都匀毛尖茶树叶片响应茶小绿叶蝉侵染的转录组分析

都匀毛尖茶树叶片响应茶小绿叶蝉侵染的转录组分析

论文摘要

茶小绿叶蝉是为害茶树叶片主要的病害之一,可造成茶叶显著减产。为了研究都匀毛尖茶对茶小绿叶蝉侵染响应的分子机制,通过Illumina Hiseq平台测序,对茶小绿叶蝉侵染茶树叶片转录组基因的表达情况进行分析。结果表明,从9个样品筛选出的SNP位点数目从490 103~632 564,并对214个基因结构进行了优化,发现了13 588个新基因,其中10 183个新基因被注释。茶小绿叶蝉侵染0 h和12 h两组出现了555个差异基因,其中上调表达369个,下调表达186个。0 h和24 h两组出现了1 575个差异转录基因,677个上调,898个下调。12 h和24 h两组出现了22个差异表达基因,4个上调,18个下调。将差异表达基因进行COG、GO、KEGG、KOG、NR、Pfam、Swiss-Prot和egg NOG注释,并通过GO和KEGG功能分类和富集分析发现,差异基因主要参与植物激素信号转导、应激反应,解毒反应,免疫系统过程。研究结果为揭示茶叶响应茶小绿叶蝉侵害的防御机制、关键基因提供理论依据,对于选育抗性良种并最终实现茶叶增产意义重大。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 转录组数据质控分析
  •   1.2 转录组数据与参考基因组序列比对
  •     1.2.1 比对效率
  •     1.2.2 文库质量评价
  •     1.2.3 SNP/InDel分析
  •     1.2.4 基因结构优化
  •   1.3 新基因发掘
  •     1.3.1 茶树新基因功能注释
  •     1.3.2 基因表达量分析
  •   1.4 差异表达分析
  •     1.4.1 差异基因筛选
  •     1.4.2 差异基因功能注释
  •     1.4.3 差异表达基因KEGG通路富集分析
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 试验材料
  •   3.2 茶小绿叶蝉侵染茶苗
  •   3.3 转录组测序
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王芬,裴会敏,文狄,陈志,吕辉,马媛

    关键词: 茶小绿叶蝉,都匀毛尖茶,转录组,差异基因

    来源: 分子植物育种 2019年22期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 植物保护

    单位: 黔南民族师范学院生物科学与农学院

    基金: 贵州省科技厅基础研究计划项目(黔科合基础[2019]1298),教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字[2018]420),黔南民族师范学院高层次人才引进研究专项项目(qnsyrc201611),黔南民族师范学院科研创新团队(Qnsyk201605)共同资助,贵州省科学技术基金(黔科合J字[2015]2134号)

    分类号: S435.711

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.007357

    页码: 7357-7367

    总页数: 11

    文件大小: 1665K

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