EBV基因组测序的研究进展

EBV基因组测序的研究进展

论文摘要

EB病毒在全世界范围内广泛分布,科学家们发现EB病毒与人类单核细胞增多症及多种恶性肿瘤相关。EB病毒的地理分布和EB病毒相关疾病的地方病发病率特点促使人们研究是否有不同的EB病毒株参与疾病的发展。第一代测序技术的低效率和高成本限制了全基因组EBV的测序,随着第二代测序技术(NGS)的发展,越来越多的EB病毒基因组序列发表。这将有助于更好地理解EBV在不同地理区域的遗传变异,并在特定疾病中发现可能的致病变异。本文概述了已发表的EBV基因组的概况及用于生成这些序列的测序技术和生物信息学分析,探讨EBV全基因组未来的研究方向。

论文目录

  • 1 EBV基因组的Sanger测序
  • 2 EBV基因组的第二代测序 (NGS)
  •   2.1 未富集EBV DNA的NGS
  •   2.2 富集EBV DNA的NGS
  •     2.2.1 诱导病毒裂解富集EBV DNA
  •     2.2.2 PCR富集EBV DNA
  •     2.2.3 EBV克隆到f因子质粒
  •     2.2.4 通过杂交捕获EBV DNA
  • 3 EBV基因组组建
  •   3.1序列匹配
  •   3.2从头组装
  • 4展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 赖永静,夏巍,杜龙,王梦琳,冯清源,戢克铜,唐翔龙,唐安洲

    关键词: 病毒,全基因组测序,测序,综述

    来源: 中国病原生物学杂志 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,基础科学

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 广西医科大学第一附属医院,广西区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(No.81560486),广西科技攻关项目(桂科攻14124003-2)

    分类号: R373

    DOI: 10.13350/j.cjpb.190425

    页码: 485-490

    总页数: 6

    文件大小: 167K

    下载量: 242

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