3种貂属动物MHC-DRB遗传变异的研究

3种貂属动物MHC-DRB遗传变异的研究

论文摘要

主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)作为选择性分子标记,可以体现物种在进化过程中对环境的适应。目前仅有大陆种群及岛屿种群33个紫貂(Martes zibellina)样本MHC-DRB基因的初步研究,缺乏较为全面的紫貂亚种及石貂(Martes foina)、欧洲松貂(Martes martes)MHC基因的研究。我们以PCR结合克隆的方法检测出8个亚种紫貂及欧洲松貂、石貂MHC-DRB等位基因并对其进行多态性分析,结合已发表的鼬科其他动物MHC-DRB基因综合分析适应性遗传变异。主要研究结果如下:(1)在104只紫貂样本中得到35个(26个有效等位基因及9个缺失1bp的假基因序列)DRB 等位基因(241-242bp),分别命名为 Mazi-DRB*01~Mazi-DRB*35;在 17 只欧洲松貂样本中得到14个(11个有效等位基因及3个缺失1bp的假基因序列)DRB等位基因(241-242bp),分别命名为Mama-DRB*01~Mama-DRB*14;在10只石貂样本中得到6个(3个有效等位基因及3个缺失1bp的假基因序列)DRB等位基因(241-242bp),分别命名为 Mafo-DRB*01~Mafo-DRB*06。(2)4种獾属动物中Meles meles的遗传多样性明显高于其他3种獾属动物;鼬属动物中Mustela nivalis遗传多样性明显高于其他3种鼬属动物;海獭属遗传多样性高于其他大部分貂属、獾属、鼬属动物;貂熊属动物遗传多样性低于其他貂属、獾属、鼬属大部分动物;3种貂属动物遗传多样性差异很小;8个亚种紫貂种群遗传多样性水平比较相近,日本岛屿种群紫貂比大陆种群遗传多样性高。(3)紫貂、欧洲松貂、石貂DRB基因抗原结合位点非同义突变率均大于同义突变率(dN/dS>1),受到正向选择,紫貂非抗原结合位点dN/dS<1,欧洲松貂和石貂所有位点及非抗原结合位点的dN/dS<1,进化过程中正向选择及净化选择共同维持3种貂属动物MHC基因多态性。(4)3种貂属动物之间、4种獾属动物之间、4种鼬属动物之间及鼬科动物之间DRB基因存在跨物种进化现象。(5)以平衡选择维持3种貂属动物MHC-DRB基因多态性。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 1 绪论
  •   1.1 三种貂属动物
  •     1.1.1 紫貂
  •     1.1.2 欧洲松貂和石貂
  •   1.2 主要组织相容性复合体分子概述
  •     1.2.1 MHC结构与功能
  •     1.2.2 MHC分子的遗传特性
  •     1.2.3 MHC多态性及维持机制
  •   1.3 鼬科动物MHC研究现状
  •     1.3.1 鼬科动物DRB等位基因的确定
  •     1.3.2 鼬科动物DRB基因选择压力的分析
  •     1.3.3 种群遗传结构分析
  •     1.3.4 在动物抗病能力方面的应用
  •   1.4 课题的目的及意义
  • 2 材料与方法
  •   2.1 实验材料
  •     2.1.1 实验样本信息
  •     2.1.2 实验主要仪器设备
  •     2.1.3 实验主要试剂
  •   2.2 实验方法
  •     2.2.1 基因组DNA的提取及检测
  •     2.2.2 DRB基因PCR扩增及产物回收
  •     2.2.3 克隆与测序
  •     2.2.4 等位基因命名
  •     2.2.5 数据分析
  • 3 实验结果与分析
  •   3.1 基因组DNA提取
  •   3.2 PCR扩增及克隆
  •     3.2.1 PCR扩增结果检测
  •     3.2.2 产物回收结果
  •     3.2.3 阳性克隆检测
  •   3.3 貂属动物MHC-DRB基因多态性分析
  •     3.3.1 等位基因确定
  •     3.3.2 核苷酸及氨基酸序列特征
  •     3.3.3 不同亚种紫貂MHC-DRB基因遗传多样性
  •     3.3.4 鼬科动物MHC-DRB基因遗传多样性
  •   3.4 选择压力分析
  •   3.5 系统发育分析
  • 4 讨论
  •   4.1 等位基因确定及序列特征
  •   4.2 鼬科动物遗传多样性比较
  •   4.3 选择压力分析
  •   4.4 系统发育分析
  • 结论
  • 参考文献
  • 附录
  • 攻读学位期间发表的学术论文
  • 致谢
  • 附件
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 康慧

    导师: 李波

    关键词: 鼬科动物,主要组织相容性复合体,多态性,平衡选择

    来源: 东北林业大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学,生物学

    单位: 东北林业大学

    分类号: Q953

    DOI: 10.27009/d.cnki.gdblu.2019.000310

    总页数: 68

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