导读:本文包含了肺癌遗传易感性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:microRNA,单核苷酸多态性,肺癌,Meta分析
肺癌遗传易感性论文文献综述
孙颂赞,黄海溶,龙文芳,刘云儒,杨建军[1]（2019）在《microRNA多态与肺癌遗传易感性关联Meta分析》一文中研究指出目的 microRNA(miRNA)涉及包括肿瘤抑制在内的许多生物学过程,大量研究表明miRNA单核苷酸多态与肺癌遗传易感性有关,但各研究结论不一。本研究对2007-01-2017-04年发表的相关文献进行Meta分析,评价miRNA-146ars2910164位点和miRNA-196a2rs11614913位点多态与肺癌遗传易感性的关联。方法检索PubMed、CNKI(中国知网)、cqVIP(维普资讯网)、万方全文数据库和中国生物医学文献数据库中关于miRNA-196a2rs11614913和miRNA-146ars2910164多态与肺癌遗传易感性关联的病例对照研究。按照纳入和排除标准筛选文献,提取数据,采用RevMan5.3软件对入选文献的研究结果进行异质性检验,计算合并比值比(odds ratio,OR)和95%可信区间(confidence interval,CI),绘制漏斗图,估计发表偏倚的影响。同时根据种族和对照来源的不同进行亚组分析。结果本研究纳入9篇符合条件的文献,研究miRNA-196a2rs11614913的病例组合计3 101例,对照组3 234例。研究miRNA-146a rs2910164的病例组合计3 483例,对照组3 578例。合并的研究中发现,miRNA-196a2rs11614913与肺癌风险显着相关,CC vs TT:OR=1.25,95%CI为1.09～1.44,χ~2=10.03,P=0.12;CTvs TT:OR=1.26,95%CI:1.03～1.53,χ~2=13.07,P=0.04。亚组分析结果显示,在亚裔人群中,CC和CT基因型与肺癌易感性升高均有关;医院对照亚组中CT基因型与其易感性升高有关。在miRNA-146ars2910164上,仅发现CC基因型与肺癌风险增加有关,OR=1.30,95%CI为1.13～1.49,χ~2=2.64,P=0.75。亚组分析结果显示,亚裔人群的CC基因型与肺癌易感性升高有关,白种人的CG基因型与肺癌易感性升高有关;无论是社区还是医院对照亚组的CC基因型与肺癌易感性升高均有关。结论 miRNA-196a2rs11614913位点CC或CT基因型,以及miRNA-146ars2910164位点CC基因型可增加人群肺癌的患病风险。(本文来源于《中华肿瘤防治杂志》期刊2019年15期）
梁珍[2]（2019）在《PTEN SNP与非小细胞肺癌的遗传易感性研究》一文中研究指出目的:近年研究表明,第10号染色体缺失的磷酸酶和张力蛋白同源物基因(phosphatase and tension homology deleted on chromosome ten,PTE N)在细胞的增殖、分化及凋亡过程中起重要的调节作用,PTEN具有双特异性磷酸酶活性,通过参与PI3K/AKT途径的信号调控及维持细胞核染色质结构稳定性以发挥其抑癌作用。本课题通过检测PTEN基因rs11202586、rs1234220和rs1903858共叁个位点的单核苷酸多态性(single nucleotide p olymorphism,SNP)及PTEN血清水平,探讨PTEN基因突变及PTEN血清水平与非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)发病风险的关系。方法:本课题研究中,进行了病例-对照研究,采用多重单碱基延伸(S napshot SNP)技术分别检测NSCLC组152例(男103例,女49例)和对照组124例(男84例,女40例)的PTEN基因rs11202586、rs1234220和rs1903858共叁个位点的基因多态性。应用群体遗传学哈-温平衡(Hardy-W einberg equilibrium,HWE)定律检验病例组及对照组所纳入人群是否来自同一孟德尔群体,是否具有群体代表性。采用二元Logistic回归(binary logi stic regression)分析校正年龄、性别及吸烟史等因素,计算比值比(odds ratio,OR)和相应的95%可信区间(confidence intervals,CI);采用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测NSCLC组113例(男77例,女36例)和对照组103例(男65例,女38例)的PTEN血清水平,并比较两组间及NSC LC组男性与女性、鳞癌与腺癌、吸烟者与非吸烟者的PTEN血清水平,分析PTEN基因多态性及血清表达水平与NSCLC的患病风险关系。结果:1.PTEN基因rs11202586位点有TT、CT、CC叁种基因型,以野生型纯合子TT及等位基因T为参照,CT和CC基因型与NSCLC的发病风险无相关性(P>0.05);与T等位基因相比,C等位基因与NSCLC的发病风险无相关性(P>0.05),提示rs11202586位点的基因突变可能与NSCLC的发病风险无相关性。2.PTEN基因rs1234220位点有AA、AG、GG叁种基因型,以野生型纯合子AA及等位基因A为参照,AG和GG基因型与NSCLC的发病风险无相关性(P>0.05);与A等位基因相比,G等位基因与NSCLC的发病风险无相关性(P>0.05),提示rs1234220位点的基因突变可能与NSCLC的发病风险无相关性。3.PTEN基因rs1903858位点有AA、AG和GG叁种基因型,以野生型纯合子AA和等位基因A作为参照,基因型AG及GG与NSCLC的发病风险增加存在相关性,其(OR=2.079,95%CI=1.087-3.974,P=0.027;OR=1.897,95%CI=1.053-3.419,P=0.033);对等位基因进行分析,发现G等位基因可增加NSCLC的发病风险,其OR=1.505,95%CI=1.065-2.126,P=0.020,提示,rs1903858位点的基因突变与NSCLC的发病风险相关。4.对吸烟习惯、病理类型及性别进行分层分析发现,在吸烟者人群中,PTEN rs1903858位点G等位基因增加NCSLC的发病风险,其OR=1.916,95%CI=1.023-3.589,P=0.042;PTEN rs1903858基因型GG及等位基因G与肺鳞状细胞癌的发病风险相关,其OR值(95%CI)分别为:OR=3.226,95%CI=1.075-9.678,P=0.037;OR=1.873,95%CI=1.092-3.212,P=0.023;rs1234220位点G等位基因增加肺腺癌的发病风险,OR=1.730,95%CI=1.054-2.841,P=0.030;在女性人群中,PTEN rs1903858位点G等位基因增加NSCLC的发病风险,其OR=2.026,95%CI=1.107-3.709,P=0.022。5.对PTEN基因rs11202585、rs1234220和rs1903858叁个位点构建的单倍型进行分析发现,TAA单倍型降低NSCLC的发病风险(OR=0.628,95%CI=0.446-0.886,P=0.008),提示TAA单倍型对NSCLC是一个保护因子。6.PTEN血清水平在NSCLC组和对照组分别为55.13±69.98(ng/ml)、42.30±55.56(ng/ml)(中位数±四分位间距),两组数据差异无统计学意义(P>O.O5);NSCLC患者血清PTEN水平与患者性别、病理类型及吸烟史无相关性。结论:1.PTEN rs1903858位点基因多态性与NSCLC的患病风险相关,rs1903858位点基因突变型可增加NSCLC的患病风险,rs1234220位点突变可增加肺腺癌的发病风险。2.PTEN血清水平与NSCLC的发病风险无统计学意义的相关性。(本文来源于《广西医科大学》期刊2019-06-01）
刘建超[3]（2019）在《CD28 rs3116496 T＞C单核苷酸多态性与食管鳞状细胞癌、非小细胞肺癌遗传易感性的研究》一文中研究指出目的:研究CD28 rs3116496 T>C的单核苷酸多态性与食管鳞状细胞癌、非小细胞肺癌遗传易感性的关系。方法:本研究选择以医院为基础的病例-对照研究,分为两部分,第一部分包括829例食管鳞状细胞癌患者的病例组及1522例非肿瘤人群的对照组;第二部分包括1193例非小细胞肺癌患者的病例组及1056例非肿瘤人群的组成的对照组。采集全部纳入人群的静脉血,提取血液样本DNA。采用SNPscan的方法检测全部标本的CD28 rs3116496T>C的基因分型,然后对CD28 rs3116496 T>C基因型在病例和对照组之间分布频率的差异进行统计学分析,并通过Logistics回归分析病例对照之间以及依据年龄、性别、体重指数、吸烟、饮酒等因素分层后的发病风险。以此来评估CD28 rs3116496 T>C单核苷酸多态性在食管鳞状细胞癌、非小细胞肺癌的发生易感性中所起到的作用。结果:统计分析结果表明(1)食管鳞状细胞癌组与其对照组之间年龄、性别比较差异无统计学意义(P=0.328,P=0.331)。非小细胞肺癌组与其对照组之间年龄、性别比较差异均无统计学意义(P=0.960,P=0.425);(2)本研究中全部样本基因分型成功率超过95%,对照组中CD28 rs 3116496 T>C基因型分布均符合哈迪-温伯格平衡;(3)吸烟、饮酒、体重指数在食管鳞状细胞癌患者组与其对照组中有统计学差异,P<0.001。在非小细胞肺癌与其对照组具有统计学差异,P<0.001;(4)CD28 rs3116496 T>C位点基因型与食管鳞状细胞癌、非小细胞肺癌发病风险相关性差异无统计学意义,P值均大于0.05;(5)分层分析结表明:CD28 rs3116496 T>C位点与食管鳞状细胞癌、非小细胞肺癌在根据性别、年龄、吸烟与否、饮酒与否、体重指数不同状态下的分层分析,统计结果表明差异无统计学意义,P值均大于0.05。结论:在食管鳞状细胞癌、非小细胞肺癌的发生发展过程中,CD28 rs3116496 T>C位点基因多态性可能与其不相关。然而这个结论需要在不同种族、不同地区及更多危险因素涉及下再次研究论证。(本文来源于《江苏大学》期刊2019-04-01）
王璁[4]（2018）在《中国人群HOX transcript antisense RNA(HOTAIR)单核苷酸多态性与原发性肺癌遗传易感性的相关性研究》一文中研究指出目的肺癌在中国的发病率和死亡率均呈上升趋势。长链非编码RNA(lncRNA)控制着几乎所有的生物过程,lncRNA HOX转录反义RNA(HOTAIR)通过其相关蛋白来抑制基因表达,增加肺癌细胞的增殖,侵袭,转移及耐药能力,其在肺癌中的高表达与肺癌的转移及不良预后相关。本研究的目的是为了探讨HOTAIR的RS920778(C>T),RS12826786(C>T),RS4759314(A>G),RS1899663(G>T)四个位点的SNP多态性,探究其与原发性肺癌的遗传易感性的关系。方法本研究选取了262名原发性肺癌患者和451名健康对照者作为研究对象,所有研究对象均抽取5ml静脉血。应用高通量Taqman-MGB探针技术对上述四个基因位点RS920778(C>T),RS12826786(C>T),RS4759314(A>G),RS1899663(G>T)进行分型,依据研究对象的年龄,性别,吸烟史和病理类型等不同的临床特征,将原发性肺癌患者分为几个亚组,运用非条件逻辑回归分析HOTAIR单核苷酸多态性位点与原发性肺癌之间的风险相关性.并采用SPSS18.0及SHESIS软件对数据资料进行统计分析,并对各个基因位点进行连锁不平衡及单倍型分析。通过生存分析Kaplan-Meier法对不同基因型原发性肺癌患者的生存率进行了分析。结果本研究发现在四个SNP位点中,RS920778(C>T)和RS1899663(G>T)这两个位点与原发性肺癌的易感性高度相关,在原发性肺癌组中,RS920778(C>T)位点的C/T基因型(C/T+TT)的发生频率高于对照组(OR=1.467,95%CI:1.069-2.014,P<0.05)。RS1899663(G>T)位点的TT基因型发生频率与野生型GG基因型相比原发性肺癌的易感性显着增高(OR=3.220,95%CI:1.272-8.050,P<0.05)。而RS12826786(C>T),RS4759314(A>G)与原发性肺癌的发病率无明显相关。随后进一步的研究指出,在依据研究对象的年龄,性别,吸烟史及病理类型进行分层分析的各个亚组中,RS920778(C>T)位点的C/T基因型(C/T+TT)与男性,吸烟者及病理类型为鳞癌的原发性肺癌患者的易感性显着相关。随后在HOTAIR的单核苷酸多态性与原发性肺癌的遗传易感性的基因连锁不平衡及单倍型因素分析的研究显示,基因连锁不平衡和单元型分析检测HOTAIR基因多态性和肺癌的风险。RS920778(C>T)和RS1899663位点,存在高度连锁不平衡(D'=0.86,r2=0.52),单倍型为TRS920778)T(RS1899663)A(RS4759314)的群体肺癌发病危险显着增高(OR:2.223,95%CI:1.517~3.258,P<0.001)。结论本研究的研究结果显示,在中国人群中HOTAIR基因RS920778(C>T)和RS1899663(G>T)单核苷酸多态性与原发性肺癌的遗传易感性有关,可能会增加患原发性肺癌的风险。携带RS920778(C>T)C/T基因型(C/T+TT)易感风险的增加与性别,吸烟史及病理分型有关,本研究表明HOTAIR单核苷酸多态性在肺癌的易感性中起重要作用,未来对于其机制的深入研究十分必要。(本文来源于《天津医科大学》期刊2018-05-01）
段敏丹,陈雪,王悦,苏雷,史茜[5]（2017）在《微小RNA多态性和非小细胞肺癌遗传易感性关系研究》一文中研究指出目的:研究微小RNA多态性和非小细胞肺癌遗传易感性的关系。方法:选取非小细胞肺癌患者130例(A组)与常规体检者150例(B组),对两组hsa-mir-146ars2910164和hsa-mir-499Rs3746444基因的多态性进行研究分析,利用非条件Logistic回归模型计算OR及95%CI等。结果:A组G、A基因比例分别为73.08%和26.92%,B组分别为77.33%和22.67%;A组GG、AG、AA基因型频率分别为52.31%、40.77%、6.92%,B组分别为58.67%、36.67%、4.66%;两组基因型与等位基因分布分别比较均无统计学差异(P=0.4892,P=0.2437);调节性别、年龄、吸烟、饮酒等进行回归分析,在hsa-mir-146ars2910164中,基因型CC与基因型GG+CG相比患非小细胞肺癌的危险性较高(OR=1.39,95%CI:1.06~1.80,P=0.0126);在hsa-mir-499Rs3746444中,两组基因型频率分布比较无统计学差异(P>0.05);校正各种因素后,带有CC基因型男性患非小细胞肺癌危险性较高(OR=1.61,95%CI:1.24~2.03,P=0.0369),吸烟患非小细胞肺癌危险性较高(OR=2.01,95%CI:1.76~2.35,P=0.0419),饮酒患非小细胞肺癌危险性较高(OR=1.22,95%CI:0.55~3.25,P=0.0364)。结论:微小RNA rs2910164中基因型CC有可能增加非小细胞肺癌的遗传易感性,且其发病风险与吸烟、饮酒等因素存在一定相关性。(本文来源于《陕西医学杂志》期刊2017年07期）
刘爱胜,郭龙华,文艳,刘小君,林丽云[6]（2017）在《GSTM1和CYP2E1基因多态性与非小细胞肺癌遗传易感性的相关性研究》一文中研究指出目的探讨细胞色素p4502E1基因(CYP2EI)和谷胱甘肽转硫酶MI(GSTM1)基因多态性与深圳地区非小细胞肺癌遗传易感性的相关性。方法收集2014年2月~2016年10月在深圳各医院就诊并确诊为非小细胞肺癌患者和同期住院的肺良性疾病患者各71例,采用PCR-RFLP和PCR法分别检测CYP2E1基因的RsaⅠ/PstⅠ和GSTM1基因多态性,并分析基因多态性与非小细胞肺癌遗传易感性之间的相关性。结果非小细胞肺癌组和肺良性疾病组患者CYP2E1基因Rsa I/Pst I多态性的叁种基因型检出频率差异无统计学意义(χ~2=0.891~1.205,P>0.05);非小细胞肺癌组GSTM1(–)基因型频率为61.79%,显着高于肺良性疾病组的36.62%,两者频率的差异有统计学意义(χ~2=5.019,P<0.05);携带GSTM1(–)基因型的个体患非小细胞肺癌的危险性显着高于GSTM1(+)基因型的个体(OR=2.095,95%CI=1.104~3.173,P=0.032);与携带cl/c2或c2/c2基因型的不吸烟个体比较,携带cl/cl基因型的吸烟者患非小细胞肺癌的风险显着增加(OR=3.415,95%CI=1.092~11.214,P=0.028);携带cl/cl和GSTM1(–)基因型的个体患非小细胞肺癌的风险显着高于携带GSTM1(+)和cl/c2或c2/c2基因型的个体(OR=3.518,95%CI=1.106~l2.812,P=0.045)。在不吸烟人群中,携带GSTM1(–)和cl/cl基因型的人群患非小细胞肺癌的风险显着高于携带GSTM1(+)和cl/c2或c2/c2基因型的人群(OR=2.917,95%CI=1.004~8.316,P=0.043),且携带有GSTM1(–)和cl/c2或c2/c2基因型的人群患非小细胞肺癌的风险同样高于携带GSTM1(+)和cl/c2或c2/c2基因型的人群(OR=14.062,95%CI=1.362~147.256,P=0.029)。结论 GSTM1(–)基因型是深圳地区人群患非小细胞性肺癌的风险因素之一;同时携带CYP2E1的cl/cl和GSTM1(–)基因型可增加吸烟和不吸烟人群患非小细胞肺癌的风险。(本文来源于《临床输血与检验》期刊2017年03期）
朱猛[7]（2017）在《低频遗传变异与肺癌遗传易感性及预后关联研究》一文中研究指出肺癌是全球最常见的恶性肿瘤之一。目前其发病率和死亡率均位居全球范围内恶性肿瘤的首位。近年来,肺癌持续占据我国男性新发恶性肿瘤的首位,女性新发恶性肿瘤的第二位;而且由于肺癌预后差,在我国全肿瘤死因中,肺癌始终占据首位。过去数十年中,持续增长的烟草消费和不断加重的环境污染,导致我国多数地区的肺癌发病率和死亡率仍呈现不断上升趋势,肺癌是严重危害我国居民健康和生命的重要公共卫生问题之一。流行病学研究表明,肺癌的发生是环境因素和遗传因素共同作用的结果。尽管80%以上的男性肺癌和至少50%的女性肺癌可归咎于烟草暴露,但在相同的烟草暴露下,仅不到20%的吸烟者最终发展为肺癌,提示遗传因素在肺癌发生中起重要作用。临床分期和组织病理类型是判断患者预后的主要临床指标,但临床分期和组织病理类型相同的个体接受同样的治疗方案,治疗效果往往差异很大,提示不同的肺癌患者对治疗敏感性的情况不同,个体的遗传背景可能会影响患者的临床预后。因此,筛选有效的遗传标志物用于肺癌高危人群的鉴定,指导肺癌个体化预防,预测肺癌患者预后,指导肺癌的个体化治疗,是目前国内外研究的热点。近年来,随着人类对基因组认识的不断深入,以及高通量技术平台的建立和完善,全基因组关联研究(Genome-wide association studies,GWAS)已经成为探索复杂疾病遗传易感性和筛选预后遗传标志物的有力工具。该策略能快速筛查全基因组范围内的常见遗传标志,通过大样本量的初筛和后期多个独立研究的验证,研究结果往往具有较高的重现性和可靠性。本课题组前期开展了首个中国汉族人群肺癌GWAS研究,研究结果不仅验证了前期报道的肺癌易感区域(3q28和5P15.33区域等),还发现了一批新的中国汉族人群肺癌易感区域(5q32、10p14、13q12.12、20q13.2 和 22q12.2 区域)。在肺癌预后的 GWAS 研究中,我们发现 3p22.1、4q26、5p14.1、7q31.31、9p21.3 和 14q24.3 区域的遗传变异可能与肺癌患者的生存时间显着相关。肺癌易感性及预后的GWAS研究,较系统地揭示了常见遗传变异与肺癌易感性及预后的关系,为肺癌的病因学研究、预后疗效评估和治疗靶标筛选提供了非常有价值的线索。然而,既往的GWAS研究策略是基于"常见疾病/常见变异"的遗传假说,因此早期GWAS芯片通常利用单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)的连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)原理,通过标签SNP代表整个基因组的常见遗传变异(较小等位基因频率,MAF≥5%),难以对低频遗传变异进行系统研究。常见变异频率较高但外显性较低,目前发现的常见遗传变异仅能解释部分的遗传性状,至今尚存在大量的"遗传性丢失"。近年来,研究者提出了"常见疾病/低频变异"的假说,认为低频变异(MAF<5%)往往具有较高的外显性,对常见疾病或性状的贡献同样重要,可能解释部分的"遗传性丢失"。高通量测序是低频遗传变异关联研究最理想的策略,但高昂的价格限制了该方案的广泛应用。为了提供系统探索低频遗传变异关联研究的可行技术平台,Illumina公司基于12031个个体的全基因组测序和外显子测序数据,系统筛选了不同人种(包括亚洲人、欧洲人、非裔美国人和西班牙人),不同疾病(如2型糖尿病、癌症、代谢及精神疾病等)相关基因的约240000个遗传变异,推出了一款高通量芯片-Infinium(?)HumanExome Beadchip。该芯片的93.1%位点位于外显子区,其余位点位于启动子区、终止密码子区、剪接区等,其中89.5%的位点为低频遗传变异。因此,为了探索低频单核苷酸遗传变异(Single Nucleotide Variant,SNV)在肺癌发生发展中的作用,本研究采用"外显子组芯片(Infinium(?)HumanExome Beadchip)"的分型技术,基于大样本多阶段的病例-对照研究设计,研究低频遗传变异与中国人群肺癌发生风险的关联;在此基础上,我们进一步整合肺癌患者临床和预后信息,探讨低频遗传变异对肺癌患者预后的影响。本研究结果对于进一步发现中国人群的肺癌遗传标志物,提高肺癌风险预测效能,深入理解肺癌的预后差异机制,促进个体化治疗具有重要的理论和现实意义。第一部分低频遗传变异与肺癌遗传易感性关联研究肺癌GWAS研究发现的超过30个肺癌易感位点(区域),仅能解释不到1%的肺癌遗传度,目前尚存在大量未知的遗传缺失有待进一步挖掘。传统GWAS研究通常只关注常见遗传变异,而忽略了低频遗传变异的贡献。而近期,Wang等人整合前期欧美人群的多项肺癌GWAS研究,按照统一的质控和填补流程进行了全基因组整合分析,最终发现了 2个低频错义位点BRCA2(p.Lys3326X,MAF=0.009,OR=2.47,P= 4.74 × 10-20)和CHEK2(p.Ile157Thr,MAF=0.007,OR=0.38,P=1.27×10-13)与肺鳞癌易感性显着相关,且效应远大于既往发现的常见遗传变异,该研究证明了外显子区低频遗传变异在肺癌易感性中的重要作用。然而,目前尚无低频遗传变异与中国汉族人群肺癌遗传易感性研究的报道,因此我们开展了首个中国人群肺癌全外显子组关联研究。本研究采用大样本多阶段的病例-对照研究设计,在初筛阶段采用Illumina HumanExome Beadchip芯片对1348例肺癌病例和1988例健康对照进行基因分型。然后我们进行了系统的质量控制,剔除质量不合格的样本(包括分型成功率低、存在亲缘关系、存在明显人群分层以及与前期GWAS芯片分型不一致)和位点(包括线粒体和性染色体位点、重复位点、分型成功率不合格位点、偏离Hardy-Weinberg位点以及频率为0的位点),最终1341例肺癌病例和1982例健康对照的72423个位点纳入后续关联分析。针对关联分析结果,我们筛选P<1×10-3且分型可靠的低频错义或剪切位点,在4699例肺癌病例和4915例健康对照中进行了两阶段验证。对验证一致的遗传变异,我们采用单纯病例研究设计,评价了这些遗传变异对于肺癌发病年龄的影响。基于低频错义和剪切位点,我们开展了基因水平的关联分析。最后,基于The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库,我们进一步评价了易感基因在肺癌发生中的潜在作用。研究结果显示,位于BAT2,FKBPL和BPIFB1上的3个低频错义遗传变异与肺癌发生风险显着相关:rs9469031(6p21.33,BAT2 c.1544C>T[p.Pro515Leu];OR=0.55,P=1.28×10-10);rs200847762(6p21.33,FKBPL c.410C>T[p.Pro137Leu];OR=0.25,P=9.79× 1012)和 rs6141383(20q1 1.21,BPIFB1c.850G>A[p.Val284Met];OR=1.72,P=1.79×10-7)。在单纯病例分析中,我们发现 rs9469031-C(P=0.001)和rs6141383-A(P=0.006)与肺癌的早发显着相关。基因水平关联分析提示FKBPL可能是6p21.33区域肺癌易感性的关键基因(SKAT-O检验:P=1.29×10-9;Burden检验:P=2.00×10-10)。基于TCGA基因表达数据库,我们发现BAT2,FKBPL和BPIFB1在肺癌与癌旁组织中均显着差异表达。上述结果表明,6p21.33和20q11.21区域的低频遗传变异可能与中国汉族人群肺癌的易感性相关,低频遗传变异在肺癌发生中可能发挥重要作用。我们的研究进一步完善了中国人群的遗传易感图谱,研究结果对深入理解肺癌的发生机制、指导高危人群筛查和个体化预防有重要的理论意义和潜在应用价值。第二部分低频遗传变异与肺癌预后关联研究基于GWAS的研究策略,前期多项研究系统探讨了常见遗传变异与中国汉族人群肺癌预后的关联,发现了一批影响中国汉族人群肺癌预后的关键区域,包括染色体 2p23、2q22、2q34、3p22、5p14、6p21、7q31、9p21、9p22、11q22、12q23、13q33、14q24、15q21、16q21、19p13 和 21q22 等。然而前期研究主要关注常见遗传变异,低频遗传变异与肺癌预后关联尚不清楚。因此,我们基于课题组前期积累,进一步整合肺癌患者的临床和预后信息,开展了肺癌预后的全外显子组关联研究。本研究采用单纯病例研究设计。在前述应用Illumina HumanExome Beadchip芯片芯片完成检测的1348例肺癌患者中,1008例具有完整临床资料和预后随访信息的肺癌样本纳入本研究。经过系统的质量控制后,共1001例肺癌病例的57903个位点纳入后续关联分析,关联分析使用Cox回归模型。对于初筛阶段满足P<1×10-3且分型可靠的低频错义或剪切位点,我们进一步在773例同时具有临床随访、基因型及表达信息的TCGA肺癌样本中进行了验证。首先,我们使用SHAPE和IMPUTE2软件进行了全基因组填补,由于填补后的TCGA数据仅能得到部分低频位点的基因型信息,而低频错义或剪切位点往往只影响本体基因的功能,因此我们同时使用基因的表达水平与肺癌预后的关联作为我们研究结果的进一步佐证。对TCGA填补后的基因型和表达数据,我们使用Cox模型计算了其与肺癌预后的关联。对于TCGA基因型或表达验证一致的位点,均作为本研究的显着关联位点。基于低频错义和剪切位点,我们使用R包'coxKM'进行了基因水平的关联分析,并根据计算得到的P值使用R包'ARTP'开展了通路分析。研究发现,2p23.2区域的低频错义位点rs117512489(PLB1[p.Arg1131Gln])与肺癌预后显着相关(HR=2.02,P=7.28×10-4),且TCGA数据库中其表达水平与肺癌预后相关(HR=1.15,P=0.023)。此外,我们还发现7p11.2区域的低频错义位点 rs33922584(CCT6Ap.Tyr229Cys])与肺癌预后显着相关(HR=1.75,P=6.06×10-4),在TCGA数据库中,其基因型(HR=4.19,P=0.015)和表达水平(HR=1.15,P=0.047)均与肺癌预后相关。进一步分析发现,rs33922584可能损害CCT6A蛋白的结构和磷酸化,且在TCGA的肺癌样本中rs33922584与CCT6A的表达水平显着相关(p=0.019)。差异表达分析发现,CCT6A在肺癌的癌组织中显着高表达(P=3.75×10-28)。在基因水平的关联分析中,我们发现了包括CCT64在内的32个肺癌预后相关基因,通路分析提示包括CTNNB1相关通路,细胞周期G2-M通路在内的多条通路可能与肺癌的预后相关。经过两阶段研究,我们最终发现2p23.2和7p11.2区域的两个低频错义位点与肺癌预后显着相关,且其基因型或(和)表达水平在TCGA数据库中关联一致。同时,研究还提示了一批新的可能影响肺癌患者预后的关键基因和通路。本研究结果对深入理解肺癌的预后机制,促进肺癌个体化治疗,新靶标的研发具有重要的指导意义和潜在应用价值。(本文来源于《南京医科大学》期刊2017-06-01）
汪君君[8]（2017）在《候选基因及miRNA基因多态性与肺癌遗传易感性的关联研究》一文中研究指出背景肺癌是最常见的恶性肿瘤。除了吸烟等环境因素的影响外,遗传因素也在肺癌的发生中起到很重要的作用,个体遗传易感性的差异与肺癌发生风险显着相关。在过去的20多年里,候选基因关联研究(candidate-gene association studies)是肺癌遗传易感性研究的主要方法之一,已经有1000多篇文献基于候选基因策略研究遗传多态性与肺癌易感性的关联。尽管这些候选基因关联研究发现了许多与肺癌发病风险相关的遗传变异位点,但是许多研究之间报道的结果并不一致,很难明确所发现的位点是否与肺癌发生风险之间存在真实的病因关联。目前缺乏对这些大量的研究证据的整合系统评价、meta分析和总体流行病学证据可靠性的分级评估。此外,目前报道的这些肺癌遗传关联研究,主要关注的是位于DNA剪切修复基因、代谢酶基因、免疫通路相关基因、细胞凋亡通路基因等蛋白编码基因上的遗传变异位点与肺癌易感性的关系,很少关注位于非蛋白编码基因上的遗传变异位点。然而,人类基因组中存在大量的非编码RNAs(non-coding RNAs,nc RNAs)。且许多nc RNAs在肺癌及其他多种肿瘤发生发展中的重要作用已逐渐被证实,尤其是miRNAs在肿瘤中的功能作用。近年来,研究发现位于miRNA基因上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点也与某些肿瘤的发生风险相关联。然而目前有关miRNA基因上的SNPs与肺癌易感性的关联研究还很少,有待进一步发掘更多新的肺癌易感性相关的miRNA SNPs位点,为肺癌病因学研究提供更多新的线索。目的1.采用整合系统评价、meta分析以及流行病学证据质量分级的方法对目前发表的所有与肺癌发生风险相关的候选基因关联研究进行分析,全面识别、验证和解释以往报道的遗传变异位点与肺癌发生风险之间的关联。2.通过生物信息学分析,筛选位于miRNA基因序列上的潜在功能性SNPs,并基于病例-对照研究的关联分析,探讨miRNA基因上的SNPs位点与肺癌发生风险的关联,进而发掘新的与肺癌易感性相关的位于miRNA基因上的SNPs位点方法1.对截止2015年11月1日发表的全部关于肺癌易感性的候选基因关联研究,进行系统性地文献检索和文献评估。对至少被叁个独立研究报道的遗传变异位点,采用meta分析的方法评估其与肺癌易感性之间的关联。此外我们还根据种族、病理分型以及吸烟状态进行亚组分析。根据meta分析的结果,采用威尼斯标准评估具有统计学意义的关联位点的流行病学证据可靠性。进一步采用生物信息学分析,对与肺癌易感性之间存在显着性关联且关联具有强流行病学证据可靠性的位点进行功能注释。对于meta分析发现的与肺癌发生风险之间不具有统计学意义的关联位点,也对其证据质量进行评估,评估方法基于纳入研究之间的异质性、潜在偏倚以及meta分析结果的统计学效能叁个方面。2.通过生物信息学分析,筛选了13个具有潜在生物学功能的位于不同miRNA上的SNPs位点。在626例肺癌患者和年龄、性别与病例相匹配的736例正常对照中,采用SNPscanTM分型技术对筛选的13个SNPs位点进行基因分型。多因素Logistic回归分析不同基因型与肺癌易感性之间的关联;并基于肺癌的病理学类型和个体的吸烟状态进行分层分析,在不同的亚组中评估各SNP位点与肺癌发生风险之间的关联。结果第一部分:1.经过系统性的文献检索和文献筛选,最终我们纳入了1018篇符合标准的文献,这些文献总共报道了位于754个不同基因或染色体位点上的2910个遗传变异位点。2.采用meta分析的方法评估其中的246个遗传变异位点(位于138个不同的基因)与肺癌易感性之间的关联。基于meta分析结果和威尼斯标准评估发现,22个位点(位于21个不同的基因)与肺癌发生风险显着相关,且关联具有强的流行病学证据可靠性,这22个遗传变异位点分别是APEX1 rs1130409、APEX1 rs1760944、ATM rs664677、AXIN2 rs2240308、CHRNA3 rs6495309、CHRNA5 rs16969968、CLPTM1L rs402710、CXCR2 rs1126579、CYP1A1 rs4646903、CYP2E1 rs6413432、ERCC1 rs11615、ERCC2rs13181、FGFR4 rs351855、HYKK rs931794、MIR146A rs2910164、MIR196A2 rs11614913、OGG1 rs1052133、PON1 rs662、REV3L rs462779、SOD2 rs4880、TERT rs2736098和TP53rs1042522位点。3.生物信息学分析表明,在这22个遗传变异位点中,大部分位点可以通过改变蛋白质编码序列或者影响DNA调控元件,来影响其所在基因的表达和/或功能。4.Meta分析发现150个遗传变异位点(来自98个不同的基因)与肺癌发生风险之间的关联无统计学意义,证据质量评估发现其中7个位点(ERCC1 rs16979802、ERCC1rs2298881、ERCC1 rs735482、POLI rs3730668、PPARG rs1801282、PTGS2 rs20417和TNF rs1799724)的meta分析结果的流行病学证据质量高,具有较高的可靠性。第二部分:1.通过生物信息学分析筛选了13个位于不同miRNAs基因上的潜在功能性的SNPs位点(rs11597888 G/A、rs12803915 G/A、rs16867808 T/C、rs2292879 A/G、rs45530340 C/T、rs5997893 G/A、rs61747536 C/T、rs62085660 C/G、rs6464546 G/A、rs6717413 A/G、rs7247237 C/T、rs745666 G/C和rs999665 G/A),进一步关联分析发现这些SNPs位点总体上与肺癌发生风险之间的关联不具有统计学意义(P值均大于0.05)。2.基于肺癌病理类型的亚组分析发现,rs11597888(G>A)位点的杂合子GA基因型可以显着增加肺腺癌的发生风险(共显性模型:校正OR=1.34,95%CI=1.00-1.79,P=0.046);rs62085660(C>G)位点的变异型等位基因G和变异基因型(CG+GG)都可以显着降低肺鳞癌的发生风险(加性模型:校正OR=0.79,95%CI=0.62-1.00,P=0.049;显性模型:校正OR=0.72,95%CI=0.53-0.98,P=0.035)。3.基于吸烟状态的亚组分析发现,rs11597888(G>A)位点的变异基因型(GA+AA)可以显着增加吸烟人群发生肺癌的风险(共显性模型:校正OR=1.44,95%CI=1.02-2.02,P=0.037;显性模型:校正OR=1.42,95%CI=1.03-1.96,P=0.033);rs16867808(T>C)位点在多种假设遗传模型下与吸烟人群发生肺癌的风险显着相关(加性模型:校正OR=0.58,95%CI=0.40-0.84,P=0.004;共显性模型:校正OR=0.55,95%CI=0.35-0.85,P=0.007;显性模型:校正OR=0.53,95%CI=0.35-0.81,P=0.004)。4.Haplo Reg数据库功能注释表明,亚组分析中识别的与肺癌易感性显着相关的3个位点(rs11597888 G/A、rs62085660 C/G和rs16867808 T/C)都位于肺癌组织及其他多种组织细胞中的DNA调控元件区域(启动子区域和/或增强子区域)、Dnase I高敏感区、相关转录因子结合位点以及可以改变相关模体(motif),其中rs62085660 C/G和rs16867808 T/C位点还是多种基因的的表达数量性状位点(expression quantitative trait locus,e QTLs)。结论1.基于整合系统评价、meta分析、流行病学证据质量分级的方法发现,目前在所有报道的肺癌遗传易感性候选基因关联研究中,约有9%(22/246)遗传变异位点与肺癌的易感性显着相关,且流行病学证据评估具有较强可靠性。相关研究以及生物信息学分析表明,在这些位点中,大部分位点可以通过改变蛋白质编码序列或者影响调控元件,来影响其所在的基因的表达和/或功能。2.基于病例-对照研究设计的关联分析发现,rs11597888 G/A(miRNA AL391839.1)、rs62085660 C/G(miRNA AC145343.1)以及rs16867808 T/C(miRNA AL021918.2)位点分别与肺癌的发生风险存在显着性关联,但是这3个SNPs位点与肺癌易感性的关联效应只能在特定的亚组人群中观察到,具体包括:rs11597888(G>A)位点与肺腺癌发生风险以及吸烟人群中肺癌发生风险显着相关;rs62085660(C>G)位点与肺鳞癌发生风险显着相关;rs16867808(T>C)位点与吸烟人群中肺癌发生风险显着相关。本研究结果为肺癌遗传风险效应相关的研究提供了最新且全面的证据,同时发现了与肺癌易感性相关的新的miRNA SNPs位点,将为后续肺癌风险相关的研究提供有力的线索,为肺癌的个体化防治提供理论依据。(本文来源于《第叁军医大学》期刊2017-05-01）
刘志强,蔡琳[9]（2016）在《miRNA相关SNPs与肺癌遗传易感性关系的研究进展》一文中研究指出肺癌是世界最常见的癌症,已成为癌症死亡的主要原因。microRNAs(miRNAs)是一类高度保守、内源性非蛋白编码、长度约21~24核苷酸的小分子单链RNA,在基因调控中扮演着重要的角色。miRNA相关单核苷酸多态性(miRNA-related single nucleotide polymorphisms或miR-SNPs)主要包括miRNA基因SNPs、生物合成通路相关基因SNPs和miRNA靶基因中的SNPs,可通过影响miRNA的成熟过程、表达水平及与靶mRNA的识别结合等,使miRNA调控网络发生异常,从而参与肿瘤的发生发展。本文对miRNA相关SNPs与肺癌遗传易感性关系的研究进展进行综述,旨在为肺癌等恶性肿瘤的预防和控制提供参考。(本文来源于《肿瘤防治研究》期刊2016年12期）
毕雪冰,贾友超,刘微微,刘丽红,臧爱民[10]（2016）在《维生素D受体基因多态性和非小细胞肺癌遗传易感性的临床关系》一文中研究指出目的探讨维生素D受体基因多态性和非小细胞肺癌遗传易感性的临床关系。方法选取河北大学附属医院于2013年1月至2015年7月收治的同时符合纳入和排除标准的新发非小细胞肺癌患者50例作为研究组,另选取同期行正常体检的同年龄段健康志愿者50名作为对照组。比较两组维生素D受体基因多态性分布及构成比情况,探究其和非小细胞肺癌遗传易感性的临床关系。结果单因素分析发现,吸烟史≥3年、致癌化学物质接触史、维生素D受体Bsm1位点B基因型、维生素D受体Fok1位点F基因型、维生素D受体Apa1位点A基因型等均是影响非小细胞肺癌遗传易感性的危险因素(P<0.05),而性别和年龄两组差异均无统计学意义(P>0.05);多因素分析表明,影响非小细胞肺癌遗传易感性多因素按照危险程度由高到低排列为:维生素D受体Fok1位点F基因型(OR=2.298)、致癌化学物质接触史(OR=1.974)、吸烟史≥3年(OR=1.786),而维生素D受体Bsm1位点B基因型和维生素D受体Apa1位点A基因型均为非小细胞肺癌遗传易感性的保护因素(β<0,P<0.05)。结论维生素D受体Bsm1位点B基因型、Fok1位点F基因型和Apa1位点A基因型均和非小细胞肺癌遗传易感性存在一定临床关系,其中Fok1位点F基因型是其独立危险因素,而Bsm1位点B基因型和Apa1位点A基因型均是其保护因素。(本文来源于《热带医学杂志》期刊2016年07期）
肺癌遗传易感性论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:近年研究表明,第10号染色体缺失的磷酸酶和张力蛋白同源物基因(phosphatase and tension homology deleted on chromosome ten,PTE N)在细胞的增殖、分化及凋亡过程中起重要的调节作用,PTEN具有双特异性磷酸酶活性,通过参与PI3K/AKT途径的信号调控及维持细胞核染色质结构稳定性以发挥其抑癌作用。本课题通过检测PTEN基因rs11202586、rs1234220和rs1903858共叁个位点的单核苷酸多态性(single nucleotide p olymorphism,SNP)及PTEN血清水平,探讨PTEN基因突变及PTEN血清水平与非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)发病风险的关系。方法:本课题研究中,进行了病例-对照研究,采用多重单碱基延伸(S napshot SNP)技术分别检测NSCLC组152例(男103例,女49例)和对照组124例(男84例,女40例)的PTEN基因rs11202586、rs1234220和rs1903858共叁个位点的基因多态性。应用群体遗传学哈-温平衡(Hardy-W einberg equilibrium,HWE)定律检验病例组及对照组所纳入人群是否来自同一孟德尔群体,是否具有群体代表性。采用二元Logistic回归(binary logi stic regression)分析校正年龄、性别及吸烟史等因素,计算比值比(odds ratio,OR)和相应的95%可信区间(confidence intervals,CI);采用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测NSCLC组113例(男77例,女36例)和对照组103例(男65例,女38例)的PTEN血清水平,并比较两组间及NSC LC组男性与女性、鳞癌与腺癌、吸烟者与非吸烟者的PTEN血清水平,分析PTEN基因多态性及血清表达水平与NSCLC的患病风险关系。结果:1.PTEN基因rs11202586位点有TT、CT、CC叁种基因型,以野生型纯合子TT及等位基因T为参照,CT和CC基因型与NSCLC的发病风险无相关性(P>0.05);与T等位基因相比,C等位基因与NSCLC的发病风险无相关性(P>0.05),提示rs11202586位点的基因突变可能与NSCLC的发病风险无相关性。2.PTEN基因rs1234220位点有AA、AG、GG叁种基因型,以野生型纯合子AA及等位基因A为参照,AG和GG基因型与NSCLC的发病风险无相关性(P>0.05);与A等位基因相比,G等位基因与NSCLC的发病风险无相关性(P>0.05),提示rs1234220位点的基因突变可能与NSCLC的发病风险无相关性。3.PTEN基因rs1903858位点有AA、AG和GG叁种基因型,以野生型纯合子AA和等位基因A作为参照,基因型AG及GG与NSCLC的发病风险增加存在相关性,其(OR=2.079,95%CI=1.087-3.974,P=0.027;OR=1.897,95%CI=1.053-3.419,P=0.033);对等位基因进行分析,发现G等位基因可增加NSCLC的发病风险,其OR=1.505,95%CI=1.065-2.126,P=0.020,提示,rs1903858位点的基因突变与NSCLC的发病风险相关。4.对吸烟习惯、病理类型及性别进行分层分析发现,在吸烟者人群中,PTEN rs1903858位点G等位基因增加NCSLC的发病风险,其OR=1.916,95%CI=1.023-3.589,P=0.042;PTEN rs1903858基因型GG及等位基因G与肺鳞状细胞癌的发病风险相关,其OR值(95%CI)分别为:OR=3.226,95%CI=1.075-9.678,P=0.037;OR=1.873,95%CI=1.092-3.212,P=0.023;rs1234220位点G等位基因增加肺腺癌的发病风险,OR=1.730,95%CI=1.054-2.841,P=0.030;在女性人群中,PTEN rs1903858位点G等位基因增加NSCLC的发病风险,其OR=2.026,95%CI=1.107-3.709,P=0.022。5.对PTEN基因rs11202585、rs1234220和rs1903858叁个位点构建的单倍型进行分析发现,TAA单倍型降低NSCLC的发病风险(OR=0.628,95%CI=0.446-0.886,P=0.008),提示TAA单倍型对NSCLC是一个保护因子。6.PTEN血清水平在NSCLC组和对照组分别为55.13±69.98(ng/ml)、42.30±55.56(ng/ml)(中位数±四分位间距),两组数据差异无统计学意义(P>O.O5);NSCLC患者血清PTEN水平与患者性别、病理类型及吸烟史无相关性。结论:1.PTEN rs1903858位点基因多态性与NSCLC的患病风险相关,rs1903858位点基因突变型可增加NSCLC的患病风险,rs1234220位点突变可增加肺腺癌的发病风险。2.PTEN血清水平与NSCLC的发病风险无统计学意义的相关性。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
肺癌遗传易感性论文参考文献
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