2株H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因组序列分析

2株H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因组序列分析

论文摘要

目的了解2株H9N2亚型禽流感病毒(AIV)毒株A/环境/宁夏/27740/2018(简称NX40)和A/环境/宁夏/27748/2018(简称NX48)血凝素(HA)基因变异情况。方法对全区禽流感监测点采集的环境标本采用Real time RT-PCR方法进行核酸检测,对核酸检测阳性标本进行病毒分离。对H9N2亚型分离株提取RNA,通过RT-PCR反应扩增HA基因片段并测序,测定的序列利用生物信息软件进行分析。结果 2株毒株的HA基因含有8个潜在的糖基化位点,226位的氨基酸残基均为Gln,裂解位点为RSSRGLF,受体结合位点为YWTNTLY,HA基因核苷酸同源性为88.2%~96.6%。结论 2株分离株对人的感染力没有增强,为典型的低致病力禽流感病毒;与参考株比较发生了一定程度的变异,2株毒株亲缘关系较近,与近年国内其他地区分离株同源性较高。

论文目录

  • 1 资料与方法
  •   1.1 一般资料:
  •   1.2 核酸检测和病毒分离:
  •   1.3 NX40和NX48毒株RNA的提取及反转录:
  •   1.4 基因序列的测定:
  •   1.5 流感病毒分离株的核苷酸、氨基酸序列分析及进化分析:
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 孙晓强,温秋芳,刘翠霞,马学旻

    关键词: 禽流感病毒,基因组,序列分析

    来源: 宁夏医学杂志 2019年07期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 宁夏疾病预防控制中心病毒科,宁夏银川市第二人民医院

    分类号: R373.13

    DOI: 10.13621/j.1001-5949.2019.07.0581

    页码: 581-583+576

    总页数: 4

    文件大小: 1971K

    下载量: 114

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