丹江口库区库滨带植被土壤细菌群落多样性及PICRUSt功能预测分析

丹江口库区库滨带植被土壤细菌群落多样性及PICRUSt功能预测分析

论文摘要

微生物是土壤元素生物地球化学循环的主要驱动力,目前库滨带植物截留和消减污染物质过程中细菌群落及其功能研究尚未清楚.本研究选取适宜丹江口库区库滨带生长的4种典型植物(草本植物香根草、芦苇、乔木植物杜梨和灌木植物假奓包叶),采用16S r DNA Miseq高通量测序技术研究根际细菌群落组成,发现其主要由变形菌门、拟杆菌门、放线菌门等31个门、343个属的细菌组成,表现出群落组成的丰富性.细菌群落分析表明香根草和芦苇细菌群落结构较为相似,但和杜梨细菌群落结构差异最大.PICRUSt功能预测分析表明,库滨带植物根际细菌主要涉及次生产物代谢的生物合成、转录、多糖生物合成和代谢、细胞生长和死亡等38个子功能,表现出功能上的丰富性.库滨带植物根际细菌代谢能力整体趋势为假奓包叶>芦苇>香根草>杜梨.本研究初步探讨了丹江口库区库滨带不同植物根际细菌群落和功能,为丹江口水库库滨带植被构建及其水环境保护提供了参考依据.

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品采集与理化指标测定
  •   1.2 样品总DNA提取
  •   1.3 高通量测序
  •   1.4 数据分析
  •     1.4.1 高通量数据分析
  •     1.4.2 PICRUSt功能预测分析
  •     1.4.3 统计分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 丹江口库区库库滨带植物根际土壤理化性质
  •   2.2 不同植物根际细菌群落结构分析
  •     2.2.1 高通量测序结果及多样性的评估
  •     2.2.2 细菌群落组成及Beta多样性分析
  •     2.2.3 不同样品差异细菌分析
  •   2.3 PICRUSt功能预测分析
  • 3 讨论
  •   3.1 丹江口库区库滨带植物根际细菌群落
  •   3.2 库滨带植物根际细菌功能预测分析
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 孙峰,田伟,张菲,陈彦,任学敏,庞发虎,李玉英,姚伦广,陈兆进

    关键词: 丹江口水库,库滨带,细菌群落组成,高通量测序,分析

    来源: 环境科学 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学,环境科学与资源利用

    单位: 南阳师范学院农业工程学院南水北调中线水源区水安全河南省协同创新中心,环境保护部南京环境科学研究所,南阳师范学院生命科学学院

    基金: 国家自然科学基金项目(41601332),河南省科技攻关计划项目(172102110259,182102110468),河南省教育厅高等学校重点科研项目(16A210012),河南省南水北调中线水源区水生态安全创新型科技团队专项(17454)

    分类号: X53;X172

    DOI: 10.13227/j.hjkx.201805086

    页码: 421-429

    总页数: 9

    文件大小: 5016K

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