类固醇激素降解菌筛选及其相关基因的研究

类固醇激素降解菌筛选及其相关基因的研究

论文摘要

类固醇激素,又称甾体类激素,它是一类四环脂肪烃化合物,具有环戊烷多氢菲母核。甾体类激素化合物广泛存在于动物的排泄物、地下水、地表水以及土壤中,它的挥发性差,在体内长时间累积会导致内分泌功能紊乱。生活用水中的类固醇激素污染问题甚至日益严重,并威胁到公众健康。然而传统的化学、物理的治理方法耗药量大、成本高,还有可能发生其他污染,所以对于类固醇激素的生物降解方法的研究具有重大意义。本文采用含有0.5 mM雌二醇的MS培养基从渔塘中分离得到一种新型革兰氏阴性菌Klebsiella sp.,这种细菌能够使用类固醇激素(如睾酮,雌二醇和甲睾酮等)作为唯一碳源和能源。经16S rRNA分析显示该细菌属于肠杆菌科的克雷伯氏菌属。通过一系列实验表明,该菌株在42℃,pH为6.0时生长良好;该菌是一种球杆菌,形态介于球形与杆形之间为短杆状,其尺寸为1.313μm×0.913μm;该菌在含有34μg/ml氯霉素或10μg/ml四环素的培养基中出现抑菌圈。而在100μg/ml氨苄青霉素、50μg/ml卡那霉素、10μg/ml链霉素和50μg/ml庆大霉素中可以正常生长,因此具有这四种相应抗生素抗性。高效液相色谱法(HPLC)检测其对雌二醇降解率为53.8%,对睾丸酮降解率为13.3%,对甲睾酮降解率为47.7%。同时本文对克雷伯氏杆菌进行了全基因组测序分析和转录组测序分析,获得414个显著上调基因和289个显著下调基因。这些相关基因中包括150种脱氢酶(短链脱氢酶等),59种调节蛋白(LysR家族,LuxR家族,LacI家族等),以及双加氧酶和醛固酮还原酶等。本文为类固醇激素降解微生物资源的研究和开发、环境污染物的生物修复和降解基因的研究和利用提供了理论依据和实验基础。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 绪论
  •   1.1 类固醇激素概况
  •   1.2 环境类固醇激素危害
  •   1.3 类固醇激素污染处理
  •   1.4 主要研究内容和意义
  •     1.4.1 主要研究内容
  •     1.4.2 研究意义及目的
  • 第二章 类固醇激素降解菌富集分离、筛选及鉴定
  •   2.1 实验材料及仪器
  •     2.1.1 实验样本来源
  •     2.1.2 实验试剂
  •     2.1.3 实验仪器
  •     2.1.4 试剂配制
  •   2.2 实验方法
  •     2.2.1 类固醇激素降解菌的富集培养
  •     2.2.2 类固醇激素降解菌的复筛
  •     2.2.3 16S rRNA分子生物学鉴定
  •   2.3 实验结果
  •     2.3.1 以类固醇激素作为唯一碳源分离纯化结果
  •     2.3.2 细菌基因组电泳结果
  •     2.3.3 PCR产物电泳结果
  •     2.3.4 TA克隆
  •     2.3.5 PCR鉴定结果
  •     2.3.6 16S rRNA-pMD18-T测序结果
  •     2.3.7 系统进化树
  •   2.4 结果与讨论
  •   2.5 小结
  • 第三章 类固醇激素降解菌降解能力测定
  •   3.1 实验材料
  •     3.1.1 实验试剂
  •     3.1.2 实验仪器
  •     3.1.3 试剂配制
  •   3.2 实验方法
  •     3.2.1 克雷伯氏菌降解率测定
  •     3.2.2 不同温度下的雌二醇降解率测定
  •   3.3 实验结果
  •     3.3.1 克雷伯氏菌在不同激素的降解率测定结果
  •     3.3.2 温度对降解率产生的影响
  •   3.4 结果与讨论
  •   3.5 小结
  • 第四章 类固醇激素降解菌生理特性
  •   4.1 实验材料
  •     4.1.1 实验试剂
  •     4.1.2 实验仪器
  •     4.1.3 试剂配制
  •   4.2 实验方法
  •     4.2.1 革兰氏染色
  •     4.2.2 透射电镜观察菌株形态
  •     4.2.3 生长曲线
  •   4.3 实验结果
  •     4.3.1 革兰氏染色
  •     4.3.2 透射电子电镜
  •     4.3.3 生长曲线
  •     4.3.4 抗菌谱
  •   4.4 结果与讨论
  •   4.5 小结
  • 第五章 类固醇激素降解菌全基因组测序及转录组测序
  •   5.1 实验材料及仪器
  •     5.1.1 实验试剂
  •     5.1.2 实验仪器
  •     5.1.3 试剂配制
  •   5.2 实验方法
  •     5.2.1 K5-3 总基因组提取
  •     5.2.2 K5-3 基因组电泳鉴定
  •     5.2.3 K5-3总RNA提取
  •     5.2.4 K5-3总RNA电泳鉴定
  •     5.2.5 全基因组测序
  •     5.2.6 转录组测序
  •   5.3 实验结果
  •     5.3.1 总基因组提取
  •     5.3.2 总RNA提取
  •     5.3.3 全基因组测序
  •     5.3.4 转录组测序
  •   5.4 结果与讨论
  •   5.5 小结
  • 第六章 总结
  • 参考文献
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 孙婷婷

    导师: 于源华,孟祥凯

    关键词: 类固醇激素降解菌,高效液相色谱法,全基因组测序,转录组测序

    来源: 长春理工大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 生物学,生物学,环境科学与资源利用

    单位: 长春理工大学

    分类号: X172;Q93

    总页数: 69

    文件大小: 2175K

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