论文摘要
目的筛选与评价适用于云南草果居群的DNA条形码。方法以云南省草果种质资源为样本对ITS、psbA-trnH、matK、rbcL和ycf15条DNA条形码常用序列进行筛选与评价,并对草果居群进行扩增,测序,测序序列用Genestar进行拼接,然后用Mega进行数据处理,并对草果多样性及其鉴定进行分析。结果引物ITS5和ITS4对草果的扩增片段长度大约为520 bp;rbcLa-F和rbcLa-R对草果的扩增片段长度大约为498 bp;引物ycf1-bF和ycf1-bR对草果的扩增片段长度大约为800 bp;引物psb A-trn H-1F和psbA-trnH-1R对草果的扩增片段长度大约为400 bp;引物matK-2F和matK-2R对草果的扩增片段长度大约为470 bp。扩增及测序的成功率均较高,结果大多可用。通过对草果ITS、psb A-trnH、matK和ycf1序列的扩增结果进行分析,草果与其他豆蔻属植物都可以被清晰地区分开;ITS序列所有样本分为MG5白花草果居群和其他居群;psb A-trn H序列所有样本分为MG5白花草果居群,MG6黄花草果居群和其他居群;matK序列所有样本分为MG6黄花草果居群和其他居群,MG5白花草果样本扩增失败;ycf1序列所有样本分为MG6黄花草果居群和其他居群,MG5白花草果居群与其他22个草果居群聚为一支;rbcL序列对所有样本的扩增均一致。结论 ITS、matK、psb A-trn H及ycf1序列均能将草果与其他同属植物进行准确区分;MG6的matK、psbA-trnH及ycf1序列发现了序列位点的变异,为草果品种的选育做出贡献。ITS和psb A-trn H序列可将黄花和白花草果序列区分开;草果白花黄花所有样本rbcL序列无任何变异,且用rbcL序列无法鉴别草果与其他同属植物,可将其舍去。
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 胡一凡,张雪梅,石乃星,杨志清
关键词: 草果,遗传多样性,亲缘关系,条形码,序列
来源: 中草药 2019年24期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技,农业科技
专业: 农作物
单位: 云南农业大学农学与生物技术学院,云南农业大学云南省药用植物生物学重点实验室,云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心
基金: 国家自然科学基金项目：草果居群的分子鉴定及种质资源评价(81560615),云南省社会发展科技计划项目：云南草果种植加工关键技术研究与示范(2011CG015),云南省科技计划项目：云南省芳香生物工程技术研究中心建设(2018DH010)
分类号: S567.239
页码: 6091-6097
总页数: 7
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