导读:本文包含了单链阻遏蛋白论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:蛋白,噬菌体,相互作用,蛋白质,亲和力,位点,工程。
单链阻遏蛋白论文文献综述
梁铁兵,谭克辉,种康,朱至清,S[1]（2001）在《噬菌体434单链阻遏蛋白高亲和力DNA配体的筛选和设计》一文中研究指出单链阻遏蛋白ＲＲＴＲＥＳ是噬菌体４３４阻遏蛋白的衍生物，含有两个ＤＢＤ（ＤＮＡ结合结构域），一个是野生型噬菌体４３４的ＤＢＤ－Ｒ，另一个是突变型ＤＢＤ－ＲＴＲＥＳ，二者用重组接头以头接尾的方式连接起来．ＲＴＲＥＳ的ａ－３－螺旋中－１，１，２，５位ＤＮＡ结合氨基酸分别为Ｔ，Ｒ，Ｅ，Ｓ．利用核心序列是ＣＡＴＡＣＡＡＧＡＡＡＧＮＮＮＮＮＮＴＴＴＡＴＧ的随机ＤＮＡ库，体外循环筛选ＲＴＲＥＳ的ＤＮＡ结合位点，将筛选到的群体克隆、测序．单链阻遏蛋白ＲＲＴＲＥＳ的亲和力测定表明，最适操纵区序列含有ＴＴＡＣ或ＴＴＣＣ（上述画线部分）时， Ｋｄ值在 １０－１２～－１１ ｍｏｌ／Ｌ的范围．天然噬菌体４３４阻遏蛋白与其操纵区的亲和力的 Ｋｄ值在１０－９ｍｏｌ／Ｌ数量级，与之相比，所筛选操纵区的亲和力明显提高．同时发现，亲和力大小还受到最适结合位点两侧碱基的影响，特别是５’位碱基的影响．根据ＲＴＲＥＳ的识别特性，设计了共有序列为ＧＴＡＡＧＡＡＡＲＮＴＴＡＣＮ或ＧＧＡＡＧＡＡＡＲＮＴＴＣＣＮ（Ｒ为Ａ或Ｇ）的单链阻遏蛋白ＲＴＲＥＳＲＴＲＥ的操纵区序列．结果表明，它们之间有特异性结合，且亲和力也很高．此方法可望用于其他ＤＮＡ结合蛋白新?(本文来源于《中国科学(C辑:生命科学)》期刊2001年03期）
梁铁兵[2]（2000）在《噬菌体434单链阻遏蛋白的高亲和力DNA结合序列的设计和`筛选》一文中研究指出一．设计和筛选单链阻遏蛋白的高亲和力DNA结合序列 单链阻遏蛋白RR_(TRES)是噬菌体434阻遏蛋白的衍生物，它是噬菌体434阻遏蛋白的N端DBD（1—69位氨基酸）组成的共价二聚体。这个单链分子有两个DBD，一个是野生型噬菌体434的DBD—R，另一个是突变了的DBD—R_(TRES)，二者用重组接头以头接尾的方式连接起来。在R_(TRES)的α3—螺旋中-1、1、2、5位氨基酸与DNA识别紧密相关，它们分别为T、R、E、S。为了筛选出突变的R_(TRES)的DNA结合位点，设计了核心序列为CATACAAGAAAGNNNNNNTTTATG随机DNA库，通过RR_(TRES)与随机DNA库的体外结合和循环筛选。将筛选到的群体克隆并测序。通过与单链阻遏蛋白RR_(TRES)的亲和力测定，对每一个筛选到的序列进行特性分析。结果表明，当结合位点（上述划线部分）为TTAC或TTCC时为最适操纵区序列。它们与单链阻遏蛋白RR_(TRES)的亲和力很高，Kd值在1—10pM的范围。其中随机部分为TTTACG的操纵区与RR_(TRES)的亲和力最高，Kd值约为1pM；当结合位点为TTAC时，平均Kd值为3pM；当结合位点为TTCC时，Kd值在5—10pM之间。天然噬菌体434阻遏蛋白与其操纵区的亲和力的Kd值在nM数量级，与之相比，所筛选操纵区的亲和力明显提高。此外，亲和力大小还受到结合位点两侧的碱基的影响，特别是5'位碱基的影响。 表达纯化同源双突变的单链阻遏蛋白R_(TRES)R_(TRE)，根据R_(TRES)的以上识别特点，设计了一系列新的操纵区序列，它们的共有序列为GTAAGAAARNTTACN，或GGAAGAAARNTTCCN，并测定它们与R_(TRES)R_(TRE)之间的结合特异性。结果表明，它们可被RusRTR田特异识别，且亲和力也很高，Kd值在 5—40pM之间。其中 GLhGAAA…G与 RTRmRTRm之间结合的Kd值约为spM。同样，表达了异源双突变的单链阻遏蛋白R”R，。引 然而它与设计的相关操纵区的亲和力并不很高，Kd值约为 100pM。利用本工作中的随机筛选和合理设计的原则，得到了新的具有特异性识别和高亲和力的蛋白一DNA相互作用。这个方法可望用于其他DBP的新的结合特异性的筛选。二．非同位素的方法筛选单链阻遏蛋白的最佳DNA结合序列初探 克隆和表达了带半眈氨酸尾的单链阻遏蛋白，利用己包彼了马来酚胺的活性板可以与自由琉基结合的特性，将蛋白固定在活性板表面。体外筛选民。s民。。的最佳 DNA结合序列，得到了一些与 RT皿sRT。s结合的序列，但 Kd值 nM数量级。此方法需进一步优化。(本文来源于《中国科学院植物研究所》期刊2000-10-01）
单链阻遏蛋白论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
一．设计和筛选单链阻遏蛋白的高亲和力DNA结合序列 单链阻遏蛋白RR_(TRES)是噬菌体434阻遏蛋白的衍生物，它是噬菌体434阻遏蛋白的N端DBD（1—69位氨基酸）组成的共价二聚体。这个单链分子有两个DBD，一个是野生型噬菌体434的DBD—R，另一个是突变了的DBD—R_(TRES)，二者用重组接头以头接尾的方式连接起来。在R_(TRES)的α3—螺旋中-1、1、2、5位氨基酸与DNA识别紧密相关，它们分别为T、R、E、S。为了筛选出突变的R_(TRES)的DNA结合位点，设计了核心序列为CATACAAGAAAGNNNNNNTTTATG随机DNA库，通过RR_(TRES)与随机DNA库的体外结合和循环筛选。将筛选到的群体克隆并测序。通过与单链阻遏蛋白RR_(TRES)的亲和力测定，对每一个筛选到的序列进行特性分析。结果表明，当结合位点（上述划线部分）为TTAC或TTCC时为最适操纵区序列。它们与单链阻遏蛋白RR_(TRES)的亲和力很高，Kd值在1—10pM的范围。其中随机部分为TTTACG的操纵区与RR_(TRES)的亲和力最高，Kd值约为1pM；当结合位点为TTAC时，平均Kd值为3pM；当结合位点为TTCC时，Kd值在5—10pM之间。天然噬菌体434阻遏蛋白与其操纵区的亲和力的Kd值在nM数量级，与之相比，所筛选操纵区的亲和力明显提高。此外，亲和力大小还受到结合位点两侧的碱基的影响，特别是5'位碱基的影响。 表达纯化同源双突变的单链阻遏蛋白R_(TRES)R_(TRE)，根据R_(TRES)的以上识别特点，设计了一系列新的操纵区序列，它们的共有序列为GTAAGAAARNTTACN，或GGAAGAAARNTTCCN，并测定它们与R_(TRES)R_(TRE)之间的结合特异性。结果表明，它们可被RusRTR田特异识别，且亲和力也很高，Kd值在 5—40pM之间。其中 GLhGAAA…G与 RTRmRTRm之间结合的Kd值约为spM。同样，表达了异源双突变的单链阻遏蛋白R”R，。引 然而它与设计的相关操纵区的亲和力并不很高，Kd值约为 100pM。利用本工作中的随机筛选和合理设计的原则，得到了新的具有特异性识别和高亲和力的蛋白一DNA相互作用。这个方法可望用于其他DBP的新的结合特异性的筛选。二．非同位素的方法筛选单链阻遏蛋白的最佳DNA结合序列初探 克隆和表达了带半眈氨酸尾的单链阻遏蛋白，利用己包彼了马来酚胺的活性板可以与自由琉基结合的特性，将蛋白固定在活性板表面。体外筛选民。s民。。的最佳 DNA结合序列，得到了一些与 RT皿sRT。s结合的序列，但 Kd值 nM数量级。此方法需进一步优化。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
单链阻遏蛋白论文参考文献
[1].梁铁兵,谭克辉,种康,朱至清,S.噬菌体434单链阻遏蛋白高亲和力DNA配体的筛选和设计[J].中国科学(C辑:生命科学).2001
[2].梁铁兵.噬菌体434单链阻遏蛋白的高亲和力DNA结合序列的设计和`筛选[D].中国科学院植物研究所.2000