澳洲墨瑞鳕源鱼假单胞菌的致病性及药敏特性研究[J]. 中国预防兽医学报 2020(08)
    • [3].稻皮假单胞菌的分离与鉴定[J]. 公共卫生与预防医学 2017(04)
    • [4].红假单胞菌的分离鉴定及有机肥盐度对其生长的影响[J]. 四川畜牧兽医 2014(08)
    • [5].球红假单胞菌对活性炭的降解转化[J]. 东北大学学报(自然科学版) 2015(05)
    • [6].冷鲜梅条肉中假单胞菌生长预测模型的建立与验证[J]. 湖北农业科学 2013(18)
    • [7].煤炭絮凝微生物球红假单胞菌光谱及电镜研究[J]. 中国矿业大学学报 2010(04)
    • [8].387例假单胞菌的分离鉴定和临床药敏分析[J]. 中国实用医药 2009(24)
    • [9].红假单胞菌培养噬菌蛭弧菌的研究[J]. 河北渔业 2008(09)
    • [10].50味中药与8种抗生素对变形假单胞菌的体外抑菌作用[J]. 集美大学学报(自然科学版) 2019(06)
    • [11].一株高效解磷假单胞菌的分离鉴定及解磷特性[J]. 天津农学院学报 2019(04)
    • [12].黄瓜根际土壤产氰假单胞菌筛选及其产氰特性研究[J]. 扬州大学学报(农业与生命科学版) 2019(03)
    • [13].椰毒假单胞菌中毒案例[J]. 法制博览 2016(36)
    • [14].福州地区大黄鱼变形假单胞菌的分离与鉴定[J]. 渔业研究 2016(01)
    • [15].小心!隐藏的米酵菌酸毒素[J]. 发明与创新(大科技) 2020(09)
    • [16].环介导等温扩增技术快速检测椰毒假单胞菌的研究[J]. 食品工业科技 2013(03)
    • [17].海洋交替假单胞菌活性物质的研究[J]. 天然产物研究与开发 2013(04)
    • [18].平菇假单胞菌腐烂病防治研究[J]. 北方园艺 2011(15)
    • [19].基于假单胞菌生长模型预测冷却猪肉的货架期[J]. 食品研究与开发 2018(13)
    • [20].椰毒假单胞菌食物中毒尸检3例[J]. 法医学杂志 2011(01)
    • [21].椰毒假单胞菌中毒机理及其预防措施研究[J]. 现代食品 2019(13)
    • [22].海洋环境中假单胞菌对聚氨酯清漆涂层分解的影响[J]. 表面技术 2019(07)
    • [23].假单胞菌对聚硅氧烷树脂清漆涂层分解及防腐蚀行为的影响[J]. 中国腐蚀与防护学报 2018(04)
    • [24].假单胞菌噬菌体基因组学研究进展[J]. 遗传 2020(08)
    • [25].内生假单胞菌对小麦生长及光合特性的影响[J]. 江苏农业科学 2018(01)
    • [26].变形假单胞菌2-酮基葡萄糖酸转运蛋白基因的克隆与分析[J]. 现代食品科技 2016(06)
    • [27].谨防自制发酵食品中的椰酵假单胞菌[J]. 食品与生活 2017(12)
    • [28].重型肝炎感染窄食假单胞菌的易感因素分析和护理[J]. 当代护士(学术版) 2010(09)
    • [29].大黄鱼人工感染杀香鱼假单胞菌的病理形态学及病原分布的初步研究[J]. 浙江海洋大学学报(自然科学版) 2018(06)
    • [30].假单胞菌的聚-β-羟基丁酸酯聚合酶基因的克隆与表达[J]. 中国食品学报 2018(04)

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    变形假单胞菌葡萄糖酸脱氢酶操纵子的克隆与分析
    下载Doc文档

    猜你喜欢