血浆游离DNA全基因组甲基化测序的实用稳定性评估

论文摘要

随着液体活检技术的发展,血浆游离DNA成为当前的研究热点之一。血浆游离DNA的全基因组甲基化测序被认为在癌症检测等医学应用拥有巨大潜力,但目前尚缺乏针对该实验流程的实用稳定性评估。文中利用两名志愿者在不同时间采样的血浆游离DNA,在不同实验平台分别进行DNA甲基化的重亚硫酸盐转化前建库（Pre-BS）、转化后建库（Post-BS）和常规DNA建库,获取多因素影响下的测序数据样本。在此基础上,建立了一套血浆游离DNA测序数据分析的质量控制参考流程,综合评估了血液采集提取、游离DNA建库测序过程的实用稳定性,为血浆游离DNA全基因组甲基化测序应用于临床液体活检提供实用性的基础参考。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 方欢,钟碧溪,魏磊,张祥林,张威,汪小我

关键词: 血浆游离,全基因组,甲基化,片段化模式,微量建库

来源: 生物工程学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 临床医学

单位: 清华大学自动化系合成与系统生物学研究中心生物信息学教育部重点实验室北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学研究部

基金: 国家自然科学基金(No.61721003)资助~~

分类号: R440

DOI: 10.13345/j.cjb.190281

页码: 2284-2294

总页数: 11

文件大小: 858K

下载量: 143

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