产β-1,3—葡聚糖酶放线菌的分离及酶基因克隆表达

产β-1,3—葡聚糖酶放线菌的分离及酶基因克隆表达

论文摘要

β-1,3-葡聚糖酶是降解β-1,3-葡聚糖产生具备药理活性的β-葡聚糖寡糖的有效酶工具。茯苓中多糖水解成寡糖具有抗肿瘤及免疫调节活性,利用β-1,3-葡聚糖酶可水解茯苓中β-1,3-糖苷键为主链的可溶性或不可溶性多糖,形成寡糖进而促进生物活性。因此,筛选产β-1,3-葡聚糖酶菌株、研究β-1,3-葡聚糖酶降解茯苓多糖的应用具有一定的意义与价值。论文基于高通量测序技术的应用,调查了土样中微生物群落的分布及多样性;从土样中分离分泌葡聚糖酶的菌株并鉴定;利用分子手段获得β-1,3-葡聚糖酶探究了其对茯苓多糖的降解;取得了以下主要结论:(1)高通量测序数据的分析结果显示,茯苓培植土(FTL1)中放线菌门(Actinobacteria)所占比例为18.64%,其丰度仅次于变形杆菌门(Proteobacteria),且放线菌门中链酶菌属(Streptomyces)和节杆菌属(Arthrobacter)各占比为1.90%和0.78%。因此本研究确定从FTL1筛选降解β型葡聚糖放线菌。(2)选用相应的筛选培养基,从FTL1中分离了58株放线菌,其中11株具有β-1,3-葡聚糖酶活性。首次发现和报道了来自北里孢菌属(Kitasatospora)菌株SYBCQL具有β-1,3-葡聚糖酶活性。来自链酶菌属的菌株SYBC17产酶活力最高,为1.02 U·mg-1。应用菌株SYBC17发酵了茯苓,最佳发酵时间为96 h,此时SYBC17对茯苓中多糖的降解效果最好。(3)克隆和分析了菌株SYBC17的两个编码β-1,3-葡聚糖酶的基因17-W和17-Q,菌株SYBCQL的基因QLK1,在分子水平验证了分离的菌株产β-1,3-葡聚糖酶。重组酶QLK1,17-W和17-Q的酶活性分别为65.82 U·mg-1,132.90 U·mg-1和14.70 U·mg-1。重组酶17-W产率最高。(4)生物信息学分析显示,三个酶蛋白全为糖苷水解酶家族16,分别由一个催化结构域及一个碳水化合物结构域组成,其中QLK1与17-W的碳水化合物结构域为CMB13,而17-Q对应结构域为CMB6。三个同源建模的酶蛋白与β-葡寡糖四糖成功实现分子对接,β-葡寡糖四糖均出现在催化活性中心的底物结合区。(5)酶学性质研究发现,QLK1的最适温度是60°C,17-W和17-Q的最适作用温度均为55°C。QLK1和17-Q的最适pH是5.5,而17-W的最适pH是6.0,三个酶的热稳定性和pH稳定良好;三个重组酶对底物的亲和力由大到小的排序依次是17-W、QLK1、17-Q。(6)TLC分析重组酶对茯苓多糖的降解作用显示,重组酶17-W降解后主要产生两种类型的寡糖,17-Q降解后主要产生三种类型的寡糖。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 绪论
  •   1.1 β-1,3-葡聚糖酶
  •     1.1.1 β-1,3-葡聚糖酶的来源及分类
  •     1.1.2 β-1,3-葡聚糖酶的三级结构
  •     1.1.3 产β-1,3-葡聚糖酶微生物的筛选
  •     1.1.4 β-1,3-葡聚糖酶的异源表达
  •     1.1.5 β-1,3-葡聚糖酶的应用
  •   1.2 茯苓中多糖
  •   1.3 高通量测序在菌落筛选中的应用
  •   1.4 分子模拟在酶与底物对接中的应用
  •     1.4.1 同源建模构建蛋白酶三维结构
  •     1.4.2 分子对接对酶与底物的作用预测
  •   1.5 论文的立题依据及目的意义
  •   1.6 论文研究内容
  • 第二章 材料与方法
  •   2.1 实验材料
  •     2.1.1 菌株和质粒
  •     2.1.2 实验试剂
  •     2.1.3 仪器
  •     2.1.4 培养基
  •     2.1.5 溶液的配置
  •   2.2 实验方法
  •     2.2.1 土样采集
  •     2.2.2 高通量测序及菌多样性分析
  •     2.2.3 β-1,3-葡聚糖酶活力测定
  •     2.2.4 发酵液的残糖浓度测定
  •     2.2.5 蛋白质含量的测定
  •     2.2.6 β-1,3-葡聚糖降解菌的筛选步骤
  •     2.2.7 菌种鉴定
  •     2.2.8 基因组及所需质粒的提取
  •     2.2.9 引物的设计
  •     2.2.10 目的基因的扩增及载体的构建
  •     2.2.11 重组菌株的诱导表达
  •     2.2.12 重组酶纯化
  •     2.2.13 重组酶酶学性质研究
  •     2.2.14 β-1,3-葡聚糖酶对茯苓中多糖的作用
  •     2.2.15 重组酶序列及结构分析
  •     2.2.16 β-1,3-葡聚糖重组酶与寡糖对接
  • 第三章 结果与讨论
  •   3.1 土样的细菌群落组成
  •     3.1.1 土样的细菌丰度指数
  •     3.1.2 土样的群落多样性
  •     3.1.3 产β-1,3-葡聚糖酶微生物在FTL1中的分布
  •   3.2 菌种筛选结果
  •     3.2.1 初筛的产β-1,3-葡聚糖酶放线菌
  •     3.2.2 产β-1,3-葡聚糖酶放线菌的菌株鉴定
  •     3.2.3 产酶菌株的酶活力
  •     3.2.4 摇瓶发酵曲线
  •   3.3 重组蛋白的构建及诱导表达
  •     3.3.1 基因的克隆和分析
  •     3.3.2 重组酶的表达及纯化
  •   3.4 酶与底物的结合结构
  •     3.4.1 β-1,3-葡聚糖酶的同源建模结构
  •     3.4.2 重组酶与底物的分子对接结果
  •   3.5 重组酶的酶学性质
  •     3.5.1 温度及pH的影响
  •     3.5.2 动力学参数
  •     3.5.3 酶的底物特异性
  •   3.6 茯苓多糖的降解
  • 主要结论与展望
  •   主要结论
  •   展望
  • 致谢
  • 参考文献
  • 附录:作者在攻读硕士期间发表的论文
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 吴秋兰

    导师: 廖祥儒

    关键词: 葡聚糖酶,高通量测序,基因克隆及表达,放线菌

    来源: 江南大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 生物学,生物学,一般化学工业

    单位: 江南大学

    分类号: Q78;TQ920.1

    总页数: 52

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