DNA修复基因多态性在年龄相关性白内障发病机制中的作用

DNA修复基因多态性在年龄相关性白内障发病机制中的作用

论文摘要

目的研究XPD10基因的突变与年龄相关性白内障(age related cataract,ARC)发病的关系。方法研究对象为214例ARC患者和185例正常健康对照者。所有受试者收集12 mL外周血样本,提取DNA后利用连接酶检测反应(LDR)技术进行SNP分型,卡方检验鉴定有意义的SNP位点。Swissmodel软件建立SNP位点改变前后XPD10蛋白的3D模型,了解SNP位点突变对蛋白的影响,定点到蛋白的功能。结果在214例ARC及皮质混浊型患者中,XPD10基因rs1799793与正常对照人群相比,有统计学意义的突变位点。rs1799793位点的突变会导致XPD10基因在编码区发生了Asp-312-Asn(GAC→AAC)的错义突变。蛋白建模发现XPD10基因在编码区发生了Asp-312-Asn(GAC→AAC)的错义突变所引起的蛋白三维结构的改变进行分析。XPD10基因编码区原Asp氨基酸所在的区域有6个碳原子所组成的共价键。当GAC→AAC发生后,原Asp成为了Asn,可以看到原来的6个碳原子变成了5个碳原子,并且与原来相比,少了一个共价键。这种结构上的改变引起了XPD10蛋白空间位置发生了改变,从而难以发挥酶的催化性。结论在中国东北汉族人群中,XPD10基因单核苷酸多态性rs1799793位点与ARC的发病有关。

论文目录

  • 1 资料与方法
  •   1.1 受试者病史的采集
  •   1.2 血样采集和DNA分离
  •   1.3 SNP基因分型
  •   1.4 统计学分析
  •   1.5蛋白3D结构改变分析
  • 2结果
  •   2.1受试者基本情况统计结果
  •   2.2 SNP位点基因型频率和等位基因频率分布
  •   2.3 不同白内障亚型患者SNP位点基因型频率和等位基因频率分布
  •   2.4 XPD10基因SNP位点rs1799793的3D蛋白结构改变
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王林,王钧蔚,侯颖

    关键词: 年龄相关性白内障,修复基因,基因多态性

    来源: 哈尔滨医科大学学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 眼科与耳鼻咽喉科

    单位: 哈尔滨医科大学附属第一医院眼科医院

    基金: 国家自然科学基金青年科学基金项目(81700818),黑龙江省博士后科研启动基金(LBH-Q15105),哈尔滨医科大学附属第一医院科研创新基金(2017B016),黑龙江省教育厅科技项目(12541439)

    分类号: R776.1

    页码: 612-617

    总页数: 6

    文件大小: 3064K

    下载量: 20

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