浙江省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因的遗传变异分析

浙江省猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因的遗传变异分析

论文摘要

为了解2014-2016年浙江地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)ORF5基因变异情况,试验通过RT-PCR方法对从浙江省各地区采集的PRRSV阳性病料进行ORF5基因扩增,应用DNAStar和Mega 5.1软件对所测序列进行同源性和遗传变异分析。结果显示,54株2014-2016年浙江分离株ORF5序列之间核苷酸和氨基酸序列同源性分别为83.1%~100%和80.6%~100%,与经典株VR2332核苷酸和氨基酸序列同源性分别为83.8%~90.4%和81.6%~90.0%,与高致病PRRSV毒株JXA1核苷酸和氨基酸序列同源性分别为83.5%~99.5%和83.1%~99.0%。系统进化分析表明,54个毒株均为美洲型毒株,属于Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ3个不同的基因亚型,其中基因亚型Ⅲ和Ⅳ毒株是浙江省近年来新出现的毒株。氨基酸序列分析结果显示,54个毒株在GP5蛋白的信号肽区域、非中和抗体表位的氨基酸序列变异较大,而在中和表位氨基酸序列变异较小。本研究结果表明,浙江地区PRRSV流行出现了新形势,多种基因亚型共同存在,其中以基因亚型Ⅰ毒株为主。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 病料采集和处理
  •   1.3 引物设计与合成
  •   1.4 PRRSV ORF5基因的扩增与测序
  •   1.5 PRRSV ORF5基因片段的克隆与鉴定
  •   1.6 ORF5基因序列和抗原位点分析
  • 2 结 果
  •   2.1 PRRSV ORF5基因RT-PCR扩增结果
  •   2.2 ORF5基因同源性分析
  •   2.3 ORF5基因系统进化树
  •   2.4 PRRSV ORF5氨基酸分析
  • 3 讨 论
  • 4 结 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王雅婷,柴娟,张红丽,刘霞,虞一聪,倪柏锋,赵灵燕,徐辉,谢荣辉

    关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒,基因,遗传变异

    来源: 中国畜牧兽医 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 浙江省动物疫病预防控制中心

    基金: 浙江省公益技术研究项目(2017C32016),浙江省“三农六方”科技协作项目

    分类号: S852.651

    DOI: 10.16431/j.cnki.1671-7236.2019.12.031

    页码: 3715-3724

    总页数: 10

    文件大小: 5283K

    下载量: 74

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