CYP2C19基因多态性PCR扩增体系的正交优化与验证

论文摘要

本实验通过建立CYP2C19*2、*3和*17基因多态性PCR反应体系和条件,筛选出4μL体系中各因素最佳水平。采用SNaPshot技术对CYP2C19基因3个SNP位点*2、*3和*17同时进行复合扩增检测,利用L9(34)正交实验设计,对影响PCR反应体系和条件的3个因素(PCR Mix, Taq DNA聚合酶,循环次数)在3个水平上进行优化,结果采用综合评分法和极差分析法进行分析。用3组已知样本对正交优化所得条件进行重复性和稳定性验证。结果表明CYP2C19*2、*3和*17基因PCR扩增体系的影响因素依次为:PCR Mix>循环数>Taq DNA聚合酶。最佳反应体系为PCR Mix 2.0μL、Taq DNA聚合酶0.2μL、循环次数32次。3组样本验证效果满意。优化的CYP2C19*2、*3和*17基因PCR反应体系稳定性高,重复性和经济性较好,为该基因多态性的大规模调查奠定了基础。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王梅,赵晨迪,胡忠良,廖忠意,黄江,吴敬杰

关键词: 正交设计,体系,体系优化,基因多态性

来源: 基因组学与应用生物学 2019年05期

年度: 2019

分类: 基础科学,医药卫生科技

专业: 生物学

单位: 贵州医科大学法医学院,贵州警察学院司法鉴定中心

基金: 国家留学基金(CSCNO.201708525089),贵州省优秀科技教育人才省长专项资金(200758),贵州警察学院院级课题(16ZKYB01)共同资助

分类号: Q78

DOI: 10.13417/j.gab.038.001990

页码: 1990-1996

总页数: 7

文件大小: 1146K

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