谷氨酸棒状杆菌CRISPR-Cpf1/ssDNA基因组编辑系统优化

谷氨酸棒状杆菌CRISPR-Cpf1/ssDNA基因组编辑系统优化

论文摘要

谷氨酸棒状杆菌作为重要的微生物细胞工厂,基因组修饰已经成为调节目标代谢物的首要途径。为了提高基因定点突变的编辑效率,建立了高效省时的CRISPR-Cpf1/ssDNA基因组编辑系统。利用卡那霉素抗性作为筛选标记,构建了1株严谨的单链模式菌M-1,用于验证与统计编辑效率。首先,采用强启动子Ptuf,优化了切割效率;其次,利用重组酶Rec T和合理长度与添加量的ssDNA,优化了重组效率。实验结果显示:在启动子Ptuf和Rec T的双重作用下,采用滞后链(70 bp、12. 5μg)优化组合方式,使基因编辑效率提升至(80±5. 7)%。由Rec T介导的CRISPR-Cpf1/ssDNA基因组编辑系统可在很大程度上加快谷氨酸棒状杆菌代谢工程改造。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验材料
  •     1.1.1 菌种
  •     1.1.2 质粒
  •     1.1.3 引物信息
  •     1.1.4 主要仪器与设备
  •     1.1.5 主要试剂
  •     1.1.6 培养基
  •   1.2 实验方法
  •     1.2.1 质粒构建与转化
  •     1.2.2 谷氨酸棒状杆菌电转化法
  •     1.2.3 单链模式菌M-1的构建
  •     1.2.4 质粒的消除
  • 2 结果与分析
  •   2.1 构建单链模式菌
  •     2.1.1 选择卡那霉素抗性作为筛选标记
  •     2.1.2 验证单链模式菌M-1的KanR严谨性
  •   2.2 CRISPR-Cpf1/ss DNA系统基因组编辑流程
  •   2.3 优化CRISPR-Cpf1/ss DNA系统的切割致死作用
  •   2.4 优化CRISPR-Cpf1/ss DNA系统的重组作用
  •     2.4.1 RecT对ss DNA基因重组的影响
  •     2.4.2 优化ss DNA长度
  •     2.4.3 优化ss DNA添加量
  •   2.5 RecT介导的CRISPR-Cpf1/ss DNA基因编辑效率
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王婷,马洪坤,赵桂红,蔡柠匀,张德志,陈宁

    关键词: 谷氨酸棒状杆菌,优化,基因组编辑

    来源: 食品与发酵工业 2019年19期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 天津科技大学生物工程学院,代谢控制发酵技术国家地方联合工程实验室(天津科技大学),教育部工业发酵微生物重点实验室(天津科技大学),天津市微生物代谢与发酵过程控制技术工程中心

    基金: 国家重点研发计划(2018YFA0900304),工业微生物优良菌种选育与发酵技术公共服务平台项目(17PTGCCX00190)

    分类号: Q78

    DOI: 10.13995/j.cnki.11-1802/ts.021520

    页码: 1-7

    总页数: 7

    文件大小: 931K

    下载量: 236

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