基于Miseq测序的长江中游枯水季水体菌群结构

基于Miseq测序的长江中游枯水季水体菌群结构

论文摘要

采用基于16S rRNA基因的Illumina Miseq测序方法,对长江中游枯水季冬季的水质及水体细菌群落多样性进行系统分析。研究发现,所测长江水段当季属于《地表水环境质量标准》(GB 3838—2002)Ⅲ类水。长江中菌群多样性高,变形菌门(Proteobacteria,44. 9%)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria,32. 9%)以及丛毛单胞菌科(Comamonadaceae,30. 6%)分别在门、纲、科上为优势菌。除此之外,长江水体中大量的优势菌科与生物除氮相关,其中具有好氧反硝化功能的丛毛单胞菌科(Comamonadaceae)相对丰度最大,对于控制水体中氮素的污染指标,促进水体自净修复有积极的作用。PICRUSt功能预测分析表明水体中菌群在碳水化合物代谢和氨基酸代谢方面功能最强。在菌种关联网络中,拟杆菌属(Bacteroides)、黄杆菌属(Luteolibacter)、Pseudarcicella等在共存网络菌群中具有正相关的关系,可以抑制微囊藻的生长。研究揭示了长江枯水季的水质与其微生物群落结构的内在关系,可以为长江枯水季饮用水源地水质安全保障提供理论依据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品采集处理及水质分析方法
  •   1.2 DNA提取及Miseq测序
  •   1.3 测序结果分析
  • 2 结果
  •   2.1 典型水质指标
  •   2.2 样品测序可操作分类单元划分及菌群多样性分析
  •   2.3 细菌群落的物种分布及功能预测
  •   2.4 关联网络分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 梁杰超,季斌,陈威,宋宏娇,姚嘉雄,龚喜平,肖曹帆,刘扬

    关键词: 长江,枯水季,水质,微生物多样性,丛毛单胞菌,黄杆菌属

    来源: 科学技术与工程 2019年14期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅱ辑,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 武汉科技大学城市建设学院

    基金: 长江水利委员会长江科学院开放研究基金(CKWV2018490,KY),湖北省自然科学基金(2017CFB350)资助

    分类号: Q938.8

    页码: 84-89

    总页数: 6

    文件大小: 392K

    下载量: 99

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