长双歧杆菌婴儿亚种的快速区分

长双歧杆菌婴儿亚种的快速区分

论文摘要

为建立一种有效、快速、低成本区分长双歧杆菌婴儿亚种的方法,对13株基因组测定的长双歧杆菌构建了基于同源基因的系统进化树,确认其中7株为长亚种,5株为婴儿亚种,1株为猪亚种。通过碳水化合物利用谱比较和特异性基因扩增的手段确认可有效用于快速区分长双歧杆菌婴儿亚种的方法。结果显示,同一亚种的菌株利用同一种碳水化合物的能力存在差异,表明无法根据碳水化合物的利用来区分长双歧杆菌的不同亚种;长双歧杆菌长亚种糖激酶基因和长双歧杆菌婴儿亚种唾液酸酶基因可有效用于长双歧杆菌婴儿亚种的快速区分,并用该方法对40株长双歧杆菌进行了亚种确认,其中5株为长双歧杆菌婴儿亚种。后随机选择了其中的4株菌进行基因组草图测序,经系统进化树构建,确认为长双歧杆菌婴儿亚种,并进一步证实特异性基因扩增可实现长双歧杆菌婴儿亚种的快速区分。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与试剂
  •     1.1.1 实验菌株
  •     1.1.2 培养基与试剂
  •   1.2 仪器与设备
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 系统发育树的构建
  •     1.3.2 菌株的活化
  •     1.3.3 碳水化合物利用能力比较
  •     1.3.4 不同亚种的特异性基因分析
  •     1.3.5 长双歧杆菌菌株的亚种确认
  • 2 结果与分析
  •   2.1 13株已测基因组菌株的亚种确认
  •   2.2 不同长双歧杆菌碳水化合物利用能力比较
  •   2.3 不同亚种的特异性基因分析
  •   2.4 长双歧杆菌婴儿亚种的确认
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李明洁,杨波,赵建新,张灏,陈卫

    关键词: 长双歧杆菌,亚种,区分,碳水化合物利用,特异性基因扩增

    来源: 食品与发酵工业 2019年18期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 江南大学食品学院

    基金: 国家自然基金(31771953,31820103010),江苏高校品牌专业建设工程项目(PPZY2015A052),BINC营养与护理研究基金(BINCMCF1201)

    分类号: Q93-33

    DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.021111

    页码: 43-49

    总页数: 7

    文件大小: 1507K

    下载量: 165

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